Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_002947 3969345–3970012 3971565–3970916 905–2221 68 [67] [66] 70 PP_3499–[PP_3501] PP_3499,PP_3500,[PP_3501]

GCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCG  >  NC_002947/3969220‑3969389
                                                                                                                            |                                             
gCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATc                                               <  1:4909803/125‑1 (MQ=255)
  ttCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCAc                                             <  1:4909808/125‑1 (MQ=255)
   tCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCAcc                                            >  1:4910167/1‑125 (MQ=255)
    ccTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGAAGCGATCAccc                                           <  1:4909810/125‑1 (MQ=255)
     cTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCAGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCt                                          >  1:4910134/1‑125 (MQ=255)
       cGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTa                                        <  1:4909812/125‑1 (MQ=255)
        gAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTa                                        >  1:4910072/1‑124 (MQ=255)
        gAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTAt                                       >  1:4910186/1‑125 (MQ=255)
        gAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTAt                                       <  1:4909814/125‑1 (MQ=255)
        gAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTAt                                       <  1:4909815/125‑1 (MQ=255)
         aaTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCTAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTAt                                       <  1:4909820/124‑1 (MQ=255)
         aaTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTTTc                                      <  1:4909819/125‑1 (MQ=255)
         aaTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTAt                                       >  1:4910144/1‑124 (MQ=255)
          aTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATc                                      >  1:4910129/1‑124 (MQ=255)
            aGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGcc                                   >  1:4910133/1‑125 (MQ=255)
             ggCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCa                                  <  1:4909824/125‑1 (MQ=255)
             ggCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCa                                  >  1:4910078/1‑125 (MQ=255)
              gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCAGCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAg                                 <  1:4909826/125‑1 (MQ=255)
              gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAg                                 <  1:4909828/125‑1 (MQ=255)
               ccTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAgg                                >  1:4910060/1‑125 (MQ=255)
               ccTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAgg                                <  1:4909830/125‑1 (MQ=255)
               ccTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAgg                                >  1:4910130/1‑125 (MQ=255)
                cTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGa                               >  1:4910169/1‑125 (MQ=255)
                 tGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAt                              <  1:4909832/125‑1 (MQ=255)
                  gATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAtt                             >  1:4910091/1‑125 (MQ=255)
                   aTACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAttt                            >  1:4910096/1‑125 (MQ=255)
                   aTACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAttt                            <  1:4909834/125‑1 (MQ=255)
                    tACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAttt                            >  1:4910166/1‑124 (MQ=255)
                    tACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACCCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTc                           >  1:4910099/1‑125 (MQ=255)
                     aCATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCt                          >  1:4910199/1‑125 (MQ=255)
                     aCATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGGCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCt                          <  1:4909839/125‑1 (MQ=255)
                       aTAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTAt                        <  1:4909842/125‑1 (MQ=255)
                        tAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATg                       >  1:4910085/1‑125 (MQ=255)
                        tAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATg                       >  1:4910138/1‑125 (MQ=255)
                        tAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATg                       >  1:4910168/1‑125 (MQ=255)
                         aGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCTAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATg                       <  1:4909845/124‑1 (MQ=255)
                          gATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATgc                      >  1:4910156/1‑124 (MQ=255)
                          gATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCACCAGGATTTCTATgc                      >  1:4910094/1‑124 (MQ=255)
                           aTGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATgcgc                    <  1:4909847/125‑1 (MQ=255)
                           aTGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTCCTATgcgc                    >  1:4910063/1‑125 (MQ=255)
                            tGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGcc                   >  1:4910109/1‑125 (MQ=255)
                            tGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGcc                   >  1:4910189/1‑125 (MQ=255)
                            tGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGcc                   <  1:4909850/125‑1 (MQ=255)
                              cAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCaa                 <  1:4909853/125‑1 (MQ=255)
                                aCCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCa                  >  1:4910135/1‑122 (MQ=255)
                                aCCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACg               >  1:4910067/1‑125 (MQ=255)
                                 ccGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGa              <  1:4909854/125‑1 (MQ=255)
                                 ccGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGAGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGa              >  1:4910074/1‑125 (MQ=255)
                                  cGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGaa             <  1:4909855/125‑1 (MQ=40)
                                   gggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGa              >  1:4910116/1‑123 (MQ=40)
                                   gggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAg            <  1:4909856/125‑1 (MQ=40)
                                    ggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc           >  1:4910184/1‑125 (MQ=39)
                                    ggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc           <  1:4909858/125‑1 (MQ=39)
                                    ggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc           <  1:4909860/125‑1 (MQ=39)
                                    ggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc           <  1:4909861/125‑1 (MQ=39)
                                     gTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGct          <  1:4909863/125‑1 (MQ=38)
                                      ttCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGctc         <  1:4909864/125‑1 (MQ=37)
                                      ttCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGct          >  1:4910131/1‑124 (MQ=37)
                                       tCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGctct        <  1:4909866/125‑1 (MQ=35)
                                        ccTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCtt       <  1:4909867/125‑1 (MQ=35)
                                          tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTAt     >  1:4910043/1‑125 (MQ=33)
                                          tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTAt     <  1:4909870/125‑1 (MQ=33)
                                           aTGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATc    >  1:4910050/1‑125 (MQ=32)
                                           aTGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATc    <  1:4909871/125‑1 (MQ=32)
                                            tGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATcc   >  1:4910201/1‑125 (MQ=31)
                                            tGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATcc   <  1:4909872/125‑1 (MQ=31)
                                             ggTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCg  <  1:4909876/125‑1 (MQ=11)
                                             ggTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCg  <  1:4909875/125‑1 (MQ=11)
                                                                                                                            |                                             
GCTTCCTCGAATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCCG  >  NC_002947/3969220‑3969389

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: