| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 3,586,302 | (GGTGTCGGCA)1→2 | coding (496/1329 nt) | benK → | benzoate MFS transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 3586285 = | 10 (0.050) | 168 (0.830) | 119/230 | 0.6 | 96.7% | coding (479/1329 nt) | benK | benzoate MFS transporter |
| ? | NC_002947 | = 3586294 | 2 (0.010) | coding (488/1329 nt) | benK | benzoate MFS transporter | |||||
Only 100 of 359 total aligned reads displayed.
GCCGGCCTGGGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTT > NC_002947/3586161‑3586408 | gCCGGCCTGGGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTAAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCt < 1:3056494/125‑1 (MQ=255) tgtggcggcctgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgt > 1:3056504‑M1/123‑125 (MQ=255) tgtggcggcctgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgt > 2:3056503‑M1/123‑125 (MQ=255) cGGCCTGGGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGt < 2:3056497/125‑1 (MQ=255) tggcggcctgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcg < 2:3056844‑M1/5‑1 (MQ=255) gCCTGGGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCg < 1:3056499/125‑1 (MQ=255) gcggcctgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggc < 2:3056681‑M1/7‑1 (MQ=255) ggCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAgg > 2:3056576/1‑125 (MQ=255) tgtgGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgt < 1:3056587‑M2/125‑4 (MQ=255) tgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtgt > 1:3056514‑M1/113‑125 (MQ=255) gtgGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtc > 2:3056505‑M2/1‑121 (MQ=255) gatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtgtc > 2:3056517‑M1/112‑125 (MQ=255) atgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtgtcg > 1:3056519‑M1/111‑125 (MQ=255) ggcggcCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcgg > 1:3056507‑M2/1‑119 (MQ=255) gcggcCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggc > 1:3056509‑M2/1‑118 (MQ=255) ggcCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcag > 2:3056512‑M2/1‑116 (MQ=255) ccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCAt < 1:3056690‑M1/19‑1 (MQ=255) cTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtg < 2:3056730‑M2/125‑13 (MQ=255) tGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgt < 1:3056924‑M2/125‑14 (MQ=255) gccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgagcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCa > 2:3056522‑M1/102‑125 (MQ=255) gATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtc > 2:3056515‑M2/1‑111 (MQ=255) gtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCAtgc > 1:3056523‑M1/99‑125 (MQ=255) 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tCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttacc > 1:3056569‑M2/1‑37 (MQ=255) tcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTctct < 2:3056876‑M1/99‑1 (MQ=255) cAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccg < 2:3056648‑M2/125‑90 (MQ=255) tgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTctacta > 2:3056582‑M1/23‑125 (MQ=255) ggTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtga > 1:3056572‑M2/1‑32 (MQ=255) gTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgat < 2:3056695‑M2/125‑95 (MQ=255) gTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgat < 2:3056777‑M2/125‑95 (MQ=255) ggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTAcc > 2:3056591‑M1/21‑125 (MQ=255) ttCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctc > 1:3056579‑M2/1‑27 (MQ=255) tCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctct < 2:3056801‑M2/125‑100 (MQ=255) gcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTAcctgcc < 2:3056771‑M1/109‑1 (MQ=255) tgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGa > 2:3056588‑M1/14‑125 (MQ=255) cTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctact > 1:3056581‑M2/1‑23 (MQ=255) tGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctacta < 2:3056699‑M2/125‑104 (MQ=255) tGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctacta < 2:3056756‑M2/125‑104 (MQ=255) ctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAAt > 1:3056603‑M1/12‑125 (MQ=255) ggcggcATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacc > 2:3056599‑M2/1‑20 (MQ=255) ggcggcATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacc < 2:3056774‑M2/125‑106 (MQ=255) gcggcATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacct < 1:3056683‑M2/125‑107 (MQ=255) cggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCAt > 1:3056597‑M1/8‑125 (MQ=255) ggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATc < 2:3056720‑M1/119‑1 (MQ=255) cATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcct > 2:3056596‑M2/1‑15 (MQ=255) ggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCt > 2:3056594‑M1/3‑125 (MQ=255) gTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCtt > 2:3056585‑M1/2‑125 (MQ=255) | GCCGGCCTGGGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTT > NC_002947/3586161‑3586408 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |