Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_002947	3969354–3970058	3971581–3970889	832–2228	50 [47]	[47] 49	PP_3499–[PP_3501]	PP_3499,PP_3500,[PP_3501]

AATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCC  >  NC_002947/3969229‑3969388                                                                                                                             |                                    aaTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATc                                     >  1:3369118/1‑125 (MQ=255) aaTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATc                                     >  1:3369062/1‑125 (MQ=255) aaTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATc                                     >  1:3369010/1‑125 (MQ=255)  aTAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCg                                    >  1:3369049/1‑125 (MQ=255)   tAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCAAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGc                                   >  1:3369145/1‑125 (MQ=255)    aGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCg                                    <  1:3368873/123‑1 (MQ=255)    aGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGc                                   >  1:3369123/1‑124 (MQ=255)     ggCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCa                                 <  1:3368874/125‑1 (MQ=255)     ggCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCa                                 >  1:3369076/1‑125 (MQ=255)      gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCGAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAg                                <  1:3368876/125‑1 (MQ=255)      gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCat                                <  1:3368875/125‑2 (MQ=255)      gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAg                                >  1:3369099/1‑125 (MQ=255)      gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAg                                >  1:3369096/1‑125 (MQ=255)      gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAg                                >  1:3369074/1‑125 (MQ=255)      gCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACACCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACACGAACACCCTTCTCg                                    >  1:3368984/1‑121 (MQ=255)        cTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGa                              >  1:3369146/1‑125 (MQ=255)          gATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAtt                            <  1:3368879/125‑1 (MQ=255)          gATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAtt                            <  1:3368880/125‑1 (MQ=255)             aCATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAttt                           <  1:3368881/123‑1 (MQ=255)              cATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTa                        >  1:3369081/1‑125 (MQ=255)              cATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTa                        <  1:3368882/125‑1 (MQ=255)               aTAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCt                         <  1:3368883/123‑1 (MQ=255)                tAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATg                      >  1:3369141/1‑125 (MQ=255)                 aGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATgc                     <  1:3368885/125‑1 (MQ=255)                  gATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATgcg                    <  1:3368886/125‑1 (MQ=255)                  gATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGCTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCAAGGATTTCTATgcg                    >  1:3369129/1‑125 (MQ=255)                   aTGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATgcgc                   <  1:3368887/125‑1 (MQ=255)                   aTGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATgcgc                   <  1:3368888/125‑1 (MQ=255)                    tGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGcc                  >  1:3369073/1‑125 (MQ=255)                      cAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCaa                <  1:3368889/125‑1 (MQ=255)                       aaCCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAAc               >  1:3369069/1‑125 (MQ=255)                        aCCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGa                              >  1:3369136/1‑109 (MQ=255)                        aCCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCa                 >  1:3369105/1‑122 (MQ=255)                         ccGTGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGCACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTGTATGCGCCAACGa             >  1:3369126/1‑125 (MQ=255)                         ccGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGa             >  1:3369095/1‑125 (MQ=255)                         ccGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGa             <  1:3368892/125‑1 (MQ=255)                         ccGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGa             >  1:3369086/1‑125 (MQ=255)                           gggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATT‑AGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGAttt                           >  1:3369142/1‑108 (MQ=255)                            ggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc          <  1:3368897/125‑1 (MQ=39)                            ggTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc          >  1:3369120/1‑125 (MQ=39)                             gTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc          >  1:3369119/1‑124 (MQ=38)                             gTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGc          >  1:3369064/1‑124 (MQ=38)                               tCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGctc        <  1:3368904/124‑1 (MQ=35)                               tCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGcgct       <  1:3368903/125‑1 (MQ=25)                                  tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTAt    <  1:3368905/125‑1 (MQ=33)                                  tATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTAt    >  1:3369140/1‑125 (MQ=33)                                   aTGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATc   <  1:3368908/125‑1 (MQ=32)                                   aTGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATc   <  1:3368909/125‑1 (MQ=32)                                    tGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATcc  >  1:3369065/1‑125 (MQ=31)                                    tGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTGCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATcc  >  1:3369051/1‑125 (MQ=14)                                                                                                                             |                                    AATAGGCCTGATACATAGATGCAACCGGGTTCCTATGGTAAGCGTCCGGCGAACTCACCTTCCGAACTCCAGCATTAAGGGCGATGGTGTCCGCGTATTTTTAAGCGGACGCGATCACCCTTATCGCCAGGATTTCTATGCGCCAACGAAGCTCTTATCC  >  NC_002947/3969229‑3969388

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑