Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,528,036 | A→G | 5.4% | S402G (AGC→GGC) | imuB → | DNA repair DNA linked protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,528,036 | 0 | A | G | 5.4% | 289.2 / 4.1 | 94 | S402G (AGC→GGC) | imuB | DNA repair DNA linked protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (34/54); new base G (3/2); total (37/57) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.83e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.02e-01 |
AACCCTGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTG > NC_002947/3527887‑3528185 | aaCCCTGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCa > 1:103528/1‑150 (MQ=255) cccTGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgc > 1:583424/1‑150 (MQ=255) cTGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCACGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgccc > 1:626093/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgcgg > 1:369988/1‑148 (MQ=255) tGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgccgc < 2:1541848/150‑1 (MQ=255) gggCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgccgcc < 2:1753/150‑1 (MQ=255) ggCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGccc < 2:1136737/150‑1 (MQ=255) gcAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCggg < 2:909638/150‑1 (MQ=255) gcAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCggg < 1:1345419/150‑1 (MQ=255) aaTTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGt < 2:270410/150‑1 (MQ=255) aaTTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGt < 1:2030324/150‑1 (MQ=255) aTTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGGAGCCGCCCGGGGTg > 1:183357/1‑150 (MQ=255) ttGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTgg < 2:386645/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTgg < 2:242446/150‑1 (MQ=255) tGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGc < 2:828991/150‑1 (MQ=255) cgAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCtgtt < 2:44953/150‑1 (MQ=255) cgAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCtgtt < 1:421488/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTc < 1:2313403/150‑1 (MQ=255) gCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTc > 1:312160/1‑150 (MQ=255) ggTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCgg > 2:645476/1‑150 (MQ=255) tGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCAc < 1:1432708/150‑1 (MQ=255) gcgcCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGa < 2:2038148/150‑1 (MQ=255) ccTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCt < 1:1146345/150‑1 (MQ=255) tGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCa < 1:311824/111‑1 (MQ=255) tGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCa > 2:311824/1‑111 (MQ=255) tGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCgcgcaat < 2:183357/150‑4 (MQ=255) tGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTgg < 1:2040960/150‑1 (MQ=255) gggggATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCTGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTggg > 1:2007859/1‑149 (MQ=255) gggggATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgcc < 2:1799318/113‑1 (MQ=255) gggggATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgcc > 1:1799318/1‑113 (MQ=255) ggCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGAcgccgc < 1:3399/150‑1 (MQ=255) gCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGAACCGATCGCGCTGGATGACgccgcc < 1:600011/150‑1 (MQ=255) tCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCTGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTAcc > 1:2328762/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAgg > 1:1252339/1‑150 (MQ=255) ttGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAgg < 2:579793/150‑1 (MQ=255) ttGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTAGCGTTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTAGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAgg > 2:82651/1‑150 (MQ=255) cAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATg < 1:800798/150‑1 (MQ=255) gccgATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACGGATCGCGCTTGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGaa < 1:2157575/150‑1 (MQ=255) ccgATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCtgt > 1:2281706/1‑93 (MQ=255) ccgATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCtgt < 2:2281706/93‑1 (MQ=255) aTCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCa < 2:441238/150‑1 (MQ=255) cGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCTGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGaa < 2:2328762/150‑1 (MQ=255) gCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAAt < 1:1378650/150‑1 (MQ=255) cccGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCa < 1:131314/150‑1 (MQ=255) cccGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGACGCCGCTCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCa < 1:735287/150‑1 (MQ=255) ccGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAg < 2:2089765/150‑1 (MQ=255) ccGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAg > 1:993082/1‑150 (MQ=255) ccGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAg < 1:456292/150‑1 (MQ=255) gcgcCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTtggt < 1:185464/150‑1 (MQ=255) tGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgccgc > 1:288092/1‑57 (MQ=255) tGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAgccgc < 2:288092/57‑1 (MQ=255) gCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCTGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGTCCCGTCCCAGTCGCGGGTCTATGCCGAACGCATCGACTCCGGTTGGTGGGATgg < 2:1248640/150‑1 (MQ=255) aTTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAAc < 1:214292/123‑1 (MQ=255) aTTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAAc > 2:214292/1‑123 (MQ=255) aTTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATggcg < 1:1271326/150‑1 (MQ=255) gCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAAc < 1:769255/118‑1 (MQ=255) gCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAAc > 2:769255/1‑118 (MQ=255) gCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGAt < 2:1317439/150‑1 (MQ=255) gCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGAt < 2:103528/150‑1 (MQ=255) cGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGAACCGGGCAGCCGGCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCTTTCGAGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGAtg > 1:1693059/1‑150 (MQ=255) ggAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCAATGCCGAACGCCTCTAATCAGGTTGGTGGGAGGGCGGCGAtgt < 2:1436916/150‑1 (MQ=255) aGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGc < 2:1174512/150‑1 (MQ=255) gCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAg < 2:69746/100‑1 (MQ=255) gCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAg > 1:69746/1‑100 (MQ=255) gggTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcg > 2:480033/1‑150 (MQ=255) gggTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcg < 1:480033/150‑1 (MQ=255) ggTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGt > 2:1056728/1‑123 (MQ=255) ggTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGt < 1:1056728/123‑1 (MQ=255) ggTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATAGTATCATGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcgc < 1:450662/150‑1 (MQ=255) cccAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGact > 2:1395234/1‑150 (MQ=255) ccAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGacta > 2:394734/1‑150 (MQ=255) aaGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGactact > 2:665469/1‑150 (MQ=255) ggCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACtactac > 2:1732162/1‑150 (MQ=255) gCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTc < 2:773291/138‑1 (MQ=255) gCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTc > 1:773291/1‑138 (MQ=255) ctGCCCGGTGCAACCGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGc < 1:1937000/129‑1 (MQ=255) cGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGaaa < 1:394734/150‑1 (MQ=255) ggTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAAc < 2:312160/150‑1 (MQ=255) ggTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTAGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAAc < 2:1252339/150‑1 (MQ=255) gTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCa < 1:1048213/74‑1 (MQ=255) gTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCa > 2:1048213/1‑74 (MQ=255) ttGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAcccc < 2:583424/150‑1 (MQ=255) ccaccccGGGCGGCTGCCCGGTGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAAccc > 1:792357/6‑150 (MQ=255) ccccGGGCGGCTGCCCGGTGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcgc < 2:2241033/123‑1 (MQ=255) ccccGGGCGGCTGCCCGGTGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcgc > 1:2241033/3‑125 (MQ=255) cccGGGCGGCTGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcgc < 1:650256/123‑1 (MQ=255) cccGGGCGGCTGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTcgc > 2:650256/2‑124 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATgg > 2:2298603/1‑108 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATgg < 1:2298603/108‑1 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATg > 2:2298563/1‑107 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATg < 1:2298563/107‑1 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGa > 2:2103372/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGa > 2:1293890/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTAGAGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGa > 2:54784/1‑150 (MQ=255) aCCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGCCGGAACAGCTTGGGATAGTGGCCTTCCGGAAATAGGTGAAAAGCAAGGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTTGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGa > 1:634107/1‑150 (MQ=255) gggCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACgg > 1:1307493/1‑150 (MQ=255) ggCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGc > 1:1683066/1‑150 (MQ=255) aGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTg > 1:198740/1‑150 (MQ=255) | AACCCTGGGCGCAATTGCGCGAGCGGTTGCGCGCCCGCCTGGGGGATGAGGCCGTCAAGGGGCTTGGCGCAGCCGCCGATCACCGCCCCGAATGCGCCTGGCATTTGGCGGAGCAGGGTGCCCAAGGCAACATGCCGGTTGCACCGGGCAGCCGCCCGGGGTGGCTGTTGTCGGCACCGATCGCGCTGGATGACGCCGCCTACCAGGTGCAGGGCTATGCCGAACGCATCGAATCAGGTTGGTGGGATGGCGGCGATGTGCGTCGCGACTACTACCGCATCGAAACCCGTGACGGCCTG > NC_002947/3527887‑3528185 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |