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                                  aaCACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTggg         >  2:2928460/1‑124 (MQ=255)
                                  aaCACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGc        <  1:2928067/125‑1 (MQ=255)
                                   acacAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCg       >  1:2928367/1‑125 (MQ=255)
                                   acacAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCg       >  1:2928466/1‑125 (MQ=255)
                                    cacaGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTggg         <  1:2928070/122‑1 (MQ=255)
                                    cacaGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa      <  1:2928068/125‑1 (MQ=255)
                                    cacaGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa      <  2:2928069/125‑1 (MQ=255)
                                     acaGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAg     >  1:2928585/1‑125 (MQ=255)
                                     acaGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAg     <  2:2928071/125‑1 (MQ=255)
                                      caGCGGGCCAGTGAGATCGGTCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGa      <  1:2928072/123‑1 (MQ=255)
                                       aGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTc   <  1:2928073/125‑1 (MQ=255)
                                       aGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTc   <  2:2928074/125‑1 (MQ=255)
                                        gCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTcc  >  1:2928382/1‑125 (MQ=255)
                                        gCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTcc  >  1:2928475/1‑125 (MQ=255)
                                        gCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTcc  >  1:2928341/1‑125 (MQ=255)
                                        gCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTcc  >  2:2928665/1‑125 (MQ=255)
                                        gCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTc   <  1:2928075/124‑1 (MQ=255)
                                        |                                                                                                                            
ATGCCTATCTCAAAGATGTGCTAACTCGGTTGCCAACACAGCGGGCCAGTGAGATCGGGCAGCTGCTGCCACATCAGTGGGTGCCTGCCTAACTTACGCAAGGTGAGTTGGGCGGACGCTTACTTCCTATGTTCAAAAAAGCAGCTAGACAGTGTGGGCGAGTCC  >  NC_002947/3971526‑3971690

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: