| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_002947 | 3,586,302 | (GGTGTCGGCA)1→2 | coding (496/1329 nt) | benK → | benzoate MFS transporter |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_002947 | 3586285 = | 17 (0.090) | 140 (0.770) | 97/226 | 1.2 | 94.6% | coding (479/1329 nt) | benK | benzoate MFS transporter |
| ? | NC_002947 | = 3586294 | 0 (0.000) | coding (488/1329 nt) | benK | benzoate MFS transporter | |||||
Only 100 of 289 total aligned reads displayed.
GGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTTCCTGGTAC > NC_002947/3586170‑3586416 | ggCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAgg < 2:2664429/125‑1 (MQ=255) cctgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcagg < 1:2664559‑M1/10‑1 (MQ=255) ctgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtg > 2:2664432‑M1/114‑125 (MQ=255) tgatgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtgt > 1:2664434‑M1/113‑125 (MQ=255) atgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtgtcg > 1:2664436‑M1/111‑125 (MQ=255) atgcccaacgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggtgtcggcaggtgtcg > 2:2664438‑M1/111‑125 (MQ=255) acgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCtt < 1:2664652‑M1/22‑1 (MQ=255) acgccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCtt < 1:2664580‑M1/22‑1 (MQ=255) tGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgt > 2:2664433‑M2/1‑112 (MQ=255) tGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgt < 1:2664539‑M2/125‑14 (MQ=255) gccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCa < 1:2664575‑M1/24‑1 (MQ=255) ccgtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCa > 1:2664443‑M1/101‑124 (MQ=255) aTGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcg > 1:2664437‑M2/1‑110 (MQ=255) gtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCtt > 2:2664447‑M1/99‑120 (MQ=255) gtggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCAtgc > 1:2664446‑M1/99‑125 (MQ=255) ggcactgatgaacgaatacgcacccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCAtgctg < 2:2664596‑M1/29‑1 (MQ=255) 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cccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCg < 2:2664563‑M1/50‑1 (MQ=255) cGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggc > 1:2664453‑M2/1‑84 (MQ=255) ccaagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGAt < 1:2664621‑M1/52‑1 (MQ=255) aaTACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctg < 1:2664582‑M2/125‑44 (MQ=255) aagcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGt > 2:2664456‑M1/72‑125 (MQ=255) tACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctggg < 2:2664618‑M2/125‑46 (MQ=255) agcgcctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGCGTCGATGtt < 1:2664732‑M1/55‑1 (MQ=255) cctgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGttctt < 2:2664647‑M1/58‑1 (MQ=255) aCCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcg < 1:2664526‑M2/125‑51 (MQ=255) tgcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTcgc < 2:2664599‑M1/61‑1 (MQ=255) gcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGttct > 2:2664460‑M1/64‑120 (MQ=255) gcgcagcacgctggtggcgatcatgttcagtggttattcgctgggcggcatgctgtcggcaggTGTCCGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTcgcc > 1:2664459‑M1/64‑125 (MQ=255) 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(MQ=255) ttATTCGCTGGGCGCCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcaccctcatactgccgcgttt > 2:2664480‑M2/1‑30 (MQ=255) ggcggcatgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTAcc < 1:2664773‑M1/105‑1 (MQ=255) tgctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGa < 2:2664578‑M1/112‑1 (MQ=255) cTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctact < 1:2664780‑M2/125‑103 (MQ=255) cTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctact < 2:2664625‑M2/125‑103 (MQ=255) ctgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAAt > 1:2664484‑M1/12‑125 (MQ=255) tgtcggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATc < 2:2664635‑M1/115‑1 (MQ=255) gcggcATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacct < 2:2664571‑M2/125‑107 (MQ=255) ggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCAt > 2:2664483‑M1/7‑124 (MQ=255) ggcaggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATc > 1:2664485‑M1/7‑125 (MQ=255) cATGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcct > 2:2664490‑M2/1‑15 (MQ=255) tGCTGTCGGCAGGtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcctga < 1:2664660‑M2/125‑113 (MQ=255) ggTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGGGTTGGCTGGGAGTCGATGttc > 2:2664489‑M1/3‑58 (MQ=255) tcggcaggtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcctgaatcca < 1:2664639‑M2/125‑118 (MQ=255) TCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTTcc < 1:2664593‑M1/124‑1 (MQ=255) cggcaggtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcctgaatcca > 1:2664486‑M2/1‑7 (MQ=255) ggcaggtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcctgaatccatc > 2:2664487‑M2/1‑6 (MQ=255) GGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTTCCTgg > 1:2664492‑M1/1‑125 (MQ=255) gcaggtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcctgaatccatcg < 1:2664805‑M2/125‑121 (MQ=255) GCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGACGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTTCCTGGt < 2:2664666‑M1/125‑1 (MQ=255) aggtgtcggcaggtgtcggcatcttcatgctgccgcgttttggctgggagtcgatgttcttcgccgcagcggtgccactgctgctgttaccggtgattctctactacctgcctgaatccatcggc < 1:2664696‑M2/125‑123 (MQ=255) AGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTTCCTGGTAc > 2:2664494‑M1/1‑125 (MQ=255) | GGCTGTGGCGGCCTGATGCCCAACGCCGTGGCACTGATGAACGAATACGCACCCAAGCGCCTGCGCAGCACGCTGGTGGCGATCATGTTCAGTGGTTATTCGCTGGGCGGCATGCTGTCGGCAGGTGTCGGCATCTTCATGCTGCCGCGTTTTGGCTGGGAGTCGATGTTCTTCGCCGCAGCGGTGCCACTGCTGCTGTTACCGGTGATTCTCTACTACCTGCCTGAATCCATCGGCTTCCTGGTAC > NC_002947/3586170‑3586416 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |