| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 351,753 | A→G | 6.2% | Q79R (CAG→CGG) ‡ | hisA → | phosphoribosylformimino‑5‑aminoimidazole carboxamide ribonucleotide isomerase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 351,753 | 0 | A | G | 6.2% | 238.5 / 4.3 | 81 | Q79R (CAG→CGG) ‡ | hisA | phosphoribosylformimino‑5‑aminoimidazole carboxamide ribonucleotide isomerase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (38/38); new base G (2/3); total (40/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.94e-01 | |||||||||||
GACGACCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAGGTCATCGTCGGC > NC_002947/351605‑351901 | gacgacCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCCATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCTAACCTGCCGATCCAg > 1:2230234/1‑150 (MQ=255)gacgacCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAg > 2:1234212/1‑150 (MQ=255) acgacCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGa < 1:805423/150‑1 (MQ=255) gacCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CGTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCACCACCAAGCCCTACCCGCACCTGCCGATCCAGATc > 2:1026687/1‑150 (MQ=255) acCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGCAATCAACGGAGAACACACGTCTGAACTCCAGTCACT‑CT‑AAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATcg > 1:531600/1‑150 (MQ=255) cGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATcggcg < 1:1259299/150‑1 (MQ=255) cGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATcggcg > 2:1819149/1‑150 (MQ=255) cGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATcggcg > 2:1146606/1‑150 (MQ=255) gTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAGGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATcggcggc > 2:1330316/1‑150 (MQ=255) tGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCTAACCTGCCGATCCAGATcggcggcg < 2:2230234/150‑1 (MQ=255) tGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACATCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATcggcggcg < 1:1538570/150‑1 (MQ=255) gCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACTCGAACCCGCCGATCTGGATcggcaggttcg < 1:298408/150‑8 (MQ=255) tGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATcc < 2:1732057/150‑1 (MQ=255) cAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCt > 1:1900657/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCTGGATcggcag < 2:457225/128‑3 (MQ=255) gTCGAGGTTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCTGGATcggcag > 1:457225/1‑126 (MQ=255) tCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCT‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTTGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCa < 1:1234212/150‑1 (MQ=255) tCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCa < 1:2274575/150‑1 (MQ=255) ggTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGaa < 1:439976/150‑1 (MQ=255) tGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTAc < 1:1752948/150‑1 (MQ=255) cgccgccTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTc > 1:1308334/1‑150 (MQ=255) cgccgccTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTc > 1:2107491/1‑150 (MQ=255) cgccTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAg < 2:234665/150‑1 (MQ=255) gccTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAgg < 1:1146606/150‑1 (MQ=255) gCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTgg > 1:1155829/1‑150 (MQ=255) cACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGa > 1:1091817/1‑97 (MQ=255) cACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGa < 2:1091817/97‑1 (MQ=255) cACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGc < 2:1308334/150‑1 (MQ=255) aCCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTg > 1:1649137/1‑119 (MQ=255) aCCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTg < 2:1649137/119‑1 (MQ=255) ccTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGGAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGt < 1:954919/150‑1 (MQ=255) cTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTc > 1:319961/1‑150 (MQ=255) ggTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAg < 1:459631/150‑1 (MQ=255) gTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGc < 1:1965524/150‑1 (MQ=255) cGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTa < 2:753097/150‑1 (MQ=255) aCCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACg < 2:156611/150‑1 (MQ=255) aCCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCCGCCGATCTGGATcggcag < 1:1303436/94‑3 (MQ=255) aCCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCCGCCGATCTGGATcggcag > 2:1303436/1‑92 (MQ=255) ccTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGt > 1:1414456/1‑150 (MQ=255) cTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCa < 1:592742/83‑1 (MQ=255) cTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCa > 2:592742/1‑83 (MQ=255) cTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTg > 1:1690302/1‑150 (MQ=255) cAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGCAACTGCAAGGCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGat < 1:869845/150‑1 (MQ=255) ggCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGattatc > 2:2112914/1‑150 (MQ=255) gAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATc > 2:1464160/1‑102 (MQ=255) gAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATc < 1:1464160/102‑1 (MQ=255) ggCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGcc < 2:30814/150‑1 (MQ=255) aGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCAAAACCTGCCGATCCAGATGGGCGGGAGTGAGCAATCGCTGGAAACCATCGAAGACTACGTCAAGGCTGGCGCCAGCGACGTGATAATTGGCACCAAGGCCGTCa > 1:1873226/1‑150 (MQ=255) tCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAagcagc < 2:319961/150‑1 (MQ=255) aaTGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATcc < 2:1746238/70‑1 (MQ=255) aaTGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATcc > 1:1746238/1‑70 (MQ=255) aaTGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGaaa < 2:2108919/82‑1 (MQ=255) aaTGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGaaa > 1:2108919/1‑82 (MQ=255) aTGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCTGTTCGATGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGCCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCGGTCAAGCAGCCCg > 2:288666/1‑150 (MQ=255) ggTGAAGTGGTTACCGCCATAGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAg > 1:1975670/1‑150 (MQ=255) gTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAagc < 1:1926666/141‑1 (MQ=255) gTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAagc > 2:1926666/1‑141 (MQ=255) ggTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCCTACACCACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCCACGTGACCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTtcgt < 1:1330316/149‑1 (MQ=255) gTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCt > 2:1498087/1‑150 (MQ=255) gTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCt > 1:1478945/1‑150 (MQ=255) ccGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGGTACGTGATCCTCCCCCCAAAGGCCGTGAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGCAg > 2:774900/1‑150 (MQ=255) cGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGcc > 1:231724/1‑121 (MQ=255) cGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGcc < 2:231724/121‑1 (MQ=255) cGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGc < 2:531600/150‑1 (MQ=255) gCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTg > 2:968236/1‑88 (MQ=255) gCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTg < 1:968236/88‑1 (MQ=255) ccATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCa < 2:1534107/111‑1 (MQ=255) ccATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCa > 1:1534107/1‑111 (MQ=255) ccATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGt < 2:1867620/150‑1 (MQ=255) cATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTg > 1:497323/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGc > 2:1975038/1‑150 (MQ=255) cAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGc < 2:617748/150‑1 (MQ=255) aGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGTCGTCAGCTACGTGATCCTCGGAAATTCAGCGCCCAATCAGCCCTAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCt > 1:2270952/1‑150 (MQ=255) cTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTccc > 2:120911/1‑150 (MQ=255) aaCCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAg < 1:1819149/150‑1 (MQ=255) gCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGatc < 1:1994379/79‑1 (MQ=255) gCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGatc > 2:1994379/1‑79 (MQ=255) cGATCCAGATCGGCGGCGGCATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAGGTCAtcg > 1:72337/1‑150 (MQ=255) aTCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTtc > 1:57218/1‑108 (MQ=255) aTCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTtc < 2:57218/108‑1 (MQ=255) aTCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAGGTCAtcgtc < 2:575974/150‑1 (MQ=255) aTCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAGGTCAtcgtc > 1:2214256/1‑150 (MQ=255) cAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGCAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAGGTCATCGTCGGc < 2:1783385/150‑1 (MQ=255) | GACGACCCGGTGAGCATGGCCGCCAAGTGGGTCGAGGGTGGCTGCCGCCGCCTGCACCTGGTCGACCTCAACGGCG‑‑CCTTCGAAGGCCAGCCGGTCAATGGTGAAGTGGTTACCGCCATCGCCAAGCGCTACCCGAACCTGCCGATCCAGATCGGCGGCGGTATCCGTTCGCTGGAAACCATCGAACACTACGTCAAGGCTGGCGTCAGCTACGTGATCATCGGCACCAAGGCCGTCAAGCAGCCCGAGTTCGTCGCTGAAGCGTGCAAAGCCTTCCCGGGCAAGGTCATCGTCGGC > NC_002947/351605‑351901 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |