New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4586063 = | 144 (0.490) | 47 (0.220) | 21/216 | 14.4 | 35.3% | intergenic (+102/+115) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
? | NC_002947 | 4586167 = | 66 (0.300) | intergenic (+206/+11) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. |
Only 100 of 144 total aligned reads displayed.
CCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCA > NC_002947/4585914‑4586175 | ccgACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCgg < 2:5534373/150‑1 (MQ=255) gACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGggc < 1:3839562/150‑1 (MQ=255) gACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGggc < 2:3307631/150‑1 (MQ=255) cAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGggccg < 1:2074659/150‑1 (MQ=255) gTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGggccggc < 2:2969700/150‑1 (MQ=255) gTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGggccggc < 2:26255/150‑1 (MQ=255) gTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGggccggc < 2:542755/150‑1 (MQ=255) gCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCctct < 1:5116595/150‑1 (MQ=255) gACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTc < 2:533287/150‑1 (MQ=255) cccGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTcg‑c < 2:1474297/150‑1 (MQ=255) ccgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTcg‑cg > 2:530223/1‑150 (MQ=255) ccgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTcg‑cg < 1:3115145/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cgg < 1:1460278/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cgg < 1:3877790/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cgg < 1:5553977/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cgg < 1:5801721/150‑1 (MQ=255) cgccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCGTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cgg < 2:4867758/150‑1 (MQ=255) gccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACCGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cggg < 2:4041934/150‑1 (MQ=255) gccgAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑Cggg < 1:4552858/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTaaa < 2:4796448/150‑1 (MQ=255) aGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTaaa < 2:4796468/150‑1 (MQ=255) gCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAc < 1:5999202/150‑1 (MQ=255) gCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAc < 1:3837979/150‑1 (MQ=255) cAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAccc < 2:4473078/150‑1 (MQ=255) cAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCGCGTCG‑CGGGTGAAacc > 2:1900715/1‑150 (MQ=255) tgAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGc < 1:1781644/149‑1 (MQ=255) ggAGCCACCGGTGAAGGCTTATGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTTCTCCATTGAATGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGTAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAATCCCGc < 1:3107693/150‑1 (MQ=255) ggAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGc < 2:3804459/150‑1 (MQ=255) aGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTc < 1:2391655/150‑1 (MQ=255) cACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTa > 1:5466913/1‑150 (MQ=255) aCCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTAc < 2:5311143/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCa < 2:2130780/150‑1 (MQ=255) cGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCa < 2:6155751/150‑1 (MQ=255) ggTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCGCCGACCAg > 2:3739423/1‑150 (MQ=255) gTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 2:300178/150‑1 (MQ=255) gTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCCGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg < 2:300270/150‑1 (MQ=255) aaGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGAc < 2:3766096/150‑1 (MQ=255) aGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGAcc < 2:350/150‑1 (MQ=255) aGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGAcc < 2:5788880/150‑1 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGc < 1:634542/150‑1 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGc < 1:634821/150‑1 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGc < 1:634655/150‑1 (MQ=255) tAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGcc < 1:5572731/150‑1 (MQ=255) ggTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGcc < 1:2323024/150‑1 (MQ=255) gTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCCgcatt < 1:4490018/150‑5 (MQ=255) tAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCtt < 1:11928/150‑1 (MQ=255) aGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTg < 1:4406437/150‑1 (MQ=255) aGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTg < 1:4406436/150‑1 (MQ=255) aCCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGaa < 1:4245932/150‑1 (MQ=255) ggCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATg‑cgg < 2:5693825/150‑1 (MQ=255) gCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCCGGGACCGTGCCGGCCTTGAATg‑cggc < 2:4621924/150‑1 (MQ=255) gCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATg‑cggc < 2:4621919/150‑1 (MQ=255) ccGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCt < 1:3291227/150‑1 (MQ=255) gCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAgg > 2:2871868/1‑120 (MQ=255) gCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGcc < 1:5340455/150‑1 (MQ=255) cGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGccc < 1:5141024/150‑1 (MQ=255) cGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGccc < 2:6393036/150‑1 (MQ=255) gTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGcccc < 2:6412815/150‑1 (MQ=255) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCgg < 1:4275561/128‑1 (MQ=255) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCgg > 2:4275561/1‑128 (MQ=255) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCt < 1:2977154/150‑1 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGTCCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTgg < 1:5047316/150‑1 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGTCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTgg < 1:1944657/150‑1 (MQ=255) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTgg < 1:53612/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGt < 2:2367224/150‑1 (MQ=255) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGt < 1:4866901/150‑1 (MQ=255) cAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTa < 1:5196924/150‑1 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGa < 2:3185072/150‑1 (MQ=18) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGa < 1:2521454/150‑1 (MQ=255) cTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGa < 1:2800153/150‑1 (MQ=255) aTCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGGAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCg < 1:6101974/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCTTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 2:2742152/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCgg < 1:119600/150‑1 (MQ=17) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCgg < 1:3058168/150‑1 (MQ=17) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCgg < 1:944507/150‑1 (MQ=17) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:4973574/150‑1 (MQ=18) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 2:1654946/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:2152693/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 2:4867152/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:327924/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:4046283/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:6464535/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 1:1246708/150‑1 (MQ=255) tCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg < 2:3826725/150‑1 (MQ=255) cTGCGCTGCTACTTTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCTTTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTATGAGCggg < 2:3442079/150‑1 (MQ=255) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGt < 1:6115446/150‑1 (MQ=255) gcgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGtt < 1:3134917/150‑1 (MQ=255) gctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTCCCAGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:6076552/150‑1 (MQ=17) gctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:2139982/150‑1 (MQ=255) gctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:123863/150‑1 (MQ=255) gctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:1242962/150‑1 (MQ=255) tCCATTGAAAGGTTGAGGATGACGGGGTGCTTGGCATGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCCGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCGGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc < 1:3868303/150‑1 (MQ=255) cctttGAACGGTTGTGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCCGGGGCAGCGCC‑GCATTCAAGGCCGGCACGGTCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg < 2:4969816/147‑1 (MQ=11) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCggg < 1:2116595/134‑1 (MQ=255) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCggg > 2:2116595/1‑134 (MQ=255) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCggg > 2:2116580/1‑134 (MQ=255) ccgtGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCGCTTCGCCGGGGAAACCC‑CACCTACCCCGGCCCCGGCCGGCCGGGGAAT‑CGGCGCGGGCCCCGGGGGGCGCGGGGTTAACCGCCCAGAggcccgccccc > 2:2551304/4‑147 (MQ=255) ccGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAACCGCACCTAACAGGGGCCCTGCCGGCCGTGAATT‑CGGCCCGGCCCCCGGGAGGGGCGGGGTTACCCCCGGAGAGGCCGGCCGCGCCCGca > 2:4755845/1‑150 (MQ=25) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAc < 2:4973319/117‑1 (MQ=255) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAc > 1:4973319/1‑117 (MQ=255) | CCGACAGTGGGCGACCCGCCGAGCCAGGAGCCACCGGTGAAGGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCAGGGACCGTGCCGGCCTTGAATG‑CGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCA > NC_002947/4585914‑4586175 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |