| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,287,320 | G→A | 12.2% | intergenic (+18/+23) | PP_2889 → / ← xthA | transmembrane regulator PrtR/exodeoxyribonuclease III/apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease VI |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,287,320 | 0 | G | A | 12.2% | 170.8 / 15.1 | 74 | intergenic (+18/+23) | PP_2889/xthA | transmembrane regulator PrtR/exodeoxyribonuclease III/apurinic/apyrimidinic endodeoxyribonuclease VI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/30); new base A (7/2); total (42/32) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.84e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.39e-01 | |||||||||||
GCAGCGGGTCGATGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCG > NC_002947/3287176‑3287468 | gCAGCGGGTCGATGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGtgtgagatc > 1:1731156/1‑145 (MQ=255) ggggggTCGAGGGGGAGGTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCGTTGGTCAGCGCGGCGGGCGATGGGCGTGGGGGGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTg < 1:1816806/147‑1 (MQ=255) gCGGGTCGATGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGATGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGCACACCTTgg > 1:604330/1‑150 (MQ=255) cGGGCCGACGGCCAGCGGGAGGCGCGGTACTGGTGGCATGGGGCTTATTACGTGGCCTTGGGGAGCGCGGCGGACGATGTGGGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGCACACCTTggg < 2:604330/150‑1 (MQ=255) ggTGGATGGCCGGCGGGGGGCGCGGTACTGGTGGCATGGGGCTTATAACTTGGGCTGGGGCGGCGGGGGGGAGGGTGTGGGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGcc < 2:271227/150‑1 (MQ=255) gtggATGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCGTGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCGGCGGGGCGGAGGGTGTGGGGGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGccc < 2:1392139/147‑1 (MQ=255) gATGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTc > 1:1863557/1‑150 (MQ=255) cgctcgaGCTGTGGGCGCGGTACGGGCCGCATGGGGCTTATAACTTGGCCTGGGGCGGGGCGGGGGACGAGGGGCGGGGGGCGGGGGCGCGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCa < 1:1841249/144‑1 (MQ=255) aTGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTCAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCa > 2:295161/1‑150 (MQ=255) cggCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGAGAGCACATTGGCCCCGTCAc > 2:721501/2‑150 (MQ=255) gCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCAccc > 2:151591/1‑150 (MQ=255) gCTGGAGGCGCGGTACGGGTCGAATGGGGCTTATAACGTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGGGGGTGGGGGGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAAt < 2:1877758/150‑1 (MQ=255) ggcgGTACTGGTCGTAGGGGGCTTATAACTTGGCCTTGGTGAGCGGGGGGGAGGGTGGGCGTGGGGGGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCaa < 2:1391199/149‑1 (MQ=255) tagtggtggCAGGGGGCTTATAACTTGGCTTTGGTCGGGGGGGGGGAGGATGTGGGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTcca < 2:1323453/147‑1 (MQ=255) tACTGGTCGGATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTGAGGGCGGGGGAGGATGGGGGGGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTcca < 2:1324192/150‑1 (MQ=255) ttGGTCGTATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATTTGCGTGGGGGGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTccagc < 2:1863557/149‑1 (MQ=255) ggTGGCATGGGGCGTATCACTTGCCGTTGGGCAGGGCGGCGGGTGGTGGGGGTGGGGGGGGGGGGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTccagcca < 2:1022053/150‑1 (MQ=255) aTGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCGCGTCACCCTAATCAGCTCAACTACAGCTACATcag > 2:252658/1‑148 (MQ=255) gCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTGACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCAt > 2:547681/1‑150 (MQ=255) tataACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGt > 1:2055475/1‑150 (MQ=255) caccTTGGCCTGGGGGAGCGGGGGGGACGGGGTGCGGGGGGGGACGGCCGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTcc < 1:1422908/147‑1 (MQ=255) ccTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCtt > 2:2064826/1‑150 (MQ=255) ccTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCtt > 1:796313/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCttt > 2:1454269/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCttt > 1:1259053/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGCGTGCGCGCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCttt > 2:1615576/1‑150 (MQ=255) tCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCAt > 1:51030/1‑150 (MQ=255) gggcggggGACGTGGGGGGTGGGGCGGGGGTGGGGCAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACGCCAGTGAGTTCGGCGCATGGTCCGACTGCTTTTCCATc‑cc < 1:1615576/148‑1 (MQ=255) ggACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGc > 1:1533173/1‑150 (MQ=255) aCGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGGGCACCTTGGGCCCGTCACGCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCGTGGTGCGACGGCTTTGCCATC‑CCGCGCAGCta > 2:1654268/1‑149 (MQ=255) tgtgGGTGTGGCGGGGGGTGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCACATGGGGTGTATCTTGGTCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCCGCAAGCTCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAg < 1:2280687/150‑1 (MQ=255) gTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCAc < 2:1259053/150‑1 (MQ=255) gggCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCAc < 2:484959/147‑1 (MQ=255) gggCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCAc > 1:484959/1‑147 (MQ=255) ggCGGGGGGGGGGGAGTGGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGccc < 1:1654268/150‑1 (MQ=255) cGGGGTTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGCGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGc > 1:1709548/1‑150 (MQ=255) cGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGc > 1:1872542/1‑150 (MQ=255) ggTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGcc > 1:1461964/1‑150 (MQ=255) gTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCt < 2:1461964/150‑1 (MQ=255) ggAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATc > 2:163344/1‑67 (MQ=255) ggAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATc < 1:163344/67‑1 (MQ=255) ggAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATg > 2:1452348/1‑150 (MQ=255) aGGCGTTGAGGTTGGGCTTGTAAGTGTGCGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCACAAATCCAGCCGGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCACTGCCATCATgcc > 2:195347/1‑149 (MQ=255) cGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCAGCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCgg < 1:721501/150‑1 (MQ=255) tttGATGTTGGGGTTGTAAGTGTGGTCCCCAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCCCCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGc < 1:1792219/149‑1 (MQ=255) gTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGc > 2:587861/1‑150 (MQ=255) gTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGc < 1:587861/150‑1 (MQ=255) gTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGc > 1:1857443/1‑150 (MQ=255) gTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCttt < 1:1690719/96‑1 (MQ=255) gTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCttt > 2:1690719/1‑96 (MQ=255) gTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAgc > 1:1089015/1‑150 (MQ=255) gTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAgc > 1:971983/1‑150 (MQ=255) gTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCtgt > 1:127063/1‑150 (MQ=255) gTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCtgt < 2:1857443/150‑1 (MQ=255) ttGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCtgtg > 1:2173372/1‑150 (MQ=255) tAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAgctgct < 1:77155/144‑1 (MQ=255) tAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAgctgct > 2:77155/1‑144 (MQ=255) atctggCCCAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATATGCCGCTCCCTCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCAt < 1:635794/146‑1 (MQ=255) gtgGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATg > 2:2225411/1‑150 (MQ=255) gggCCCAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGG‑ATTCCAGTCACTGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGAt > 1:145059/1‑150 (MQ=255) ggCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCGCCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGCTCCGACGGCCTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATc < 2:821441/150‑1 (MQ=255) gCCCAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTGTGGG‑CCGAGAACGTCATAGGGCACGCCCGCTACATCGATGAGCGGCACCAGCGGCGGTGAGGCCATGATCa > 1:1796710/1‑150 (MQ=255) gCCCAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGagat > 2:635794/1‑147 (MQ=255) gCCCAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCa > 2:1501812/1‑150 (MQ=255) cccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATg > 2:237897/1‑145 (MQ=255) cccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATg < 1:237897/145‑1 (MQ=255) cccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAg < 2:51030/150‑1 (MQ=255) cccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAg > 1:1260774/1‑150 (MQ=255) cccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGATCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAg < 1:252658/150‑1 (MQ=255) cccAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTAATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAg > 1:2049042/1‑150 (MQ=255) ccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAg < 1:328484/149‑1 (MQ=255) ccAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAg > 2:328484/1‑149 (MQ=255) cAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGt > 2:1976874/1‑150 (MQ=255) cAAGGTGCACACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGt > 1:1199021/1‑150 (MQ=255) gtgtGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGAt < 1:2064826/150‑1 (MQ=255) gtgCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATgc < 2:2173372/150‑1 (MQ=255) tgCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGctgctg > 2:1569010/1‑126 (MQ=255) tgCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGctgctg < 1:1569010/126‑1 (MQ=255) tgCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATgcg > 1:878126/1‑150 (MQ=255) | GCAGCGGGTCGATGGCCAGCTGGAGGCGCGGTACTGGTCGCATGGGGCTTATAACTTTGCCTTGGTCAGCGCGGCGGACGATGTGCGTGGGGCGGGGGTGGGGGAGGCGTTGAGGTTGGGGTTGTAAGTGTGGGCCCAAGGTGTGCACCTTGGGCCCGTCACCCTAATCAGCTCAACTCCAGCCAGATCGGCGCATGGTCCGACGGCTTTTCCATC‑CCGCGCAGCTCATAGTCCACGCCCGCTGCCTTGATGCGCGGCACCAGCTGCTGTGAGGCCATGATCAGGTCGATGCG > NC_002947/3287176‑3287468 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |