Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,586,035 | +G | intergenic (+118/+97) | PP_4061 → / ← PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,586,033 | 1 | . | G | 98.9% | 235.7 / ‑0.7 | 183 | intergenic (+116/+99) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base G (105/76); total (106/77) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.97e-01 |
Only 100 of 187 total aligned reads displayed.
GGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑G‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATG > NC_002947/4585911‑4586145 | ggCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑g‑g > 1:3885116/1‑125 (MQ=255) cTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑g‑ggt > 1:3885201/1‑123 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑g‑ggta < 2:3884837/125‑4 (MQ=255) aaGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑g‑ggtaaa > 2:3885186/1‑120 (MQ=255) gggTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAAcc < 1:3884838/125‑1 (MQ=255) ggTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAAccc < 1:3884839/125‑1 (MQ=255) ggTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAAccc > 2:3885113/1‑125 (MQ=255) aGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCt < 2:3884842/125‑1 (MQ=255) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAAccc > 2:3885022/1‑121 (MQ=255) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTc < 1:3884843/125‑1 (MQ=255) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTc > 2:3885114/1‑125 (MQ=255) ccACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCt > 2:3885106/1‑125 (MQ=39) cACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAATCCGCTc > 1:3885244/1‑122 (MQ=255) aCGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTAc < 2:3884845/125‑1 (MQ=39) cGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTAcc > 2:3884955/1‑125 (MQ=255) cGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTAcc > 1:3885030/1‑125 (MQ=39) ggCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCa > 1:3885025/1‑125 (MQ=255) cACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAgg > 2:3884984/1‑125 (MQ=255) cGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑c < 2:3884849/125‑1 (MQ=38) cGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑c < 1:3884850/125‑1 (MQ=38) gTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑ccgtg > 2:3885097/1‑121 (MQ=38) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑ccgtgc > 1:3885269/1‑120 (MQ=38) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑ccgtgc > 1:3885091/1‑120 (MQ=38) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑ccgtgc > 1:3884982/1‑120 (MQ=38) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑ccgtgc > 1:3884988/1‑120 (MQ=38) tGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑ccgtgc > 1:3885042/1‑120 (MQ=38) gAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGcc < 1:3884854/125‑1 (MQ=38) aaCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCAGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCg > 2:3884997/1‑125 (MQ=38) aCAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTTAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCgg < 2:3884856/125‑1 (MQ=37) cAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGc < 1:3884857/125‑1 (MQ=38) aGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGcc < 2:3884859/125‑1 (MQ=38) gCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCt > 1:3885067/1‑125 (MQ=38) tGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGc > 2:3885031/1‑99 (MQ=38) aTCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGaa < 2:3884861/125‑1 (MQ=38) aTCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGaa > 2:3885142/1‑125 (MQ=38) cTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATg < 2:3884863/125‑1 (MQ=38) tGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATg > 2:3885392/1‑124 (MQ=38) gcgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACGCGCTCCTACCAGG‑GACCGTTCCTGCCttta > 2:3885241/1‑118 (MQ=25) gcgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATgcg < 1:3884864/125‑1 (MQ=38) cgcTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATgcgg > 2:3885179/1‑125 (MQ=38) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATgcggc > 1:3885015/1‑125 (MQ=38) gctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGAGCCGGCCTTGAATgcgg < 2:3884867/124‑1 (MQ=37) ctgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATgcggcg > 1:3885154/1‑125 (MQ=38) tgctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGgcgc < 1:3884868/125‑1 (MQ=38) ctCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCGGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTACTACCGGG‑GACCGTGCCGGGCTTGAATCCGGCGCt > 2:3885215/1‑124 (MQ=37) ccATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGcc > 1:3885210/1‑125 (MQ=38) cATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGccc > 2:3884925/1‑125 (MQ=38) cATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGccc > 2:3884978/1‑125 (MQ=38) aTTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGcccc > 1:3884946/1‑125 (MQ=38) ttGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCt < 1:3884870/125‑1 (MQ=38) tGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTg < 1:3884872/125‑1 (MQ=38) tGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTg > 1:3885181/1‑125 (MQ=38) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGt < 1:3884875/125‑1 (MQ=38) aaaGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGt < 2:3884874/125‑1 (MQ=38) aGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAg > 1:3885225/1‑125 (MQ=38) aGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAg < 2:3884877/125‑1 (MQ=38) gTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAg > 2:3885009/1‑123 (MQ=37) tGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGc > 2:3885131/1‑125 (MQ=38) gAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCg < 1:3884880/125‑1 (MQ=38) aGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCgg > 1:3885133/1‑125 (MQ=38) gATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGt < 2:3884881/125‑1 (MQ=38) tGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGttt < 1:3884883/125‑1 (MQ=38) gACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTa > 1:3885083/1‑125 (MQ=37) gACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTa > 2:3885163/1‑125 (MQ=37) ccGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAATGCGCTCTTAGCAGG‑GA‑ctgt > 2:3885202/1‑77 (MQ=21) ccGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTTGTAGGAGCGGGTTTa < 2:3884887/123‑1 (MQ=37) ccGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAcc < 1:3884886/125‑1 (MQ=37) ccGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAcc > 1:3885151/1‑125 (MQ=37) cGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAccc < 2:3884889/125‑1 (MQ=37) gggTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTTAGCGGGCCGGCCTCTTCGC‑G‑GTTAAACCCGCTCCTACCAGGATC‑CGTGCTGGCCTTGAATgcggc < 2:3884891/96‑1 (MQ=21) ggTGCTTGGCAGGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTAccc > 2:3885155/1‑123 (MQ=37) ggTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGC‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 1:3885280/1‑125 (MQ=37) gTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:3885149/1‑124 (MQ=37) tGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgc > 2:3885020/1‑123 (MQ=37) tGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa < 1:3884893/125‑1 (MQ=37) cTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑GCG‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:3885069/1‑123 (MQ=37) ttGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAaga > 1:3885125/1‑125 (MQ=37) 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tGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGgccggccg < 1:3884900/125‑1 (MQ=37) gATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGcc > 1:3885098/1‑125 (MQ=37) aTCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCa < 2:3884901/125‑1 (MQ=37) ttGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGca < 1:3884905/125‑1 (MQ=37) ttGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGca < 2:3884903/125‑1 (MQ=37) tGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGcccc > 2:3885061/1‑80 (MQ=18) tGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 2:3885312/1‑103 (MQ=21) tGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGcac < 1:3884907/125‑1 (MQ=37) cATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGcaca > 2:3885007/1‑124 (MQ=37) gATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGCGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAc > 1:3885377/1‑125 (MQ=25) gATCGGGCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCaa < 2:3884909/124‑1 (MQ=37) gggCCGGCCTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCg < 2:3884911/124‑1 (MQ=37) ggccggccTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGc > 2:3885081/1‑124 (MQ=37) ggccggccTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGc > 1:3885168/1‑124 (MQ=37) ggccggccTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCa > 1:3885110/1‑125 (MQ=37) ggccTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTCCCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATg < 1:3884923/125‑1 (MQ=37) ggccTCTTCGCGG‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGttt < 2:3884916/81‑1 (MQ=18) | GGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑G‑G‑TAAACCCGCTCCTACCAGG‑GA‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATG > NC_002947/4585911‑4586145 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |