Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,620,134 | G→A | 5.3% | L88F (CTT→TTT) | PP_3190 ← | ornithine cyclodeaminase/mu‑crystallin family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,620,134 | 0 | G | A | 5.3% | 220.2 / 2.2 | 75 | L88F (CTT→TTT) | PP_3190 | ornithine cyclodeaminase/mu‑crystallin family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (37/34); new base A (2/2); total (39/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.15e-01 |
ATGCCAATGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGCGAAGCCCTGC > NC_002947/3619998‑3620279 | aTGCCAATGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCcatca < 2:85167/150‑1 (MQ=255) tGCCAATGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCcatcat < 2:1326472/150‑1 (MQ=255) gCCAATGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCAtt < 1:685388/150‑1 (MQ=255) cAATGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCCGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGc > 1:841334/1‑150 (MQ=255) aaTGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCt > 1:1756980/1‑150 (MQ=255) cTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAg > 1:2088474/1‑150 (MQ=255) ccTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCt < 1:2309857/150‑1 (MQ=255) cTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCCATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCCTGGCCGTCGGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCGtt > 1:996756/1‑150 (MQ=255) gggATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGTGCCTGCAGCAGTGACAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTgg > 1:755490/1‑150 (MQ=255) tGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg < 2:1756980/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg < 1:310822/150‑1 (MQ=255) tGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGACTATGGCAGTCAGCCAGTCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg < 1:502522/150‑1 (MQ=255) ggCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCAAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACggg < 2:1769048/150‑1 (MQ=255) gcCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTg < 2:2140823/150‑1 (MQ=255) gcCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTg > 1:1337362/1‑150 (MQ=255) gcCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTg > 2:2143121/1‑150 (MQ=255) ccGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGaa < 1:2143121/150‑1 (MQ=255) gggCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGc < 2:1337362/150‑1 (MQ=255) ggcgATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGt < 1:1166326/150‑1 (MQ=255) gCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCt > 2:1340551/1‑150 (MQ=255) gCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCt > 2:1361677/1‑150 (MQ=255) gatctccAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCTGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGTCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCtt < 1:1894784/145‑1 (MQ=255) cccGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCtt < 2:1642125/150‑1 (MQ=255) cGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGa < 1:1428034/150‑1 (MQ=255) ggCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGa < 2:2296721/117‑1 (MQ=255) ggCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGa > 1:2296721/1‑117 (MQ=255) gCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg < 2:146905/119‑1 (MQ=255) gCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg > 1:146905/1‑119 (MQ=255) cAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCCGGCCCTTGGACGGGCTGTCCTAGAACCCTGCCGAAAGCTTGagatc > 2:1894784/1‑146 (MQ=255) aaCGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGTAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTg > 1:1737999/1‑150 (MQ=255) cgcgGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGaa < 1:1216158/150‑1 (MQ=255) gcgGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAg > 2:1636730/1‑150 (MQ=255) gcATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGc > 1:2182998/1‑150 (MQ=255) tCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCgg < 2:1723562/82‑1 (MQ=255) tCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCgg > 1:1723562/1‑82 (MQ=255) tCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGCGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGa > 2:727386/1‑150 (MQ=255) gccagccTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTc > 2:2247725/1‑113 (MQ=255) gccagccTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTc < 1:2247725/113‑1 (MQ=255) gccagccTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGt > 1:946432/1‑150 (MQ=255) cagccTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGCGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAg < 2:784258/150‑1 (MQ=255) agccTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAgg > 2:665651/1‑150 (MQ=255) cTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGAc < 2:1810547/86‑1 (MQ=255) cTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGAc > 1:1810547/1‑86 (MQ=255) cTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAg > 1:1396105/1‑139 (MQ=255) cTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAg < 2:1396105/139‑1 (MQ=255) tGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGTAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACg > 2:1439294/1‑150 (MQ=255) gcagcaGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGaa < 1:1703112/115‑1 (MQ=255) gcagcaGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGaa > 2:1703112/1‑115 (MQ=255) agcagTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCaa < 1:363071/150‑1 (MQ=255) cagTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg < 2:259547/75‑1 (MQ=255) cagTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACgg > 1:259547/1‑75 (MQ=255) gCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCATGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCa < 1:1195715/150‑1 (MQ=255) gCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGCCGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCACCAGTCa > 1:2282590/1‑150 (MQ=255) ccAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCAc < 2:2104524/150‑1 (MQ=255) cAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCAcc > 2:632723/1‑150 (MQ=255) aGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAg > 2:2173389/1‑126 (MQ=255) aGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAg < 1:2173389/126‑1 (MQ=255) ggCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTc < 1:1381301/150‑1 (MQ=255) gCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAACATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACa < 2:1558994/139‑1 (MQ=255) gCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAACATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACa < 2:1558011/139‑1 (MQ=255) gCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAACATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACa > 1:1558011/1‑139 (MQ=255) gCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAACATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACa > 1:1558994/1‑139 (MQ=255) aCCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGAc > 2:1654251/1‑58 (MQ=255) aCCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGAc < 1:1654251/58‑1 (MQ=255) cGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCt > 2:315673/1‑150 (MQ=255) tgCAGACAGCACAAGAATCAAGGCATCATTGCGCGGCAGGCACTGTGACGGATTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGGGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACGTAACGCAACAGTAACCGTTCGCGCCCTTGAATGc > 2:914533/1‑150 (MQ=255) tgCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGc > 1:217934/1‑150 (MQ=255) gACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTc > 2:25709/1‑132 (MQ=255) gACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTc < 1:25709/132‑1 (MQ=255) acaacaCAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGCGAAGc > 2:1926919/1‑150 (MQ=255) aacaCAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGGCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCGGACTTCGCGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGCGAAGccc > 2:1310918/1‑150 (MQ=255) acacAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGCGAAGCCCt < 2:755490/150‑1 (MQ=255) acaAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGCGAAGCCCTGc > 1:360922/1‑150 (MQ=255) aaGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCCTTc < 2:2287095/124‑1 (MQ=255) aaGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCCTTc > 1:2287095/1‑124 (MQ=255) | ATGCCAATGGCCTTGACCTGGGATGGCGCCAGCAGCCGGGCGGCGATACGCCCGGCCAACGCGGTGCGCATGGCAGTCAGCCAGCCTTGGTCCTGCAGCAGTGCCAGCGGCTGACCGGTGTGTGCAGACAACACAAGCATCAAGCCATCATTGCTCGGCAGGCCCTTGGACGGGTTGTCGTAGAAGCCTGTCGAAAGCTTGACGGTGAAGGTCGGGCTGCCTTCGATGTAGGCCGACTTCACGCAACAGTCACCGTTCGCGCCCTTGAATGCGAAGCCCTGC > NC_002947/3619998‑3620279 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |