| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,982,021 | A→T | 6.6% | noncoding (28/207 nt) | PP_mr43 ← | Cobalamin regulatory region |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,982,021 | 0 | A | T | 6.6% | 211.6 / 4.8 | 72 | noncoding (28/207 nt) | PP_mr43 | Cobalamin regulatory region |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (33/34); new base T (3/2); total (36/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.58e-01 | |||||||||||
TGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGCC > NC_002947/3981874‑3982163 | tGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGATTGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTAAAAGCCTTGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAgg > 1:1310518/1‑150 (MQ=255) ttGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCga > 2:1579722/1‑150 (MQ=255) aCCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCgaagaa > 1:433069/1‑150 (MQ=255) ccGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCTGGCCgaagcta < 1:1579722/150‑4 (MQ=255) cGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGGTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAAcc > 1:398307/1‑150 (MQ=255) cATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGaa > 1:57566/1‑150 (MQ=255) ggccccGTTCGGGCTGGCGGGAGGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTg < 1:2231642/148‑1 (MQ=255) cccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCa > 1:1468274/1‑150 (MQ=255) cccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGCGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCa > 1:1272829/1‑150 (MQ=255) ccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGGCTTCTCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGATTTGGCaa < 2:1310518/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCaa < 2:1952164/150‑1 (MQ=255) ccGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCaa < 1:1823283/150‑1 (MQ=255) cGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAg < 2:947892/150‑1 (MQ=255) ggCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGCAGTGGc > 1:1991306/1‑141 (MQ=255) ggCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGc < 2:1991306/141‑1 (MQ=255) ggCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGt < 1:2311766/150‑1 (MQ=255) gCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGtg < 2:433069/150‑1 (MQ=255) gggATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCaa > 1:1209630/1‑136 (MQ=255) gggATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCaa < 2:1209630/136‑1 (MQ=255) gggATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGtggc > 1:1292452/1‑150 (MQ=255) gACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAg > 2:1838218/1‑141 (MQ=255) gACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAg < 1:1838218/141‑1 (MQ=255) gACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCg > 2:1986774/1‑150 (MQ=255) cGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCggg < 1:1718532/150‑1 (MQ=255) ccTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtg < 1:1754634/150‑1 (MQ=255) cTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAAcc < 2:508109/114‑1 (MQ=255) cTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAAcc > 1:508109/1‑114 (MQ=255) cTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtgg < 2:1513241/150‑1 (MQ=255) cTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtgg > 2:2047837/1‑150 (MQ=255) ttCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGCGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGggtggt > 1:314417/1‑150 (MQ=255) gtgTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCAt < 1:1492543/148‑1 (MQ=255) cgTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCAtt < 2:57566/150‑1 (MQ=255) gTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATtg < 1:1986774/150‑1 (MQ=255) gcgcAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATtgctgc > 2:1376699/1‑150 (MQ=255) gcAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGCGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCgg < 2:314417/150‑1 (MQ=255) gCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCgg > 2:1485616/1‑150 (MQ=255) gtCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGTGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGAc < 1:1033852/150‑1 (MQ=255) gATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAAc > 2:1158753/1‑150 (MQ=255) gTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTgg < 1:1502642/150‑1 (MQ=255) ggTGCTTACAGTTGCGGTGTCAGCCGCGGTTTGTACCGCGCTCCCGTCTTAGCTTCCGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCCGTGGCTGGCAGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCACaa < 2:66495/150‑1 (MQ=255) gTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAg > 2:414262/1‑150 (MQ=255) ttACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGCAGTGTGAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGAGTGGTCAAACATTGCTGGGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGAGCAAGTGCg > 2:1141241/1‑150 (MQ=255) tACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGt < 1:2138346/150‑1 (MQ=255) ggCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGcc < 1:569302/150‑1 (MQ=255) aGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTa < 2:1272829/150‑1 (MQ=255) gCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACgg < 1:1485616/150‑1 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAAc > 2:1735193/1‑78 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAAc < 1:1735193/78‑1 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGt < 1:426165/126‑1 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGt > 2:426165/1‑126 (MQ=255) cgcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGAc > 1:1741340/1‑150 (MQ=255) gcgTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACg > 2:1713537/1‑150 (MQ=255) cccGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGcc < 1:26463/126‑1 (MQ=255) cccGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGcc > 2:26463/1‑126 (MQ=255) ccGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTgg > 2:444111/1‑101 (MQ=255) ccGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTgg < 1:444111/101‑1 (MQ=255) gTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACa > 1:2315189/1‑115 (MQ=255) gTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACa < 2:2315189/115‑1 (MQ=255) ttAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGcccc > 1:1254356/1‑150 (MQ=255) tAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCt > 2:1016491/1‑150 (MQ=255) gttcTTCGGCCTGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCt > 2:948310/4‑150 (MQ=255) aGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGt > 2:40265/1‑82 (MQ=255) aGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGt < 1:40265/82‑1 (MQ=255) aGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTc < 2:1468274/150‑1 (MQ=255) cTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCaa > 2:1955246/1‑130 (MQ=255) cTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCaa < 1:1955246/130‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGgcgc < 1:702434/95‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGgcgc > 2:702434/1‑95 (MQ=255) ttCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGcc > 2:2156594/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCAGGCCGAAGAAACGCGAAGTGGCAAGGCTACGCGGTGGCTGGCGAGGGGGCAACCATTGCTTCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGcc > 2:326889/1‑150 (MQ=255) gCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCaa < 2:55527/125‑1 (MQ=255) gCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCaa > 1:55527/1‑125 (MQ=255) | TGGCTTGCACCGTTCCATGTCCCCGTTCGGGCTGGCGGGATGACGCCTTCCCGCGCGTTGGCGCAGTGGCTGTGTCGATCCGTTGTCGGTGCTTACAGTTGCGGGGGCAGCCGCGGCTTGTACCGCGTTCCCGTCTTAGCTTCGGCCAGGCCGAAGAACCTCGAAGTGGCAAGGCTACGCAGTGGCTGGCGGGTGGTCAACCATTGCTGCGGGGCCGGTCGACAACGCTGGGCGCAAGTGCGTTACAGTGGCGCCTTATCCACGGTCAAGGACGCACCATGCCCCTCGCC > NC_002947/3981874‑3982163 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |