| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,499,508 | +C | intergenic (+85/‑79) | trpS → / → zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,499,506 | 1 | . | C | 97.9% | 120.8 / ‑1.1 | 97 | intergenic (+83/‑81) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (48/47); total (49/48) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 101 total aligned reads displayed.
TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGTT‑T‑CGGGCAC‑G‑CC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACG > NC_002947/1499383‑1499624 | ttCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAc‑g > 1:1391993/1‑125 (MQ=25) gagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCACGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAc‑g‑cccg > 1:1391842/1‑123 (MQ=21) gCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAc‑g‑cccg > 1:1392026/1‑121 (MQ=21) ccTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAc‑g‑cccgctc < 1:1391712/125‑6 (MQ=21) cTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTcc > 1:1391935/1‑125 (MQ=18) tGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTcc > 1:1391731/1‑124 (MQ=18) tGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTccc > 1:1391922/1‑125 (MQ=18) gAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTccc > 1:1391861/1‑124 (MQ=18) gAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTccc < 1:1391715/120‑1 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAg > 1:1391786/1‑123 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGAc > 1:1391869/1‑125 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGAACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAg > 1:1391982/1‑123 (MQ=18) cTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTg > 1:1392234/1‑123 (MQ=18) cTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGAt > 1:1391874/1‑125 (MQ=18) cTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGAt < 1:1391717/125‑1 (MQ=18) gCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCAGTCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCACAC‑CC‑GCTCCCACAGACGGATTGcc > 1:1391859/1‑125 (MQ=18) caccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGAc > 1:1392114/1‑116 (MQ=17) caccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCa < 1:1391720/125‑1 (MQ=18) caccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCa < 1:1391719/125‑1 (MQ=18) accacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCAt > 1:1391926/1‑125 (MQ=18) accacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 1:1391721/125‑1 (MQ=18) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCAtt > 1:1391899/1‑125 (MQ=18) ccacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCAtt < 1:1391724/125‑1 (MQ=18) cagcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAg > 1:1392040/1‑125 (MQ=18) gcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCg > 1:1391879/1‑125 (MQ=18) agGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCggg < 1:1391727/125‑1 (MQ=18) ggACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCggg < 1:1391728/124‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1391734/125‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1391733/125‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCt < 1:1391732/124‑1 (MQ=18) tGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1391735/124‑1 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc > 1:1392006/1‑125 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 1:1392065/1‑125 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 1:1391932/1‑125 (MQ=18) ggCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 1:1391737/125‑1 (MQ=18) ggCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg < 1:1391738/124‑1 (MQ=18) gCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTAc < 1:1391739/124‑1 (MQ=18) cAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt < 1:1391742/125‑1 (MQ=18) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTg > 1:1392097/1‑125 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGGAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:1391744/125‑1 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:1391745/125‑1 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:1391743/125‑1 (MQ=18) cGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACg > 1:1391955/1‑125 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:1391750/121‑1 (MQ=17) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGc < 1:1391749/125‑1 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGc > 1:1391957/1‑125 (MQ=18) ggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCg > 1:1391951/1‑119 (MQ=18) cGTGCGCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACGGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttg < 1:1391753/124‑1 (MQ=21) tGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgtt > 1:1391989/1‑124 (MQ=21) gCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGc < 1:1391758/125‑1 (MQ=21) gCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgttg < 1:1391756/124‑1 (MQ=21) cccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGcc < 1:1391760/125‑1 (MQ=21) ccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCt < 1:1391761/125‑1 (MQ=25) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGTTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑G‑CCTGCTCGCACAGACTGTTTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCg < 1:1391763/111‑1 (MQ=21) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTc > 1:1392067/1‑125 (MQ=25) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgttg < 1:1391764/121‑1 (MQ=21) gcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTc > 1:1391999/1‑124 (MQ=25) gcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTc > 1:1392060/1‑124 (MQ=25) gcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCg > 1:1391907/1‑125 (MQ=25) gcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCt < 1:1391766/123‑1 (MQ=25) gcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCg < 1:1391768/125‑1 (MQ=25) cgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTGCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTc > 1:1391901/1‑123 (MQ=25) gAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCGCAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgt < 1:1391769/116‑1 (MQ=21) gAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCt < 1:1391770/125‑1 (MQ=25) aaaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa > 1:1392123/1‑125 (MQ=25) aaaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa < 1:1391771/125‑1 (MQ=25) aaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTaa > 1:1392018/1‑125 (MQ=25) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CTGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGCGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAAc > 1:1392011/1‑125 (MQ=25) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTaa > 1:1392182/1‑124 (MQ=25) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa < 1:1391772/123‑1 (MQ=25) 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gcgcCGCGGCGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCg > 1:1392258/1‑101 (MQ=18) cgccgcGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATc < 1:1391778/125‑1 (MQ=25) cgccgcGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTGGCCTCGCTAACGAATc > 1:1392185/1‑125 (MQ=25) cgcgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATg > 1:1392007/1‑125 (MQ=25) gcgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGa < 1:1391781/125‑1 (MQ=25) gcgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCa < 1:1391780/122‑1 (MQ=25) cgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc > 1:1391948/1‑125 (MQ=25) cgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc < 1:1391782/125‑1 (MQ=25) ggTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc > 1:1392008/1‑124 (MQ=25) gTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTc < 1:1391787/125‑1 (MQ=37) tggcaccGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTa > 1:1391995/7‑125 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTccc > 1:1391952/5‑120 (MQ=37) ccGGCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAAc < 1:1391794/123‑1 (MQ=38) ggCTTTGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCt < 1:1391797/125‑1 (MQ=38) gCTTTGCCGGTGTTCG‑CGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTa < 1:1391798/125‑1 (MQ=38) gCTTTGCCCGTGTTCG‑TGGGCAC‑GCCC‑GCTCCAACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTCCAGTGACGGCCCGTCTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTc > 1:1392166/1‑112 (MQ=255) ttGCCGGTGTT‑CGCGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCa < 1:1391800/125‑1 (MQ=39) tcgcGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTg < 1:1391807/122‑1 (MQ=255) gcGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaa > 1:1391881/2‑125 (MQ=255) gcGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaa > 1:1392020/2‑125 (MQ=255) cGGGCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaaa > 1:1392044/1‑125 (MQ=255) ggCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaaa < 1:1391813/123‑1 (MQ=255) ggCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAAc > 1:1391970/1‑124 (MQ=255) ggCAC‑GCCC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACg > 1:1392077/1‑125 (MQ=255) | TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGTT‑T‑CGGGCAC‑G‑CC‑GCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACG > NC_002947/1499383‑1499624 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |