Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,512,951 | C→G | 5.3% | A180G (GCC→GGC) | urtD → | ABC transporter ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,512,951 | 0 | C | G | 5.3% | 269.8 / 4.9 | 87 | A180G (GCC→GGC) | urtD | ABC transporter ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (40/42); new base G (3/2); total (43/44) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.76e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.41e-01 |
TTCGAAGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTACCGCCGA > NC_002947/5512806‑5513092 | ttCGAAGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAg > 2:1827419/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAg > 1:751796/1‑150 (MQ=255) ttCGAAGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAg > 1:1487389/1‑150 (MQ=255) tCGACGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCCGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCCCCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAgc < 2:480080/150‑1 (MQ=255) tCGAAGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAgc > 1:2117957/1‑150 (MQ=255) cGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGGCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCGGGATCGGTGACATGAGCTAATGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCCCGAGGCCGGCtt > 1:1333342/1‑150 (MQ=255) tgtTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTCGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGc > 2:610411/1‑150 (MQ=255) gtTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCt < 2:2034070/150‑1 (MQ=255) cGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTc > 2:658507/1‑150 (MQ=255) gagaACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGCGCGGTGACCAGCGACAGCGCATCGAGGACGTGCTGGACACCTTGAGTCTGCTCCCGATGGCCCAGCGCCACGCCGGCTTTCTGtgg > 2:365141/1‑148 (MQ=255) agaNCCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCTGCGTTTCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCACCTTGCNTGGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGc < 1:1591946/150‑1 (MQ=255) aCCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATg < 2:1128462/150‑1 (MQ=255) ccTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGATGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATgg < 2:1373613/150‑1 (MQ=255) cTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATggg > 2:533104/1‑150 (MQ=255) cTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATggg > 1:695087/1‑150 (MQ=255) tGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGc > 1:25262/1‑150 (MQ=255) cTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCGGCGCGCCTGTGCGGTGGCCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCCGGCCACGCGCCAGGCCGGATTGCTCTGGCATGGGccgcag < 2:1311084/150‑6 (MQ=255) gcTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGtt > 2:1325839/1‑150 (MQ=255) cTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGATGGGCTGATTGAGAGCGATCTTGCGTACGCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCCTGGGCAGAAGCAGttt > 1:274192/1‑150 (MQ=255) tGAAGACAGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGACCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTc > 2:735401/1‑150 (MQ=255) aaGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTg < 2:542690/150‑1 (MQ=255) aaGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTg < 1:533104/150‑1 (MQ=255) cGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGAt > 1:2130259/1‑150 (MQ=255) aCAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCg < 2:1031750/150‑1 (MQ=255) aCAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCg < 1:782238/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCAt > 2:1931112/1‑150 (MQ=255) ggTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCAtgct > 1:2168047/1‑150 (MQ=255) gtgtGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCAtgctg < 1:947831/150‑1 (MQ=255) tgtgGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCATGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCAtgctgc > 2:554518/1‑150 (MQ=255) tgGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGctgctg < 2:1899349/150‑1 (MQ=255) tgGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGctgctg < 2:1333342/150‑1 (MQ=255) tgGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGctgctg < 2:1487389/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTgg < 1:962232/150‑1 (MQ=255) gggCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTgg < 2:815684/150‑1 (MQ=255) ccAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTCCCGGTGACCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGc > 2:1940123/1‑150 (MQ=255) cAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCa < 2:1151701/150‑1 (MQ=255) cAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCATGCGCCTGCTGCCGCTGGGCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCa < 1:510913/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAgg < 1:254314/150‑1 (MQ=255) gCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAgg < 2:666100/150‑1 (MQ=255) ccTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGa > 2:1671189/1‑150 (MQ=255) cTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAg > 1:1957826/1‑150 (MQ=255) gggcgcgcCCGGGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGTCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGc < 2:736809/148‑1 (MQ=255) ccGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGc < 1:658507/150‑1 (MQ=255) gcgcgcCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCaa < 1:38628/150‑1 (MQ=255) gcCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAActgc < 2:274192/150‑1 (MQ=255) cTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGTTGCCGCGGGCCCAGCGTCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGCGATCGGCATGCTGATGGTGCAGGAGCCGCTActgctg < 2:158002/150‑1 (MQ=255) tGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGACGCAGTTTCTGGACACCGGCATGCTGCTGGTGCATGAGCCGCAActgctgc < 2:25262/150‑1 (MQ=255) gCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACtgctgctgc < 1:316100/150‑1 (MQ=255) gTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTgctgctgctgg > 2:515044/1‑148 (MQ=255) ccagcgccagcgCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGa > 1:244438/1‑150 (MQ=255) cagcgccagcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAAct < 1:1764520/134‑1 (MQ=255) cagcgccagcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAAct > 2:1764520/1‑134 (MQ=255) cagcgccagcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGaa > 2:1237286/1‑150 (MQ=255) cagcgccagcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGaa > 1:1380090/1‑150 (MQ=255) agcgccagcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAAc < 2:2130259/150‑1 (MQ=255) gcgccagcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAAcc > 2:199804/1‑150 (MQ=255) agcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTgg < 2:695087/150‑1 (MQ=255) gcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCaa > 2:648627/1‑124 (MQ=255) gcgcATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCaa < 1:648627/124‑1 (MQ=255) gcATCGAGGACGTGCTGACCCCCCCGCGACCGCTGCTTCCACCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGAGCATAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCg < 1:1102652/150‑1 (MQ=255) cGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGTGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCAt < 2:2168047/150‑1 (MQ=255) ggACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGAc < 1:1827419/150‑1 (MQ=255) ggACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGAc > 1:1849104/1‑150 (MQ=255) gTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGAt > 2:2279557/1‑150 (MQ=255) gTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGAt > 1:2256498/1‑150 (MQ=255) gCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGt > 2:268588/1‑132 (MQ=255) gCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGt < 1:268588/132‑1 (MQ=255) gCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGc > 2:566100/1‑150 (MQ=255) cTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGcc < 2:2117957/150‑1 (MQ=255) accaccTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCgag > 2:804330/1‑150 (MQ=255) caccTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGc > 2:203460/1‑133 (MQ=255) caccTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGc < 1:203460/133‑1 (MQ=255) cccTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGAAGCCGTTACTTTTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTa < 2:1147305/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAAc < 1:495161/95‑1 (MQ=255) ccTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAAc > 2:495161/1‑95 (MQ=255) ctgctgCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTAcc > 2:1101741/1‑150 (MQ=255) tgctgcCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGAcc < 2:1062432/128‑1 (MQ=255) tgctgcCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGAcc > 1:1062432/1‑128 (MQ=255) tgctgcCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGaa < 2:1645341/143‑1 (MQ=255) tgctgcCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGaa > 1:1645341/1‑143 (MQ=255) gcctggcGCTGGGCCAGCGGCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTAccg > 2:2207670/7‑150 (MQ=255) ctggcGCTGGGCCAGCGGCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCAt < 1:1853934/118‑1 (MQ=255) ctggCGCTGGGCCAGCGGCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCAt > 2:1853934/1‑122 (MQ=255) ctggCGCTGGGCCAGCGGCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTAccgcc > 1:582240/1‑150 (MQ=255) gcCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTACCGCCGa < 1:1101741/150‑1 (MQ=255) cGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAAtt < 1:1753387/139‑1 (MQ=255) cGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAAtt > 2:1753387/1‑139 (MQ=255) | TTCGAAGCGCTGACCGTGTTCGAGAACCTGGAGCTGGCGCTGAAGACCGACAAGTCGGTGTGGGCCAGCCTGGCCGCGCGCCTGAGCGGTGACCAGCGCCAGCGCATCGAGGACGTGCTGACCACCTTGCGCCTGCTGCCGCTGGCCCAGCGCCAGGCCGGCTTGCTGTCGCATGGGCAGAAGCAGTTTCTGGAGATCGGCATGCTGCTGGTGCAGGAGCCGCAACTGCTGCTGCTCGATGAACCGGTGGCCGGCATGACCGATGCCGAGACCGAATTTACCGCCGA > NC_002947/5512806‑5513092 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |