Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ NC_002947 5307633–5308391 5310717–5309064 674–3085 113 [110] [109] 114 PP_23SG PP_23SG

Only 100 of 113 total aligned reads displayed.

GAGTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCTTGGGT  >  NC_002947/5307508‑5307691
                                                                                                                            |                                                           
gAGTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAg                                                             <  1:4548381/125‑1 (MQ=33)
gAGTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTACAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAg                                                             >  1:4548635/1‑125 (MQ=18)
  gTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGc                                                            <  2:4548385/124‑1 (MQ=32)
  gTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCa                                                           >  1:4548530/1‑125 (MQ=32)
  gTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCa                                                           >  1:4548581/1‑125 (MQ=32)
  gTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCa                                                           >  1:4548609/1‑125 (MQ=33)
  gTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCa                                                           <  1:4548383/125‑1 (MQ=33)
  gTTCGGGATGGGACCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCa                                                           <  1:4548384/125‑1 (MQ=17)
   ttCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCAc                                                          >  2:4548539/1‑125 (MQ=33)
   ttCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCAc                                                          <  2:4548386/125‑1 (MQ=33)
   ttCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCAc                                                          <  1:4548387/125‑1 (MQ=33)
    tCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCAc                                                          <  2:4548388/124‑1 (MQ=32)
    tCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACg                                                         >  2:4548634/1‑125 (MQ=33)
    tCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACg                                                         <  1:4548389/125‑1 (MQ=33)
       ggatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGa                                                        >  1:4548676/1‑123 (MQ=32)
       ggatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAt                                                      >  1:4548625/1‑125 (MQ=32)
        gatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtt                                                     >  2:4548563/1‑125 (MQ=32)
        gatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtt                                                     >  2:4548473/1‑125 (MQ=32)
        gatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtt                                                     >  2:4548656/1‑125 (MQ=33)
        gatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtt                                                     <  2:4548392/125‑1 (MQ=32)
        gatgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtt                                                     <  1:4548391/125‑1 (MQ=32)
         atgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAttt                                                    >  1:4548578/1‑125 (MQ=33)
         atgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAttt                                                    >  1:4548571/1‑125 (MQ=32)
          tgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtttt                                                   <  1:4548393/125‑1 (MQ=33)
          tgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtttt                                                   >  2:4548522/1‑125 (MQ=33)
          tgggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAAtttt                                                   <  1:4548394/125‑1 (MQ=32)
           gggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACg                                                         <  2:4548396/118‑1 (MQ=32)
           gggatCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTc                                                  <  2:4548395/125‑1 (MQ=32)
               tCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGt                                              >  1:4548595/1‑125 (MQ=32)
               tCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGt                                              <  2:4548398/125‑1 (MQ=32)
                cAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTc                                             <  1:4548400/125‑1 (MQ=32)
                 aGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCt                                            <  1:4548401/125‑1 (MQ=32)
                 aGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCt                                            >  2:4548621/1‑125 (MQ=33)
                  ggtggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCtt                                           >  2:4548566/1‑125 (MQ=32)
                  ggtggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCtt                                           <  1:4548402/125‑1 (MQ=33)
                  ggtggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCtt                                           >  2:4548632/1‑125 (MQ=32)
                   gtggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATCCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCtt                                           <  2:4548403/124‑1 (MQ=17)
                    tggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTc                                         <  1:4548404/125‑1 (MQ=33)
                    tggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTc                                         >  1:4548546/1‑125 (MQ=32)
                     ggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCt                                            <  2:4548407/121‑1 (MQ=33)
                     ggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCg                                        <  1:4548405/125‑1 (MQ=32)
                     ggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCg                                        <  1:4548406/125‑1 (MQ=32)
                     ggtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCg                                        <  2:4548408/125‑1 (MQ=33)
                      gtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGt                                       <  1:4548409/125‑1 (MQ=32)
                      gtTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGt                                       <  2:4548410/125‑1 (MQ=32)
                       ttCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTc                                      >  1:4548486/1‑125 (MQ=33)
                        tCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCt                                     <  2:4548411/125‑1 (MQ=33)
                         ccAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCtt                                    >  2:4548533/1‑125 (MQ=32)
                          cAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCtt                                    <  1:4548412/124‑1 (MQ=32)
                           aaTGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTca                                  <  2:4548413/125‑1 (MQ=33)
                               ctctATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcaccac                              >  2:4548666/1‑125 (MQ=32)
                               ctctATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcaccac                              >  2:4548620/1‑125 (MQ=32)
                                tctATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcaccac                              <  2:4548415/124‑1 (MQ=32)
                                 ctATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcacc                                >  2:4548615/1‑121 (MQ=32)
                                  tATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcaccaccac                           >  2:4548597/1‑125 (MQ=32)
                                  tATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGACCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcaccaccac                           >  1:4548665/1‑125 (MQ=17)
                                   aTGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTcac                                 <  2:4548416/118‑1 (MQ=32)
                                   aTGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACcaca                          >  1:4548582/1‑125 (MQ=33)
                                   aTGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACcaca                          >  2:4548637/1‑125 (MQ=32)
                                    tGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACaa                         <  1:4548417/125‑1 (MQ=32)
                                      gtcgtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATc                       <  1:4548419/125‑1 (MQ=33)
                                       tcgtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCt                      >  2:4548631/1‑125 (MQ=32)
                                        cgtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTg                     <  2:4548420/125‑1 (MQ=33)
                                        cgtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTg                     <  2:4548421/125‑1 (MQ=33)
                                        cgtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTg                     <  2:4548422/125‑1 (MQ=33)
                                        cgtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTg                     <  2:4548423/125‑1 (MQ=33)
                                         gtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGc                    <  2:4548424/125‑1 (MQ=33)
                                         gtcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGc                    <  2:4548425/125‑1 (MQ=32)
                                          tcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGc                    >  2:4548575/1‑124 (MQ=32)
                                          tcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCg                   <  2:4548426/125‑1 (MQ=33)
                                          tcAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCg                   <  2:4548427/125‑1 (MQ=33)
                                           cAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGt                  <  1:4548428/125‑1 (MQ=33)
                                            aaGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTa                 >  2:4548606/1‑125 (MQ=32)
                                            aaGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTa                 <  1:4548430/125‑1 (MQ=32)
                                             aGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAg                >  2:4548657/1‑125 (MQ=32)
                                              gAAATTCTGTTGCCGGACTGTCCAGGTGGCCAGCACAGCGAATTCGGATATGCGATATTTTCGAAGATCTTGCGTAAAGCACGAATTTTc                                                  >  2:4548670/1‑90 (MQ=11)
                                              gAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGc               >  1:4548549/1‑125 (MQ=33)
                                              gAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGc               >  1:4548579/1‑125 (MQ=33)
                                               aaaTTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCa              >  2:4548643/1‑125 (MQ=32)
                                               aaaTTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCa              >  1:4548603/1‑125 (MQ=32)
                                               aaaTTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCa              >  1:4548607/1‑125 (MQ=32)
                                                aaTTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAg             >  1:4548651/1‑125 (MQ=32)
                                                 aTTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGa            >  1:4548642/1‑125 (MQ=33)
                                                 aTTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGa            <  1:4548432/125‑1 (MQ=32)
                                                  ttCTGTTGCCGGAATGTCCAGTTGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGAt           <  2:4548434/125‑1 (MQ=17)
                                                  ttCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGAt           >  1:4548658/1‑125 (MQ=32)
                                                  ttCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGAt           <  2:4548433/125‑1 (MQ=33)
                                                    cTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCgg                                                <  1:4548435/86‑1 (MQ=33)
                                                    cTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGAtt          <  1:4548436/124‑1 (MQ=33)
                                                    cTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTg         >  1:4548663/1‑125 (MQ=32)
                                                     tGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTg         <  2:4548437/124‑1 (MQ=32)
                                                     tGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGc        >  1:4548650/1‑125 (MQ=32)
                                                      gTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCt       <  1:4548438/125‑1 (MQ=33)
                                                       ttGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCtt      >  2:4548664/1‑125 (MQ=33)
                                                        tGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGa            <  2:4548441/118‑1 (MQ=32)
                                                        tGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCTTg     <  2:4548440/125‑1 (MQ=32)
                                                        tGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCTTg     <  2:4548442/125‑1 (MQ=32)
                                                         gCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGTTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGc        >  1:4548646/1‑121 (MQ=17)
                                                         gCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCTTgg    <  2:4548443/125‑1 (MQ=32)
                                                          ccGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCtt      >  2:4548654/1‑122 (MQ=32)
                                                                                                                            |                                                           
GAGTTCGGGATGGGATCAGGTGGTTCCAATGCTCTATGGTCGTCAAGAAATTCTGTTGCCGGAATGTCCAGATGGACAGCCCAGCGAATTCGGATATGCGATATTTGCGAAGCTCTTGTGTAAAGCACGAATTTTCGGGTCTTTCGTCTTCACCACCACAATCTGCGTAGCAGATTGCTTGGGT  >  NC_002947/5307508‑5307691

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑