| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 4,586,030 | 2 bp→TC | intergenic (+113/+101) | PP_4061 → / ← PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 4,586,030 | 0 | C | T | 100.0% | 379.3 / NA | 155 | intergenic (+113/+102) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
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| * | NC_002947 | 4,586,031 | 0 | T | C | 100.0% | 185.2 / NA | 155 | intergenic (+114/+101) | PP_4061/PP_4063 | hypothetical protein/long‑chain fatty acid‑‑CoA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (87/68); total (87/68) | |||||||||||
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
GGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGA‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATG > NC_002947/4585911‑4586145 || gCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑ggg < 1:3635164/125‑2 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑gggta < 1:3635166/125‑4 (MQ=255) ttAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑gggta > 1:3635416/1‑122 (MQ=255) tAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑gggtaa < 2:3635167/125‑5 (MQ=255) 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aGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGc > 2:3635321/1‑124 (MQ=255) aGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:3635174/125‑1 (MQ=255) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:3635176/125‑1 (MQ=255) gACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:3635175/125‑1 (MQ=255) ccACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:3635177/123‑1 (MQ=255) cACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTTCGC‑gggtaaa > 2:3635473/1‑110 (MQ=255) 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tGATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAACCCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCaa < 2:3635223/125‑1 (MQ=25) gATCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAc > 2:3635324/1‑125 (MQ=25) tCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAccc > 1:3635394/1‑125 (MQ=25) tCGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGCTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAccc > 1:3635455/1‑125 (MQ=25) cGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAggccggc < 1:3635225/105‑1 (MQ=21) cGGGCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAcc < 1:3635224/123‑1 (MQ=25) gggCCGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAAccc < 2:3635227/123‑1 (MQ=25) ggccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCa > 1:3635504/1‑125 (MQ=25) ggccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCa < 2:3635229/125‑1 (MQ=37) gccggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCcgcg > 1:3635585/1‑91 (MQ=21) cggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGAt > 2:3635283/1‑125 (MQ=37) cggccTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGAt > 2:3635458/1‑125 (MQ=37) ggccTCTTCGCGGGTAAGCCCGCTCCTACCA‑GGGACCGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCg < 1:3635241/119‑1 (MQ=25) || GGCTTAAGGGTAGACCACGGCACCGGCGTGAACAGCTGATCTGCGCTGCTCCATTGAAAGGTTGAGGATGACCGGGTGCTTGGCAAGGTGAAGATCTTGCATTGATCGGGCCGGCCTCTCTGC‑GGTAAACCCGCTCCTACCA‑GGGA‑CGTGCCGGCCTTGAATGCGGCGCTGCCCCTGGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGCCGCGCCAGCACATCAACCCGCAGATG > NC_002947/4585911‑4586145 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |