| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,793,935 | A→T | 8.0% | L211M (TTG→ATG) | PP_3355 ← | beta‑ketothiolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,793,935 | 0 | A | T | 8.0% | 265.4 / 12.6 | 87 | L211M (TTG→ATG) | PP_3355 | beta‑ketothiolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (40/40); new base T (3/4); total (43/44) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
CAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGCCAG > NC_002947/3793786‑3794082 | cAATGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaa < 1:1559730/150‑1 (MQ=255) aaGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGTGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaat < 1:1803530/150‑1 (MQ=255) aGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaatg < 1:811660/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcattgcatt < 1:1602511/150‑3 (MQ=255) gcgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCATTGCATTGCCGCGt < 1:1993995/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGt < 1:695925/150‑1 (MQ=255) gcgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGt < 1:676327/150‑1 (MQ=255) cgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGTCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtg < 2:109883/150‑1 (MQ=255) cgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCATTGCATTGCCGCGtg < 2:521715/150‑1 (MQ=255) cgcCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtg < 2:2187410/150‑1 (MQ=255) cATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtggct > 1:655563/1‑150 (MQ=255) ccaccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGc < 1:1506096/150‑1 (MQ=255) caccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGcc > 1:703251/1‑150 (MQ=255) accGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCGATGCCGCGtg > 1:916163/1‑139 (MQ=255) accGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCGATGCCGCGtg < 2:916163/139‑1 (MQ=255) ccGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCtt > 1:676154/1‑150 (MQ=255) gcgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCATTGCATTGCCGCGtggcgt < 2:222535/140‑3 (MQ=255) gcgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCATTGCATTGCCGCGtggcgt > 1:222535/1‑138 (MQ=255) gcgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCt < 2:655563/150‑1 (MQ=255) gcgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCt > 1:999091/1‑150 (MQ=255) cgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTa > 2:1956625/1‑150 (MQ=255) cgcAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTa < 2:703251/150‑1 (MQ=255) aaCTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCt > 2:987000/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTc > 1:1927271/1‑140 (MQ=255) ttGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTc < 2:1927271/140‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGt < 2:2000821/150‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGt > 2:797981/1‑150 (MQ=255) ttGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGt < 2:999091/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGc < 2:2091847/150‑1 (MQ=255) gCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGc > 1:831825/1‑150 (MQ=255) gCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTgc < 1:2294702/150‑1 (MQ=255) ccGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTgcg > 1:2204632/1‑150 (MQ=255) gTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGcgcg > 2:535162/1‑150 (MQ=255) tCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTAc > 2:1965097/1‑133 (MQ=255) tCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTAc < 1:1965097/133‑1 (MQ=255) tGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtggc < 2:1747107/117‑1 (MQ=255) tGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGtggc > 1:1747107/1‑117 (MQ=255) gCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCGAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTGCTCCCTCCAGTGCCGGCTCGGGGAGGCt > 2:1969371/1‑150 (MQ=255) gCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaat < 2:1874857/97‑1 (MQ=255) gCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGgcaat > 1:1874857/1‑97 (MQ=255) cACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGa < 1:203498/150‑1 (MQ=255) aCCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCATGCCACGCGGCATTGCATTGCCGCGtggcgtga > 2:2138024/1‑109 (MQ=38) aCCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCATGCCACGCGGCATTGCATTGCCGCGtggcgtga < 1:2138024/113‑5 (MQ=38) gCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGTGCGGTGACGCTGACGAtt < 1:4468/150‑1 (MQ=255) gCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGAtt < 2:204072/150‑1 (MQ=255) cACCGGGCGCAGTCGGGCCAGCGCAGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACTCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCATCTACCTCCAGTGCCTGCGTGGTGACGCTGACGATTTCCtc < 2:183383/150‑1 (MQ=255) ccGGGCGCAGTCGGTCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcgt < 2:602333/150‑1 (MQ=255) cgagcgcAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcgtc > 2:2145243/4‑150 (MQ=255) cGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCtcgtc > 2:18752/1‑150 (MQ=255) cgcAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAAc < 2:2291888/150‑1 (MQ=255) gcAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAAcc > 2:1648562/1‑150 (MQ=255) gggCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCT > 1:1526744‑M1/1‑150 (MQ=255) ggCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTG > 1:1234138‑M1/1‑150 (MQ=255) cAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCAc < 1:535162/150‑1 (MQ=255) gCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTgg < 1:1603041/150‑1 (MQ=255) gcgTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCtt < 2:1398400/82‑1 (MQ=255) gcgTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCtt > 1:1398400/1‑82 (MQ=255) 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ctcactcaCGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTc < 2:1845660/150‑1 (MQ=255) ctcactcaCGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTc > 2:669865/1‑150 (MQ=255) tcactcacGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCAGCTGGGCTTGCAGGGACCGCTGATGGCTGCGCGGGGcacaggggtgc > 2:1128296/1‑143 (MQ=255) tcacGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCg > 1:1808992/1‑150 (MQ=255) cgccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGttt < 1:1281927/150‑1 (MQ=255) gccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTg < 1:1978368/54‑1 (MQ=255) gccacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTg > 2:1978368/1‑54 (MQ=255) cacgcGGCATTGCATTGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCAc > 2:341349/1‑150 (MQ=255) cacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAgg > 2:215980/1‑128 (MQ=255) cacgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAgg < 1:215980/128‑1 (MQ=255) acgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAAc > 1:1662567/1‑82 (MQ=255) acgcGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAAc < 2:1662567/82‑1 (MQ=255) ggCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGcc > 1:1824854/1‑150 (MQ=255) gcaatgcaatGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGCCa < 1:2145243/150‑1 (MQ=255) gcaatgcaatGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGCCa < 1:178933/150‑1 (MQ=255) caatgcaatgCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCCCCGTTTCACGCGCCAg > 2:1219129/1‑150 (MQ=255) | CAAGGCTGCCGCCGCGCCATCGACCACCGCGCAACTGTTGCCAGCCGTCTGCACGCCACCGGCGTGCACCGGGCGCAGTCGGGCCAGTGCGGCCGCGTCGGTAGGCCGTGGGTGGCTGTCCTGGCTGACCTCACTCACGCCACGCGGCAATGCAATGCCGCGTGGCTGGCAGCCTTCTACCTCCAGTGCCTGCGCGGTGACGCTGACGATTTCCTCGTCGAACCAGCCCTGCACCTGGGCTTGCAGGGCCCGCTGATGGCTGCGCAGGGCCCACGCGTCCACCGTTTCACGCGCCAG > NC_002947/3793786‑3794082 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |