| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 430,715 | G→C | 5.2% | L534L (CTC→CTG) | PP_0354 ← | CBS domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 430,715 | 0 | G | C | 5.2% | 465.3 / 11.3 | 144 | L534L (CTC→CTG) | PP_0354 | CBS domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (70/66); new base C (3/5); total (73/71) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.91e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 | |||||||||||
Only 100 of 145 total aligned reads displayed.
TCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGCCAGCAGGCCCTGGCGCAG > NC_002947/430566‑430861 | tCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCg > 2:2003813/1‑150 (MQ=255) aTAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTCGCGCGCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAg < 1:613101/150‑1 (MQ=255) ggcggcGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGt > 1:1047458/1‑150 (MQ=255) gcagcgcCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGtg > 2:1029146/4‑149 (MQ=255) ccGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCgccgcc < 2:1426414/150‑1 (MQ=255) ccAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTCGACCTCAAGGTCCAggg < 1:570667/138‑1 (MQ=255) ccAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTCGACCTCAAGGTCCAggg > 2:570667/1‑138 (MQ=255) ggTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGtt < 2:1541417/149‑1 (MQ=255) gTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGc > 1:2183075/1‑150 (MQ=255) ttagaaaaCGCCCTTGGATAACAATTGGCGCATGCGCTTCTTTGGTTTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCCTCCAC‑TAGCCGCGGCAACCCCGATAGCGTGAGGTCGATGGTCGCCGCCTTGTCGTTGcc > 2:1674826/8‑150 (MQ=255) ttCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGcc > 1:1086285/1‑150 (MQ=255) ttCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGcc > 1:280384/1‑150 (MQ=255) gATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTg > 2:1631090/1‑150 (MQ=255) gATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAACAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTg < 2:1070051/150‑1 (MQ=255) aTCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTCGACCTCAAGGTCCAgggcc < 2:1092113/129‑3 (MQ=255) tCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGc < 2:2183075/150‑1 (MQ=255) tCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGc > 1:422493/1‑150 (MQ=255) aCGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCgt > 2:1138834/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCa < 1:709761/150‑1 (MQ=255) ccTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCa > 1:1305623/1‑150 (MQ=255) ccTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCa < 1:669450/150‑1 (MQ=255) cTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAg < 1:1555773/150‑1 (MQ=255) ttGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGc > 2:1889851/1‑150 (MQ=255) cTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGa > 2:2084800/1‑150 (MQ=255) tACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTcgcc < 1:1743541/118‑1 (MQ=255) tACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTcgcc > 2:1743541/1‑118 (MQ=255) aCCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAAc < 1:1029146/150‑1 (MQ=255) cAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTc < 2:1204781/150‑1 (MQ=255) aGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGTGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTcg > 1:206373/1‑150 (MQ=255) gTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTcgc > 1:629191/1‑150 (MQ=255) cgcAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAAc < 2:280384/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAAc < 2:1305623/150‑1 (MQ=255) cgcAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAAc > 2:2195854/1‑150 (MQ=255) gcAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCgcgccaac > 2:360106/1‑146 (MQ=255) 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caggcagCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTTTCCTTGCCTTGGCTTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTgg < 1:1454510/150‑1 (MQ=255) aggcagCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGgc < 2:422493/150‑1 (MQ=255) gCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAgg < 1:1138834/150‑1 (MQ=255) cTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAgg < 2:1237595/149‑1 (MQ=255) tGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCa > 2:919389/1‑102 (MQ=255) tGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCa < 1:919389/102‑1 (MQ=255) 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aaaCGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCa < 2:874396/135‑1 (MQ=255) aaaCGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTgg > 1:1649927/1‑150 (MQ=255) gggCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCa < 1:785357/81‑1 (MQ=255) gggCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCa > 2:785357/1‑81 (MQ=255) gCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATg > 1:1049649/1‑150 (MQ=255) cACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTg < 2:300630/112‑1 (MQ=255) cACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTg > 1:300630/1‑112 (MQ=255) aCCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGCACTCGCGCAACCGGCCCAGAAACGCCCAGGGGGGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCg < 1:406197/150‑1 (MQ=255) aCCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAAc < 1:1553826/82‑1 (MQ=255) aCCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAAc > 2:1553826/1‑82 (MQ=255) aCCATCCAC‑GAACGGCGGCAGGCCCTGCACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCg < 2:483668/150‑1 (MQ=255) ccATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCgg < 1:2063700/150‑1 (MQ=255) aTCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGtt > 1:2079711/1‑150 (MQ=255) aC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGt < 2:1930343/118‑1 (MQ=255) aC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCg > 1:1482102/1‑150 (MQ=255) aC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCg > 2:1528343/1‑150 (MQ=255) c‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCgg > 1:795304/1‑150 (MQ=255) c‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTAGAGACAGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTGAGCACGAACTCGCGCAACCGGCGAACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTGAACCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCgg > 1:652949/1‑150 (MQ=255) gAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGc > 1:640559/1‑150 (MQ=255) aaGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCt < 1:1207344/150‑1 (MQ=255) gggCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGCCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTAc < 1:1889851/150‑1 (MQ=255) gCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTc > 2:579573/1‑70 (MQ=255) gTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGaa > 2:1269654/1‑128 (MQ=255) gTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGaa < 1:1269654/128‑1 (MQ=255) gTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCtgt < 1:2195854/150‑1 (MQ=255) cAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGc < 2:2036870/150‑1 (MQ=255) ccTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGCcagca > 2:1903424/1‑150 (MQ=255) ggACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTg > 2:1396234/1‑115 (MQ=255) ggACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTg < 1:1396234/115‑1 (MQ=255) ccTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGATGGTGTGGTTGTCGGCTACCTGTGCCAGCAGGCCCt < 1:1938809/150‑1 (MQ=255) ctcgAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGCCAGCAGGCCCTg < 1:1073274/147‑1 (MQ=255) gTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGCCAGCAGGCCCTGGCGCAg > 2:1255092/1‑150 (MQ=255) gTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCACAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGCCAGCAGGCCCTGGCGCAg > 2:577637/1‑150 (MQ=255) | TCATAGGCGGCGCCGTCCAACGGTTCGATCACGCCCTTGGCTACCAGTTGGCGCAGGCGCTCCAGGGTATTGCAGGCAGCTATGCCATTGGCCAGGGCCAGCAAACGGGCACCATCCAC‑GAAGGGCGTCAGGCCCTGGACCTTGAGGTCGAGGGTCGCCGCCTTGTCGTTGCCTTGGCGTGTCAGCACGAACTCGCGCAACCGGCCCACCGGCGGGCGTTGGCGCAGGGCGTTGTCAGCCATCATGCGCTGGAAGATGCGGTTGTCGGCTACCTGTGCCAGCAGGCCCTGGCGCAG > NC_002947/430566‑430861 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |