| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,312,344 | A→C | 6.1% | D179A (GAC→GCC) | PP_2912 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,312,344 | 0 | A | C | 6.1% | 224.8 / 4.6 | 81 | D179A (GAC→GCC) | PP_2912 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (39/37); new base C (2/3); total (41/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.75e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.77e-01 | |||||||||||
GATGCGGCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGCTATGCGCAGG > NC_002947/3312196‑3312490 | gATGCGGCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTCCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGAc > 2:1790721/1‑150 (MQ=255) tGCGGCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACgg < 1:1790721/150‑1 (MQ=255) ggCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGc < 1:151003/149‑1 (MQ=255) ggCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGc > 2:151003/1‑149 (MQ=255) ggCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCGCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTGATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTCTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGcc < 2:523732/150‑1 (MQ=255) cccGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGGCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGt < 2:1243006/150‑1 (MQ=255) ccGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGTCCGGGCCgagc < 2:2095213/150‑4 (MQ=255) cgcgGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGa < 2:63512/150‑1 (MQ=255) cgacgTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGTTGATCATCGACCt > 1:110138/1‑150 (MQ=255) acacCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTTATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCgca < 2:1482741/150‑1 (MQ=255) acCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCTACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCgcagg < 1:1042625/150‑1 (MQ=255) cTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCgcaggca > 2:296689/1‑150 (MQ=255) tCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCgcaggcag > 1:645212/1‑150 (MQ=255) cGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGt < 2:895822/150‑1 (MQ=255) cGAAGCGGAGCATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGt < 1:691252/150‑1 (MQ=255) ggaTGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTAAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAgc > 1:1387398/1‑150 (MQ=255) tGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAgccgc < 2:73218/150‑1 (MQ=255) gcgTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCaacaac < 2:2275825/150‑1 (MQ=255) cACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGAt > 2:381772/1‑129 (MQ=255) cACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGAt < 1:381772/129‑1 (MQ=255) cACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGcc > 1:2303901/1‑150 (MQ=255) cACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGcc > 1:1371000/1‑150 (MQ=255) cACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGcc > 1:910127/1‑150 (MQ=255) aCGTCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTgg < 1:1755046/126‑1 (MQ=255) aCGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTgg > 2:1755046/1‑126 (MQ=255) cGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCtt < 2:645212/150‑1 (MQ=255) gCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTc > 1:2097648/1‑150 (MQ=255) ccTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCa < 2:2168115/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCa < 2:1405110/150‑1 (MQ=255) ccTTCGTCATTCGCCAGGACGTGCTGATGCTGTGCGCCGTAATGTTTCATGGCCACCTTTCCGAGCTAAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGACCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTcc > 2:191993/1‑149 (MQ=255) tCATTCGCCAGGTCGTCCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCAtgc > 1:1834330/1‑150 (MQ=255) ttCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCa > 1:617354/1‑141 (MQ=255) ttCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCa < 2:617354/141‑1 (MQ=255) gCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCAGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCAGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAgc > 2:1493564/1‑150 (MQ=255) cAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAgcgc > 1:1995605/1‑150 (MQ=255) tCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGAtg > 2:1829879/1‑150 (MQ=255) cGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGAtgt < 2:1214332/150‑1 (MQ=255) gTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGa < 1:787028/104‑1 (MQ=255) gTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGa > 2:787028/1‑104 (MQ=255) gATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGacaa < 2:1581405/150‑1 (MQ=255) gATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGAAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGAGCGATGTGGacaa > 1:1820556/1‑150 (MQ=255) aTGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGTCCGGGCCgagc > 2:917957/1‑69 (MQ=255) aTGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGTCCGGGCCgagc < 1:917957/72‑4 (MQ=255) cTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCAtgc < 1:1449314/127‑1 (MQ=255) cTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCAtgc > 2:1449314/1‑127 (MQ=255) cTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATg < 2:1585285/150‑1 (MQ=255) cTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGAAGGGCAGATGAGCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGAAGCCGCCAACAACCTTGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATg < 1:531254/150‑1 (MQ=255) tgtgCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATgg > 1:1649604/1‑150 (MQ=255) gcCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCGGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCAc > 2:1329251/1‑150 (MQ=255) cGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGcc < 1:2053777/109‑1 (MQ=255) cGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGcc > 2:2053777/1‑109 (MQ=255) aTGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTc < 2:438455/150‑1 (MQ=255) tGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGAAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCg < 2:1820556/150‑1 (MQ=255) gCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTAGGgcg > 2:251393/1‑150 (MQ=255) gACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGcc < 1:251393/150‑1 (MQ=255) cTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCg > 2:2116491/1‑150 (MQ=255) cTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCg < 1:2116491/150‑1 (MQ=255) tGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGa > 2:835335/1‑42 (MQ=255) tGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGa < 1:835335/42‑1 (MQ=255) cGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGc > 2:2106557/1‑141 (MQ=255) cGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGc < 1:2106557/141‑1 (MQ=255) aaGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTg > 2:392289/2‑150 (MQ=255) ttCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCggg < 2:1145274/129‑1 (MQ=255) ttCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCggg > 1:1145274/1‑129 (MQ=255) tCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGaaaa < 2:910127/150‑1 (MQ=255) tCAACGTGCGGCCCGGCCCGGAGGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAAAATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGaaaa < 2:1016840/150‑1 (MQ=255) aaCGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGc > 2:1709870/1‑150 (MQ=255) gctgctCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCg < 2:2303901/150‑1 (MQ=255) ctgctCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGc > 1:2096282/1‑150 (MQ=255) 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ggCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCg > 2:743732/1‑112 (MQ=255) ggCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCg < 1:743732/112‑1 (MQ=255) cccGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGAGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGCTATGCGCa > 1:383754/1‑150 (MQ=255) ccGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGCTATGCGCAg < 1:1709870/150‑1 (MQ=255) ccGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGCTATGCGCAg > 2:1468709/1‑150 (MQ=255) cGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGCTATGCGCAgg > 2:1945120/1‑150 (MQ=255) | GATGCGGCCCCGCGGCTGAACGACGTACACCTCGAAGCGGAGGATGCCCGCGCGTTCCACGCCTTCGTCATTCGCCAGGTCGTGCTGATGCTGTGCGCCGGAATGGTGCATGGCGACCTGTCCGAGTTCAACGTGCTGCTCGGCCCGGACGGGCCGGTGATCATCGACCTGCCGCAGGCAGTGGATGCAGCCGCCAACAACCATGCCTTCAGCATGCTGCAGCGCGATGTGGACAACATGGCCCACTATTTCGGGCGCTTTGCCCCGGAGCTGAAAAGCACCCGCTATGCGCAGG > NC_002947/3312196‑3312490 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |