Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,499,508 | +C | intergenic (+85/‑79) | trpS → / → zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,499,506 | 1 | . | C | 99.4% | 194.5 / ‑3.6 | 153 | intergenic (+83/‑81) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/1); new base C (67/85); total (67/86) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.78e-01 |
Only 100 of 155 total aligned reads displayed.
AGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGT‑T‑T‑CGGGCACG‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACG > NC_002947/1499386‑1499624 | agagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAcg > 2:1192334/1‑122 (MQ=25) gCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAcg‑c‑ccg > 2:1192259/1‑121 (MQ=21) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGa < 2:1192106/124‑1 (MQ=18) aGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGa > 1:1192252/1‑123 (MQ=18) aGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGAc < 1:1192108/124‑1 (MQ=18) ccTTGGCACCACAGCAGGATTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACt < 1:1192109/123‑1 (MQ=17) ttGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGAt < 2:1192111/124‑1 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 1:1192113/123‑1 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTCT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 1:1192114/123‑1 (MQ=18) acaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt > 1:1192326/1‑122 (MQ=17) cagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 2:1192121/118‑1 (MQ=17) cagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGc < 1:1192119/123‑1 (MQ=18) cagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAg < 1:1192117/122‑1 (MQ=18) agGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCg < 1:1192122/123‑1 (MQ=18) ggACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGa < 2:1192123/109‑1 (MQ=14) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCggg < 1:1192126/123‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGc > 1:1192292/1‑118 (MQ=17) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCt > 2:1192322/1‑124 (MQ=18) tGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCATTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 2:1192128/124‑1 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1192130/123‑1 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc > 2:1192289/1‑124 (MQ=18) ggCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc > 2:1192297/1‑123 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 2:1192134/124‑1 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 2:1192131/124‑1 (MQ=18) gCTGCCAAACGGGGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 1:1192132/124‑1 (MQ=18) tGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 2:1192394/1‑121 (MQ=17) gCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc < 2:1192136/119‑1 (MQ=17) ccAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGGTTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACa > 1:1192438/1‑124 (MQ=18) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACa < 2:1192140/122‑1 (MQ=18) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAg < 1:1192138/123‑1 (MQ=18) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt > 2:1192279/1‑124 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt > 1:1192444/1‑123 (MQ=18) cGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGAc > 1:1192278/1‑124 (MQ=18) cGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCGCAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:1192141/123‑1 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTAC‑G‑CGGGCACG‑CTCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg < 2:1192143/124‑1 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg < 1:1192144/124‑1 (MQ=18) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc > 1:1192277/1‑123 (MQ=18) aGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGt < 1:1192146/124‑1 (MQ=18) aGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc < 2:1192147/121‑1 (MQ=18) gCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGccc > 1:1192307/1‑121 (MQ=18) cGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtt < 2:1192149/123‑1 (MQ=18) ggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACCGc > 1:1192304/1‑116 (MQ=18) ggCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc < 2:1192150/117‑1 (MQ=18) gCGAGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGtttttt < 2:1192152/124‑1 (MQ=21) cGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttg < 1:1192153/124‑1 (MQ=21) gTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgt > 1:1192348/1‑124 (MQ=21) gTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgt > 2:1192248/1‑124 (MQ=21) tGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGccc > 1:1192401/1‑114 (MQ=18) tGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgt < 2:1192154/123‑1 (MQ=21) tGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCAGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCCCGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgt > 1:1192225/1‑123 (MQ=21) cccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CTCTCCCACAGACTGATTTCCATTAAGCGGGCCTATCGCTAGAGTGACGGCCCg < 1:1192157/113‑1 (MQ=18) cccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGc > 2:1192377/1‑124 (MQ=21) cccGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGc > 1:1192270/1‑124 (MQ=21) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 2:1192159/80‑1 (MQ=11) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGccc > 2:1192342/1‑110 (MQ=21) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCt < 1:1192158/124‑1 (MQ=21) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCt > 2:1192299/1‑124 (MQ=25) cgcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCt < 2:1192160/124‑1 (MQ=25) gcgAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCt > 1:1192352/1‑123 (MQ=25) aaaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCt > 1:1192320/1‑124 (MQ=25) aaaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGc < 2:1192163/123‑1 (MQ=25) aaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa > 2:1192427/1‑124 (MQ=25) aaCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgt < 2:1192164/114‑1 (MQ=21) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTttgtt < 1:1192166/114‑1 (MQ=25) aCAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTaa < 1:1192165/124‑1 (MQ=25) 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gcgGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCAt > 2:1192395/1‑123 (MQ=25) gTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGAc < 2:1192174/123‑1 (MQ=25) tGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTc > 1:1192409/1‑124 (MQ=37) gCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa < 2:1192176/109‑1 (MQ=25) gCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTcc > 1:1192329/1‑124 (MQ=37) tggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGTCTcc > 2:1192256/7‑121 (MQ=25) tggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCtt < 2:1192180/118‑1 (MQ=37) ggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCtt < 1:1192181/118‑1 (MQ=37) ggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCtt > 1:1192404/6‑123 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACt < 1:1192182/113‑1 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTccc > 1:1192345/5‑120 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTa > 1:1192191/5‑123 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCt < 2:1192184/117‑1 (MQ=37) accGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa > 1:1192463/3‑124 (MQ=38) ccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa > 1:1192335/2‑123 (MQ=38) cTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTa < 2:1192185/124‑1 (MQ=38) ttGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTAt < 2:1192188/123‑1 (MQ=38) tggCCGGTGT‑T‑CGCGGGCCCGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTaa < 2:1192204/94‑1 (MQ=37) tGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTa > 1:1192531/1‑121 (MQ=39) gCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCa > 1:1192386/1‑123 (MQ=39) ccGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTa < 2:1192189/111‑1 (MQ=38) ttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGAt > 1:1192373/5‑123 (MQ=255) ttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATc < 2:1192193/120‑1 (MQ=255) gcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTg < 1:1192195/122‑1 (MQ=255) cGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaa > 1:1192414/1‑124 (MQ=255) gggCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACGGTGACGGCCCGTGTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGa > 2:1192417/1‑92 (MQ=255) ggCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaaa < 2:1192200/123‑1 (MQ=255) ggCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAAc < 1:1192199/124‑1 (MQ=255) ggCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATGAAGCGGGACTATCGCTACAGTGACGGCCCGtttt < 2:1192198/66‑1 (MQ=38) | AGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGT‑T‑T‑CGGGCACG‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAAACG > NC_002947/1499386‑1499624 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |