Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,558,426 | T→G | 5.1% | K293T (AAG→ACG) | purA ← | adenylosuccinate synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,558,426 | 0 | T | G | 5.1% | 225.1 / 3.7 | 80 | K293T (AAG→ACG) | purA | adenylosuccinate synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (34/41); new base G (2/2); total (37/43) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.17e-01 |
ATGGTTTCCAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTG > NC_002947/5558279‑5558575 | aTGGTTTCCAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTg < 2:1406309/150‑1 (MQ=255) aTGGTTTCCAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTg < 2:1956391/150‑1 (MQ=255) tGGTTTCCAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTgg > 1:731400/1‑150 (MQ=255) gTTTCCAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGCTGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATGACGGCATCGCACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGGGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGcc > 1:197985/1‑150 (MQ=255) ttCCAGGCCGTCCAGTACGTCGAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCaa < 2:141093/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGCACTCTTGGCCAAGCGTGGCCacga < 1:1471924/150‑4 (MQ=255) aGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTa > 2:712554/1‑150 (MQ=255) aGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTa < 1:805058/150‑1 (MQ=255) gCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGc < 2:197150/141‑1 (MQ=255) gCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGc > 1:197150/1‑141 (MQ=255) gCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGc > 2:1062663/1‑150 (MQ=255) cGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCAc > 2:1917260/1‑150 (MQ=255) cAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCTTGGCCAAGCGTGGCCac < 1:2209618/138‑2 (MQ=255) cAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCTTGGCCAAGCGTGGCCac > 2:2209618/1‑137 (MQ=255) cAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGt > 1:2094241/1‑150 (MQ=255) aGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGtc > 1:793633/1‑150 (MQ=255) aGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGtc < 1:924865/150‑1 (MQ=255) gTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGtct > 1:2105230/1‑150 (MQ=255) tACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGtctc > 1:1882713/1‑150 (MQ=255) gTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCtcgtc < 1:1062663/150‑1 (MQ=255) tCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCtcgtcg > 1:601785/1‑150 (MQ=255) cAGTTTGTTCATGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGaa < 2:1882713/150‑1 (MQ=255) aGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAAc > 1:333242/1‑150 (MQ=255) gCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCtt < 2:1869158/121‑1 (MQ=255) gCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCtt > 1:1869158/1‑121 (MQ=255) gTCAGGCAGATGCCGGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTtcg < 2:1070645/150‑1 (MQ=255) tCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTtcgg > 2:370939/1‑150 (MQ=255) tCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCAGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTtcgg > 1:747951/1‑150 (MQ=255) cAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTtcggt < 2:2105230/150‑1 (MQ=255) aTGACCGAGATCCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGATGGTCGAACCGAACTAGTGGACCCGCTCGGACCAGGTAGCCCCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAAc < 1:1917260/150‑1 (MQ=255) cccGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGa > 2:2051076/1‑150 (MQ=255) gagaTGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCg < 1:798495/150‑1 (MQ=255) gagaTGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCg > 1:979242/1‑150 (MQ=255) tGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAg < 2:1642974/101‑1 (MQ=255) tGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAg > 1:1642974/1‑101 (MQ=255) tGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCa < 2:1111039/150‑1 (MQ=255) tGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGATTCGGCCAGGCTCGCCAACACCGCACGGTTCTAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCa > 1:1686818/1‑150 (MQ=255) aCGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCaa > 2:303665/1‑95 (MQ=255) aCGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCaa < 1:303665/95‑1 (MQ=255) aCGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGAATCGCCCCCGCGGGCCTGGAGCTGACGGGCGGTGGTGGAACCGCACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGa < 1:2271543/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgt < 2:2022122/150‑1 (MQ=255) gTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgt > 2:1316122/1‑150 (MQ=255) tagATGGCGCGACGCAGTTTCACTGTATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgtg < 2:1298441/148‑1 (MQ=255) tCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgtg < 2:333242/150‑1 (MQ=255) tCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgtg > 2:1559303/1‑150 (MQ=255) gATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgtggt > 2:1185569/1‑150 (MQ=255) aTGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAAATACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAgtggtg < 1:712554/150‑1 (MQ=255) gcgACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGc < 1:1786796/150‑1 (MQ=255) gcgACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGc < 1:770764/150‑1 (MQ=255) gcgACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGc > 2:770764/1‑150 (MQ=255) cGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTg < 2:2094241/150‑1 (MQ=255) gCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTgg > 1:1149493/1‑150 (MQ=255) gCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTgg > 1:139795/1‑150 (MQ=255) gCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTgg < 1:1585686/150‑1 (MQ=255) gCAGAATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTgg < 2:139795/150‑1 (MQ=255) gATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGAt > 2:1832216/1‑150 (MQ=255) tCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACATTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGTCCTTGGCGATAc > 2:911578/1‑150 (MQ=255) tCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGa < 2:655895/128‑1 (MQ=255) tCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGa > 1:655895/1‑128 (MQ=255) aCGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGt < 2:644330/74‑1 (MQ=255) aCGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGt > 1:644330/1‑74 (MQ=255) cGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGa < 2:979242/150‑1 (MQ=255) cGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGa < 2:731400/150‑1 (MQ=255) gCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAgg < 2:793633/150‑1 (MQ=255) cATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGa < 2:1588244/150‑1 (MQ=255) aTCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGAt < 2:747951/150‑1 (MQ=255) tCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATg < 1:370939/150‑1 (MQ=255) aaCCACCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAATGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAg < 2:1225565/150‑1 (MQ=255) 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aCCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAgg < 1:565498/121‑1 (MQ=255) aCCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAgg > 2:565498/1‑121 (MQ=255) aCCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGa > 2:1795165/1‑150 (MQ=255) ccGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAGGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTtc < 2:1663068/53‑1 (MQ=255) ccGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTtc > 1:1663068/1‑53 (MQ=255) gAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCg < 2:2179937/115‑1 (MQ=255) gAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCg > 1:2179937/1‑115 (MQ=255) accttGGCCAAGCGTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATacc > 2:2253968/5‑150 (MQ=255) cACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAg > 1:1305340/1‑150 (MQ=255) ttGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAgtggtg > 1:1955953/1‑150 (MQ=255) | ATGGTTTCCAGGCCGTCCAGTACGTCCAGCTTGGTCAGGCAGATGCCCGAGATGCTGTTGACGTCGATGGCGCGACGCAGGATCACGGCATCGAACCAGCCGCAACGACGGGCACGGCCGGTGGTGGAACCGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTG > NC_002947/5558279‑5558575 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |