| Predicted mutation | |||||||
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| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 5,103,577 | 0 | C | A | 5.4% | 365.0 / 3.8 | 113 | intergenic (+143/‑246) | PP_5694/yhhS | hypothetical protein/carbohydrate efflux transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (55/51); new base A (4/3); total (59/54) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 115 total aligned reads displayed.
GAATAACTGCGCATCCCCGACTGTGTGAAAACGGCTGACCTGCGGGCTACCCCCGTCATCACGTTTTCACACCGTCTAAAATCAACGTTGTAACAACCCACTACCACCTGCCCCGCCCCTCTCCCACACAGACTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTACACC > NC_002947/5103429‑5103726 | gAATAACTGCGCATCCCCGACTGTGTGAAAACGGCTGACCTGCGGGCTACCCCCGTCATCACGTTTTCACACCGTCTAAAATCAACGTTGTAACAACCCACTACCACCTGCCCCGCCCCTCTCCCACACAGACTCGTGCCTCCTAACGCa > 1:834449/1‑150 (MQ=255)gAATAACTGCGCATCCCCGACTGTGTGAAAACGGCTGACCTGCGGGCTACCCCCGTCATCACGTTTTCACACCGTCTAAAATCAACGTTGTAACAACCCACTACCACCTGCCCCGCCCCTCTCCCACACAGACTCGTGCCTCCTAACGCa > 1:1922542/1‑150 (MQ=255)gAATAACTGCGCATCCCCGACTGTGTGAAAACGGCTGACCTGCGGGCTACCCCCGTCATCACGTTTTCACACCGTCTAAAATCAACGTTGTAACAACCCACTACCACCTGCCCCGCCCCTCTCCCACACAGACTCGTGCCTCCTAACGCa > 1:181839/1‑150 (MQ=255) 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acacaGACTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAgtg > 2:1734553/1‑150 (MQ=255) cacaGACTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAgtgt > 2:1890737/1‑150 (MQ=255) caGACTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGa < 2:2131219/150‑1 (MQ=255) aCTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAATCCGAGTTCAgtg < 2:587827/144‑1 (MQ=255) aCTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAATCCGAGTTCAgtg > 1:587827/1‑144 (MQ=255) gTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGAt > 1:476348/1‑150 (MQ=255) gTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGAt > 1:90170/1‑150 (MQ=255) ctcctAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTc < 1:1890737/150‑1 (MQ=255) cctAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGa < 2:476348/150‑1 (MQ=255) tAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGAtt < 1:1734553/150‑1 (MQ=255) tAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGAtt < 1:1580270/150‑1 (MQ=255) aCGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTa > 1:155786/1‑149 (MQ=255) aCGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTa < 2:155786/149‑1 (MQ=255) gCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTacac < 1:664448/150‑1 (MQ=255) gCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACCTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTacac > 2:1145783/1‑150 (MQ=255) cAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTACAcc < 1:836865/150‑1 (MQ=255) cAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTACAcc > 2:462849/1‑150 (MQ=255) | GAATAACTGCGCATCCCCGACTGTGTGAAAACGGCTGACCTGCGGGCTACCCCCGTCATCACGTTTTCACACCGTCTAAAATCAACGTTGTAACAACCCACTACCACCTGCCCCGCCCCTCTCCCACACAGACTCGTGCCTCCTAACGCAAAGAGGCAGAAATGCGCCAGCCGCTCAAGCGCTCGACGCCCTGCTGCATTCGTCCATGTTCACCCGATGGGCCGGCTTTGTCCTGCTGCGCTTGCGGCTGGATTACTTGCAAGCCGAGTTCAGTGTGACCTGGATGCTCGATTACACC > NC_002947/5103429‑5103726 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |