Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,344,389 | C→G | 7.8% | Q261H (CAG→CAC) | PP_2941 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,344,389 | 0 | C | G | 7.8% | 280.5 / 13.7 | 90 | Q261H (CAG→CAC) | PP_2941 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (45/38); new base G (3/4); total (48/42) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.01e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.12e-01 |
ATTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATCCAC > NC_002947/3344243‑3344536 | aTTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGa > 1:1866247/1‑150 (MQ=255) ttCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGaa > 2:571005/1‑150 (MQ=255) cGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCgg < 1:675820/150‑1 (MQ=255) gaagggaaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCGGc < 2:2086785/150‑1 (MQ=255) agggaaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGctc > 1:582517/1‑150 (MQ=255) gaaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGctc < 2:1730035/147‑1 (MQ=255) gaaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGctc > 1:1730035/1‑147 (MQ=255) aaggTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTAta < 2:582517/150‑2 (MQ=255) ggCTGAACAGTACGTGGAAAGCCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTAtcagctcagc < 2:1199879/150‑1 (MQ=255) gCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAgcg > 2:1580907/1‑150 (MQ=255) tGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGaa < 2:1866247/150‑1 (MQ=255) gTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCGAGGGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTgg < 1:233/150‑1 (MQ=255) aGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCGGctgc < 1:340853/116‑3 (MQ=255) aGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCGGctgc > 2:340853/1‑114 (MQ=255) aGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCGGctgc < 1:340392/116‑3 (MQ=255) aGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCAGTGAAGCGGctgc > 2:340392/1‑114 (MQ=255) aGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCaa > 2:471890/1‑150 (MQ=255) gAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAAt > 1:665742/1‑150 (MQ=255) cGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCtgt < 1:507766/150‑1 (MQ=255) gAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGc < 1:1534067/150‑1 (MQ=255) aGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCt > 2:1038503/1‑150 (MQ=255) aGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCt > 2:1038272/1‑150 (MQ=255) aGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAAACGCTTGATTTCGAACCTTCGCAATGGCCGTGcc > 2:295117/1‑149 (MQ=255) gctgcCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGa < 1:1038503/150‑1 (MQ=255) gctgcCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGa < 1:1038272/150‑1 (MQ=255) gcCATGTGAGTCCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCCACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGATGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATAc < 1:1293957/150‑1 (MQ=255) cAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCa < 1:772246/150‑1 (MQ=255) gTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTc > 2:1216401/1‑150 (MQ=255) aGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGaa < 2:987030/150‑1 (MQ=255) gTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAg > 2:494941/1‑150 (MQ=255) ttCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAgg < 1:1216401/150‑1 (MQ=255) cGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGcc < 1:494941/150‑1 (MQ=255) gAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCATGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGc > 2:1828765/1‑102 (MQ=255) gAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCATGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGc < 1:1828765/102‑1 (MQ=255) gAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGc < 2:176027/102‑1 (MQ=255) gAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGc > 1:176027/1‑102 (MQ=255) ggTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggct > 1:2291943/1‑150 (MQ=255) tCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggctg > 1:1499517/1‑149 (MQ=255) tCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggctg < 2:1499517/149‑1 (MQ=255) cTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggctggc < 1:950900/150‑1 (MQ=255) tGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATACCCGCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCggctggct > 1:1103151/1‑150 (MQ=255) tCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGc > 1:164370/1‑150 (MQ=255) cGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCtgtg < 1:2198527/112‑1 (MQ=255) cGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCtgtg > 2:2198527/1‑112 (MQ=255) ccACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTc > 2:308743/1‑133 (MQ=255) ccACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTc < 1:308743/133‑1 (MQ=255) ccACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGt > 2:1535492/1‑150 (MQ=255) ccACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGt > 2:2240819/1‑150 (MQ=255) aCCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTg > 1:1166761/1‑150 (MQ=255) aCCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTAGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGccc > 2:1289226/1‑144 (MQ=255) aCCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGAGAGCCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTAGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGccc < 1:1289226/144‑1 (MQ=255) ccGCAACCACGGGCGGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCt < 2:2012322/129‑1 (MQ=255) ccGCAACCACGGGCGGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCt > 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tGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGccc < 2:164370/150‑1 (MQ=255) tGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGccc > 1:1525068/1‑150 (MQ=255) gCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGATGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCg < 1:1580907/150‑1 (MQ=255) cGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGcc > 2:312824/1‑114 (MQ=255) cGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGcc < 1:312824/114‑1 (MQ=255) cGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCCCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCCCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCCCTCCCAGGCTGAGCGCCAGCTGCTCGGTCTGTTGGcaccg > 2:410854/1‑146 (MQ=255) 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gCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTTCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCAt > 1:1041075/1‑150 (MQ=255) gCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCAt > 2:1002096/1‑150 (MQ=255) cctCACTGACGCCGCTCTATCAGCTCAGCGCCGTGATTGCGAACCTTGGCATTGGCCGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATc < 2:151784/148‑1 (MQ=255) cTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGt > 2:2209708/1‑126 (MQ=255) cTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGt < 1:2209708/126‑1 (MQ=255) tCACTGAAGCAACTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGTGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATccc > 1:1144485/1‑149 (MQ=255) cACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATCCAc < 2:1115411/150‑1 (MQ=255) | ATTCTCGAAGGGAAGGTTATGGCTGAACAGTACGTGGAAAGTCAGAAAAGCGGAGCTTGTGCTGCCAGGTGAGTTCGCCGAGGTCTGATCGGACCCACCGCAACCACGGGCAGGTCGACCACCTGCGAATCTGTGCAGCCGCTTCACTGAAGCGGCTCTATCAGCTCAGCGCCTTGATTGCGAACATTGGCAATGGCTGTGCTCACTCGATACCACTCGAAGGCCTCGGCTGGCTCGCCCAGGTTGAGCGCCATCTGCTCGGCTTGTTCGCCCGGCGTCGCGGGTTGCATCCAC > NC_002947/3344243‑3344536 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |