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GCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACGGCGATC  >  NC_002947/4538120‑4538311
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                                                    aaCTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgc                 <  2:3865934/125‑1 (MQ=255)
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                                                     aCTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgc                 >  2:3866143/1‑124 (MQ=255)
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                                                      cTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgcgc               >  1:3866198/1‑125 (MQ=255)
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                                                            gCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCgcacgcac         <  1:3865938/125‑1 (MQ=255)
                                                             ccAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGcacgcacg        <  1:3865939/125‑1 (MQ=255)
                                                             ccAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGcacgcacg        >  1:3866055/1‑125 (MQ=255)
                                                              cAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgcg                <  2:3865941/116‑1 (MQ=255)
                                                              cAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgcacg            >  2:3866216/1‑120 (MQ=255)
                                                              cAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCgcacgcac         <  2:3865940/123‑1 (MQ=255)
                                                              cAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACgg       >  1:3866263/1‑125 (MQ=255)
                                                                gagaTGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgca              <  1:3865942/116‑1 (MQ=255)
                                                                  gaTGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACGGCGAt   >  1:3866131/1‑125 (MQ=255)
                                                                   aTGCCACGTTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACGGCGATc  <  1:3865944/125‑1 (MQ=255)
                                                                   aTGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACGGCGATc  <  1:3865943/125‑1 (MQ=255)
                                                                   aTGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACAAATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACGGCGATc  >  2:3866172/1‑125 (MQ=255)
                                                                   |                                                                                                                            
GCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACGCACGGCGATC  >  NC_002947/4538120‑4538311

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 42 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: