| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,469,026 | G→C | 5.8% | A409A (GCG→GCC) | PP_3959 → | voltage‑gated chloride channel family protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,469,026 | 0 | G | C | 5.8% | 262.8 / 7.7 | 86 | A409A (GCG→GCC) | PP_3959 | voltage‑gated chloride channel family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (41/40); new base C (2/3); total (43/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 3.79e-01 | |||||||||||
TTGACCCTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTGAGCAGC > NC_002947/4468878‑4469166 | ttGACCCTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTTGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATggcggcgg > 1:68722/1‑150 (MQ=255) gACCCTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGcc > 2:1283090/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGCAGGCGCACTACTTGGTATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCAtc > 1:457287/1‑150 (MQ=255) ccTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATggcggcgg < 1:191744/145‑1 (MQ=255) ccTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATggcggcgg > 2:191744/1‑145 (MQ=255) ccTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCAtc > 1:1871008/1‑150 (MQ=255) cTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCAtct > 1:625826/1‑150 (MQ=255) caggcaggCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCCGCCGCCAtcagt < 2:2272718/150‑4 (MQ=255) tgctTGGCGGGGGCGAATACCTGGTCGGGGTGACACGGTCTCGACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTAGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGtctc > 2:1895731/3‑150 (MQ=255) tactTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGtctc > 2:762580/1‑150 (MQ=255) tactTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGtctc > 2:2202697/1‑150 (MQ=255) ctTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCg > 2:1492988/1‑150 (MQ=255) cATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGtctc > 2:1018312/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCg > 1:2250335/1‑150 (MQ=255) aTGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCg > 1:1156321/1‑150 (MQ=255) gcgcATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGTGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCttt < 2:1950927/150‑1 (MQ=255) cgcATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTa < 2:757900/150‑1 (MQ=255) cATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTAcc < 2:457287/150‑1 (MQ=255) cATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTAcc < 1:2134475/150‑1 (MQ=255) aTACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCCGCCGCCAtc > 1:1639101/1‑118 (MQ=255) aTACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCCGCCGCCAtc < 2:1639101/118‑1 (MQ=255) gCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTg < 2:1610404/150‑1 (MQ=255) tgtgACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCaa > 1:2190391/1‑150 (MQ=255) tgtgACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCaa < 1:256712/150‑1 (MQ=255) gtgACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAg < 2:1871008/150‑1 (MQ=255) acacGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATggg > 2:1037105/1‑112 (MQ=255) acacGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATggg < 1:1037105/112‑1 (MQ=255) acGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGAt > 2:251502/1‑150 (MQ=255) gCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTa > 1:1813014/1‑150 (MQ=255) cTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCAt > 1:248890/1‑130 (MQ=255) cTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCAt < 2:248890/130‑1 (MQ=255) tCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTAcc < 1:1283090/150‑1 (MQ=255) tCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCCGCCGCCAtcagt > 1:281330/1‑96 (MQ=255) tCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCCGCCGCCAtcagt < 2:281330/99‑4 (MQ=255) gcGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTAcc > 2:1504999/2‑150 (MQ=255) ccACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGAc > 1:843583/1‑150 (MQ=255) cACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCAtctc > 1:126347/1‑94 (MQ=255) cACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCAtctc < 2:126347/94‑1 (MQ=255) cACTGACCACCTCTGTCATCGGGCTTGAACTTACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTAGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGCTGTCTCCGGTCTCGCTGTACCGTGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACa > 2:1097324/1‑150 (MQ=255) aCTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACaa > 1:1578639/1‑150 (MQ=255) tGACCGCCTCGGTCATGGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCTACTGCGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGc < 1:987431/150‑1 (MQ=255) tGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGc < 2:843583/150‑1 (MQ=255) cGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCa > 1:231723/1‑150 (MQ=255) tCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCAtgct > 1:2321552/1‑150 (MQ=255) tCGGTCATAGAGCTTGAACGGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCAtgct < 2:1813014/150‑1 (MQ=255) tCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTa > 1:2091123/1‑103 (MQ=255) tCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTa < 2:2091123/103‑1 (MQ=255) cGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGtc < 2:2321552/150‑1 (MQ=255) cGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGtc < 2:231723/150‑1 (MQ=255) cGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGtc < 1:1018312/150‑1 (MQ=255) tGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGTCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTAc < 2:814017/101‑1 (MQ=255) tGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGTCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTAc > 1:814017/1‑101 (MQ=255) tGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGtctt < 2:2190391/150‑1 (MQ=255) gCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCAt > 1:514262/1‑103 (MQ=255) gCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCAt < 2:514262/103‑1 (MQ=255) ttGAACTGACACACAGCCCGGACGTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCGATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCGTTACCAACCCCTGGCCAAGCAGATTACCGACAAACTTCATGCTGCGGCGTgttctt > 2:264083/1‑150 (MQ=255) ttGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGtctc > 1:2270728/1‑84 (MQ=255) ttGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGtctc < 2:2270728/84‑1 (MQ=255) gAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTcc < 2:68722/150‑1 (MQ=255) aCTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCcac < 1:1504999/150‑1 (MQ=255) cgACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAg > 2:1771144/2‑150 (MQ=255) acaGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCTTTTTCTTCCACAGAACccg > 1:1284700/1‑150 (MQ=255) caGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACccgc < 1:251502/150‑1 (MQ=255) gCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACccgc > 1:1418572/1‑148 (MQ=255) gCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACccgc < 2:1418572/148‑1 (MQ=255) cTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCaa > 2:1314388/1‑150 (MQ=255) ccATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTg > 1:16742/1‑74 (MQ=255) ccATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTg < 2:16742/74‑1 (MQ=255) ccATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTa > 2:1306889/1‑150 (MQ=255) tGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCg > 2:432112/1‑150 (MQ=255) gCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTgg > 1:1350534/1‑67 (MQ=255) gCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTgg < 2:1350534/67‑1 (MQ=255) ccGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATgg > 2:824112/1‑35 (MQ=255) ccGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATgg < 1:824112/35‑1 (MQ=255) ccGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCa > 2:92702/1‑58 (MQ=255) ccGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCa < 1:92702/58‑1 (MQ=255) cgACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCtt < 1:1771144/150‑1 (MQ=255) cgACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCtt < 1:1492988/150‑1 (MQ=255) cgACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCtt < 2:1578639/150‑1 (MQ=255) gACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTg < 1:762580/150‑1 (MQ=255) acacTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTGa < 2:625826/150‑1 (MQ=255) tGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCAtgc > 1:1335899/1‑85 (MQ=255) tGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCAtgc < 2:1335899/85‑1 (MQ=255) tGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTg > 1:1415998/1‑145 (MQ=255) tGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTg < 2:1415998/145‑1 (MQ=255) tGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTGagcag < 2:1156321/150‑1 (MQ=255) gATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGTTCTCGCTTGACCATGCCTTGGCAACGCAGAGTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCCTCTTCTTCCACAGACCCCGCCGCTCGCCAGCCTAGCACTACCGAAAAACCTTGaccagc < 2:938770/150‑1 (MQ=255) tGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCATATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCtt > 2:795751/1‑141 (MQ=255) tGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCtt < 1:795751/141‑1 (MQ=255) ggcCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTcc < 2:539414/91‑1 (MQ=255) ggcCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTcc > 1:539414/1‑91 (MQ=255) | TTGACCCTCAGGCAGGCGCACTACTTGGCATGGGCGCATACCTGGCCGGTGTGACACGCTCGCCACTGACCGCCTCGGTCATCGTGCTTGAACTGACACACAGCCCGGACCTGGCCATTCCCATGTTGGCCGCGACACTGATGGCGGCGGCCATCTCTGGATGGGTGTCTCCGGTCTCGCTTTACCATGCCTTGGCCAAGCAGATTACCGACAAGCTTCATGCTGCCGCGTCTTCTTCCACAGAACCCGCCGCTCGCCAACCGAGCACTACCGAAAAACCTTGAGCAGC > NC_002947/4468878‑4469166 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |