| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,506,083 | T→A | 6.1% | intergenic (‑399/+82) | PP_3103 ← / ← PP_5574 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,506,083 | 0 | T | A | 6.1% | 305.9 / 8.8 | 98 | intergenic (‑399/+82) | PP_3103/PP_5574 | hypothetical protein/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (45/47); new base A (3/3); total (48/50) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.58e-01 | |||||||||||
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
AATGTTTCAAGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAGGCCAGCCGTCAC > NC_002947/3505935‑3506232 | aaTGTTTCAAGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGATGCTAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAtt > 1:2006636/1‑150 (MQ=255) gTTTTAAGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGa < 2:829157/150‑1 (MQ=255) tCAAGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCTGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGcc > 2:1870727/1‑150 (MQ=255) tCAAGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGcc > 2:1864745/1‑150 (MQ=255) aaGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCAt > 2:2217351/1‑150 (MQ=255) aaGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAAATGAGCCAt > 1:658016/1‑150 (MQ=255) cTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAAATGAGCCAtttca < 2:658016/150‑3 (MQ=255) cTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCACCCTCAAATCAGCGGGGGGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAAATGAGCCAtttca < 2:189149/150‑3 (MQ=255) tCGCGGGTTTATTAACTCATTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGGGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTaaa < 1:1941659/150‑1 (MQ=255) tCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAt < 1:309415/136‑1 (MQ=255) tCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAt > 2:309415/1‑136 (MQ=255) tCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGGGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTaaa > 2:181553/1‑150 (MQ=255) gcgGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAAtt > 1:1860946/1‑150 (MQ=255) gggTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGt > 1:1127003/1‑150 (MQ=255) ttaACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTtgatga < 1:2217351/150‑1 (MQ=255) aCTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAAATGAGCCAtttca < 2:1231769/135‑3 (MQ=255) aCTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCAAATGAGCCAtttca > 1:1231769/1‑133 (MQ=255) tCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATTTCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCt > 2:914757/1‑150 (MQ=255) tCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCt < 1:181553/150‑1 (MQ=255) aGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGt > 2:226136/1‑150 (MQ=255) gttgttTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTa > 1:1576452/1‑150 (MQ=255) ttgttTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGGATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGa > 2:1831155/1‑120 (MQ=255) ttgttTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGa < 1:1831155/120‑1 (MQ=255) ttgttTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTAt > 1:1550613/1‑150 (MQ=255) ttgttTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTAt < 2:814545/150‑1 (MQ=255) tCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCa < 1:1864745/150‑1 (MQ=255) tCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCa > 1:474503/1‑150 (MQ=255) cTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGAGTGCTGGATTTGTCAt < 2:921531/150‑1 (MQ=255) tgtgTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATg > 2:2110988/1‑150 (MQ=255) gtgtAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGa < 2:350535/150‑1 (MQ=255) tCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTAc > 1:401631/1‑150 (MQ=255) ggTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTa < 1:1379782/150‑1 (MQ=255) gTGAGGCTGAAGCGCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAg < 2:1316520/150‑1 (MQ=255) tGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGc < 1:226136/150‑1 (MQ=255) tGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGc > 1:1421061/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACg > 2:629629/1‑150 (MQ=255) gCTGAAGCCCGGATGGATTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACg > 2:1673082/1‑150 (MQ=255) cTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGt > 2:1617745/1‑150 (MQ=255) gAAGCCCGGATGGCTTACGTAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCCAGTAGCCTGAATTCGATGGGGGGTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCTATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACCCGTAGCGACGTgg < 2:700095/150‑1 (MQ=255) gAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTgg < 1:895172/150‑1 (MQ=255) cccGGATGGCTTACGCAAATCAGCTGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGgtgt < 1:1870727/150‑1 (MQ=255) ccGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCt < 1:1464656/109‑1 (MQ=255) ccGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCt > 2:1464656/1‑109 (MQ=255) cGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTgg > 1:647268/1‑150 (MQ=255) gATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGat < 1:1201590/150‑1 (MQ=255) gCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTa < 2:1550613/150‑1 (MQ=255) gCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTa < 1:2110988/150‑1 (MQ=255) cTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTtga > 2:1115009/1‑93 (MQ=255) cTTACGCAAATCAGCGGGGGGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTtga < 1:1115009/93‑1 (MQ=255) ttACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGa > 1:1357058/1‑150 (MQ=255) ttACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGa > 1:1934340/1‑150 (MQ=255) ttACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGa < 2:1421061/150‑1 (MQ=255) tACGCAAAGCAGGGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCGTACAAGTGGCGCCGTGGGTGTGGATATTCGaa < 2:474503/150‑1 (MQ=255) gCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTa > 2:646419/1‑123 (MQ=255) gCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTa < 1:646419/123‑1 (MQ=255) gCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTa > 2:272319/1‑150 (MQ=255) gCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTa > 2:1926665/1‑150 (MQ=255) aaaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACaa > 1:1235298/1‑118 (MQ=255) aaaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACaa > 1:1371419/1‑118 (MQ=255) aaaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACaa < 2:1235298/118‑1 (MQ=255) aaaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACaa < 2:1371419/118‑1 (MQ=255) aaaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACt > 2:2071946/1‑150 (MQ=255) aaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTg < 1:601651/150‑1 (MQ=255) aaTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTg > 1:2190145/1‑150 (MQ=255) aTCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTgg < 1:1617745/150‑1 (MQ=255) tCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGgc > 2:1817682/1‑150 (MQ=255) aGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGt < 1:528987/97‑1 (MQ=255) aGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGt > 2:528987/1‑97 (MQ=255) gcggcgAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTgg > 2:341729/1‑150 (MQ=255) ccgcgAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGa < 1:852088/148‑1 (MQ=255) agcagcCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAg < 1:1817682/150‑1 (MQ=255) agcagcCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAg < 1:1771244/150‑1 (MQ=255) agcagcCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAg < 1:341729/150‑1 (MQ=255) agcagcCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCCGGATGCAg < 2:1357058/150‑1 (MQ=255) gcagcCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAgg > 2:440477/1‑150 (MQ=255) ccTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCAtt > 2:1570186/1‑150 (MQ=255) cTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCAttt < 1:1628214/150‑1 (MQ=255) gAATTCGATGGGGGGTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCAttttt > 2:1251751/1‑150 (MQ=255) aaTTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTa < 2:2190145/150‑1 (MQ=255) aTTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTAt < 2:1860946/150‑1 (MQ=255) cGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGCGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCAc > 1:2136163/1‑150 (MQ=255) gggggTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTa < 1:418438/102‑1 (MQ=255) gggggTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTa > 2:418438/1‑102 (MQ=255) gggggTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCAt < 2:1576452/150‑1 (MQ=255) gTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGc < 1:629629/150‑1 (MQ=255) gTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGc < 1:2071946/150‑1 (MQ=255) ttGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGtt < 1:2338810/38‑1 (MQ=255) ttGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGtt > 2:2338810/1‑38 (MQ=255) tGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCtt < 1:1570186/150‑1 (MQ=255) ggAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTg < 1:2062104/150‑1 (MQ=255) aatttaaaTGGCTCAAATGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGc > 2:377710/6‑150 (MQ=255) gTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTAc < 2:364397/99‑1 (MQ=255) gTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTAc > 1:364397/1‑99 (MQ=255) gTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTAACTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCa < 1:1801705/122‑1 (MQ=255) gTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTAACTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCa > 2:1801705/1‑122 (MQ=255) tGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAg < 1:272319/150‑1 (MQ=255) aaTGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCCGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAGGcc > 2:1977711/1‑150 (MQ=255) gCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAGGCCAGcc > 2:1026937/1‑150 (MQ=255) gCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAGGCCAGcc > 1:808504/1‑150 (MQ=255) tttGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAGGCCAGCCGTCAc < 2:1934340/150‑1 (MQ=255) | AATGTTTCAAGGCTCGCGGGTTTATTAACTCAGTTGTTTTCTGTGTAGCTGTCAGGGGTGAGGCTGAAGCCCGGATGGCTTACGCAAATCAGCGGGGTGGGGGCGGCGAGCAGCCTGAATTCGATGGGGGTTGGAGTGAAATGGCTCATTTGAGCCATTTAAATTGTTTGATGATTTCTGTATTTGTCATGACTACCTTACAAGTAGCGACGTGGGTGTGGATATTAGAATTACTGGCGCCCGTCAACCTGGATGCAGGCATTTTTATCACTCATGTGCTTGCAAGGCCAGCCGTCAC > NC_002947/3505935‑3506232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |