Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,353,340 | C→G | 11.0% | P141R (CCG→CGG) | yrpB → | 2‑nitropropane dioxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,353,340 | 0 | C | G | 11.0% | 187.7 / 12.7 | 64 | P141R (CCG→CGG) | yrpB | 2‑nitropropane dioxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (24/32); new base G (4/3); total (29/35) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 |
CAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCATG > NC_002947/4353195‑4353488 | cAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAg < 1:1635415/150‑1 (MQ=255) gggtccTTGAGCGTTATTAAGGGGAGGTGGGCGACGTTTTCCCGCCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAgg < 2:1633339/145‑1 (MQ=255) aGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCGGCAgg > 2:237516/1‑150 (MQ=255) aCTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGa > 1:1100529/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGaa < 1:1340384/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGaa > 1:1564132/1‑150 (MQ=255) cTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCAAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGaa < 2:180151/150‑1 (MQ=255) cTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGAAGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGaa > 1:1691736/1‑150 (MQ=255) tGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCGGCAGGCCGaaat < 1:237516/150‑3 (MQ=255) tGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCGGCAGGCCGaaat < 1:458852/150‑3 (MQ=255) ccTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGTTTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAActgctg < 1:1672957/150‑1 (MQ=255) ttattaCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCa < 1:1613274/150‑1 (MQ=255) taCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCgg < 1:205861/150‑1 (MQ=255) aCAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCggg < 2:1468282/150‑1 (MQ=255) aGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTa > 1:1988572/1‑150 (MQ=255) aGCGAAGTGGGCGCCGAGTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTa > 1:1841148/1‑150 (MQ=255) gCGAAGTGGGCGCAGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCAGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTaa > 1:562546/1‑150 (MQ=255) gAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAg < 1:670248/150‑1 (MQ=255) gAAGTGGGCCCTGATTTCACGCCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAg < 1:2147804/150‑1 (MQ=255) gcgcCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCg > 2:786781/1‑150 (MQ=255) aTTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCa > 2:1805436/1‑150 (MQ=255) aCGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTa > 2:935772/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTAc > 2:1440227/1‑150 (MQ=255) ggCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGCGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACt > 1:2288090/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCa > 1:2149097/1‑150 (MQ=255) ccACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCa > 1:638638/1‑150 (MQ=255) aCGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAG‑TCCAGTGTTGGAGGTGTCGCAGTGCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAgc > 1:1113002/1‑150 (MQ=255) tgtCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGa < 1:935772/150‑1 (MQ=255) tCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCCCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGGGGTTCCAAGGTACTGTCCAGAGCgacgaca > 1:2276985/1‑149 (MQ=255) aaCCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTg > 1:1568298/1‑150 (MQ=255) aaCCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTg < 2:1466880/150‑1 (MQ=255) aaCCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGGGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCCGATAAAGGACAGGGGTGTCGAGGTACGGTCCAGCGCCACGACCGTg > 2:1423761/1‑150 (MQ=255) cGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGgaa < 1:2142381/150‑1 (MQ=255) cGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGgaa > 1:1554818/1‑150 (MQ=255) tttCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGc < 2:2149097/150‑1 (MQ=255) tCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCTCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCct < 2:1179515/150‑1 (MQ=255) tCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCct < 2:1232618/150‑1 (MQ=255) acgaGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCctggc < 2:1849624/150‑1 (MQ=255) gagCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCg > 2:828962/1‑95 (MQ=255) gagCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCg < 1:828962/95‑1 (MQ=255) gcctgcTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAGCTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTCCTGTCCAGCGCCACGACCGTCGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCactc > 2:1002713/1‑147 (MQ=255) gcctgcTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATg < 1:1440227/150‑1 (MQ=255) gctgGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtg > 1:1942779/1‑150 (MQ=255) ctgGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgc < 2:1841148/150‑1 (MQ=255) ctgGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgc < 2:1100529/150‑1 (MQ=255) cGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgcgatgc < 1:1805436/150‑1 (MQ=255) gAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCtgcgatgcg < 2:1799615/150‑1 (MQ=255) ccGTAGGTGGTGAGCGTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATg < 2:1113002/150‑1 (MQ=255) ccGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTc > 1:380157/1‑83 (MQ=255) ccGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTc < 2:380157/83‑1 (MQ=255) ggtggtGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTa < 2:1564132/150‑1 (MQ=255) ttCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGt < 1:786781/150‑1 (MQ=255) ttCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGt < 2:1988572/150‑1 (MQ=255) ttCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGACAAAAGTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGt > 1:901724/1‑150 (MQ=255) tCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTg < 1:115435/150‑1 (MQ=255) tCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGACGGTg < 2:638638/150‑1 (MQ=255) tCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGCCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGCAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTg < 2:1682031/150‑1 (MQ=255) tCCAT‑TGCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGGCCGTGGAAGAAGCGGCCGGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTg < 2:450288/150‑1 (MQ=255) t‑ttCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCa > 1:341674/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCTGCGGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATggg > 2:1119947/1‑131 (MQ=255) ttCGGCCTGCGGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATggg < 1:1119947/131‑1 (MQ=255) ttCGGCCTGCGGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCAt > 1:1729844/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCTGCGGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCAt > 1:2055397/1‑150 (MQ=255) gCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCAt > 1:842517/1‑150 (MQ=255) ccGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCATg > 1:250916/1‑150 (MQ=255) | CAGGCACTTGAGCCTTATTACAGCGAAGTGGGCGCCGATTTCACGGCGCCCACGCCGGTGTCCAACCGTGCGCCTTTCGACGAGCAGAGCTGCCTGCTGGTCGAAGCGTTGCGCCCGGAGGTGGTGAGCTTCCAT‑TTCGGCCTGCCGCAGGCCGAACTGCTGCAGCGGGTAAAGGCCAGCGGTGCCAAGGTACTGTCCAGCGCCACGACCGTGGAAGAAGCGGCCTGGCTGGAGCGCAATGGCTGCGATGCGATCATCGCCATGGGGTATGAAGCCGGTGGCCATCGCGGCATG > NC_002947/4353195‑4353488 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |