| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,159,523 | T→C | 6.8% | F500S (TTC→TCC) | opuA → | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,159,523 | 0 | T | C | 6.8% | 213.6 / 3.0 | 73 | F500S (TTC→TCC) | opuA | glycine betaine ABC transporter ATP‑binding protein/permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (31/36); new base C (3/2); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.62e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.57e-01 | |||||||||||
GTGCGCACCGTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGATGTCATGCA > NC_002947/3159375‑3159670 | gTGCGCACCGTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTc < 2:477602/150‑1 (MQ=255) cGTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCTGCGCGCTGCTGGTCCGCTCGACTGCGTAAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTcgg < 2:2078357/150‑3 (MQ=255) cGTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTg < 1:465691/150‑1 (MQ=255) cGTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTg < 1:1411469/150‑1 (MQ=255) gTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTAGCTGGCCTGGCGCTCTGCGTGCGTGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTgg > 2:73260/1‑150 (MQ=255) gTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTgg < 1:2254121/150‑1 (MQ=255) gTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTgg < 1:86014/150‑1 (MQ=255) aaGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCCGGGAGCGTACGATTTcca > 2:1246617/1‑150 (MQ=255) aGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTccac < 2:1491312/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGGTCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCAt > 1:1914585/1‑150 (MQ=255) tggATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTc > 2:1114650/1‑150 (MQ=255) tggATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCCGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTc < 1:1246617/150‑1 (MQ=255) ttCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGtt < 2:556169/106‑1 (MQ=255) ttCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGtt > 1:556169/1‑106 (MQ=255) ttCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGCGCGTTCGCTTTGCTCTCTCGGTCTGCTCGgcc > 2:1662877/1‑149 (MQ=255) gTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTTCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTc < 1:856183/150‑1 (MQ=255) gTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTc > 1:179511/1‑150 (MQ=255) gTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTc > 1:68856/1‑150 (MQ=255) ggCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGc > 2:689902/1‑114 (MQ=255) ggCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGGTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGc < 1:689902/114‑1 (MQ=255) cGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGtgc > 1:2073367/1‑150 (MQ=255) ggTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGtgct < 1:873698/150‑1 (MQ=255) gTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGtgctg < 2:1357349/150‑1 (MQ=255) gTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGtgctg < 2:1671337/150‑1 (MQ=255) cgcTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCgc < 1:1114650/150‑1 (MQ=255) ttGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCgctgc > 2:203245/1‑150 (MQ=255) ttGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCgctgc < 2:1890971/150‑1 (MQ=255) gTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGc > 1:2016462/1‑150 (MQ=255) tCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCGGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCa < 2:507691/150‑1 (MQ=255) tACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCAtt > 2:1826783/1‑150 (MQ=255) aCCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTc < 1:1826783/150‑1 (MQ=255) cctggcctggCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTccacc > 1:1461426/1‑100 (MQ=255) cctggcctggCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTccacc < 2:1461426/100‑1 (MQ=255) cctggcctggCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTcc > 2:1495870/1‑150 (MQ=255) ctggcctggcGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTc < 1:51643/131‑1 (MQ=255) ctggcctggcGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTc > 2:51643/1‑131 (MQ=255) ctggcctggcGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTccc < 1:1434455/150‑1 (MQ=255) tggcctggcGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCa > 2:1769756/1‑150 (MQ=255) cctggcGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCg > 1:554770/1‑150 (MQ=255) tggcGCTCCGCCTGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCAc < 2:241826/146‑1 (MQ=255) tggcGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCAc > 1:241826/1‑146 (MQ=255) gcTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTCCGGTTTCTgg > 1:2108218/1‑71 (MQ=255) gcTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTCCGGTTTCTgg < 2:2108218/71‑1 (MQ=255) gcTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTCCGGTTTCTgg < 2:2108139/71‑1 (MQ=255) gcTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTCCGGTTTCTgg > 1:2108139/1‑71 (MQ=255) cTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGTCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCAttct > 2:972077/1‑150 (MQ=255) ctctggCGAGATCCGTGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATtcttct < 2:132628/146‑1 (MQ=255) cgccgGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGtgctg > 2:753780/1‑112 (MQ=255) cgccgGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGtgctg < 1:753780/112‑1 (MQ=255) gcgcGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTgg < 2:680861/147‑1 (MQ=255) gcgcGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTgg > 1:680861/1‑147 (MQ=255) gcgcGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTgagat > 1:132628/1‑146 (MQ=255) cgcgATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCaa > 1:1539315/1‑150 (MQ=255) aTCCTGGCTCTGACGACTGCGTTAGGCCTGGGGTATATCGGCCGGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCgg < 1:2015205/150‑1 (MQ=255) cTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCggaaa > 2:1799866/1‑147 (MQ=255) cTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGgcg > 2:378671/1‑150 (MQ=255) ggCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCt < 1:203245/150‑1 (MQ=255) cccTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGACCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTATACCATCGTTCTTGTGTTCGCGTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTgg > 2:852653/1‑150 (MQ=255) gacgacTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGTCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCg < 1:972077/150‑1 (MQ=255) gacgacTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGTGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCg < 1:1662877/150‑1 (MQ=255) gacgacTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCg < 1:1769756/150‑1 (MQ=255) cGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTgg < 2:838394/66‑1 (MQ=255) cGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTgg > 1:838394/1‑66 (MQ=255) ttAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTc > 1:1058827/1‑150 (MQ=255) aGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCAc > 1:1511298/1‑150 (MQ=255) gCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCAcg < 2:1539315/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGTATATCGGGCTGTAAAGTTTGTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACTGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCAcgcc > 2:735400/1‑150 (MQ=255) tataTCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCTCTTGGTCACGCCGCTGTTg < 1:73260/150‑1 (MQ=255) atCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGAt > 1:2329002/1‑150 (MQ=255) cGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGATGt < 2:1914585/150‑1 (MQ=255) gCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTAAAGTGCATCTGTCGCTGCGTAGCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGATGTCa > 1:1453552/1‑150 (MQ=255) ccTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATtcttct < 2:32200/99‑1 (MQ=255) ccTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATtcttct > 1:32200/1‑99 (MQ=255) tGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTCCTGGCCGAGCGGCCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGATGTCATGc < 1:1799866/150‑1 (MQ=255) gTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGATGTCATGCa < 2:554770/150‑1 (MQ=255) | GTGCGCACCGTCATCAATGGCGTCGAAGGTGCGCTGGGCTGGATTCCGTGGCCGGTACCGGCGCTTGCATTGGTCTACCTGGCCTGGCGCTCCGCCGGCGCGATCCTGGCCCTGACGACTGCGTTAGCCCTGGGGTATATCGGCCTGTTCGGTTTCTGGGAGCGTACGATTTCCACCATCGCTCTGGTCGGCGCTTCGGTGCTGCTGTCGCTGCTGATCGGCATTCCCACCGGCATTCTTCTGGCCAAGCGGGCGCTGGCTCGGCGCTTGGTCACGCCGCTGTTGGATGTCATGCA > NC_002947/3159375‑3159670 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |