Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,499,498 | 1 bp→CG | intergenic (+75/‑89) | trpS → / → zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,499,497 | 1 | . | C | 76.8% | 168.5 / 118.3 | 142 | intergenic (+74/‑90) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/32); new base C (61/48); total (62/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 9.66e-09 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
* | NC_002947 | 1,499,498 | 0 | T | G | 77.5% | 118.3 / 97.7 | 142 | intergenic (+75/‑89) | trpS/zapE | tryptophan‑‑tRNA ligase/nucleoside triphosphate hydrolase domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); major base G (61/49); minor base C (1/31); total (62/80) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.32e-08 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.54e-01 |
Only 100 of 152 total aligned reads displayed.
TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGT‑T‑T‑CGGGCACG‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAA > NC_002947/1499383‑1499621 ||| agagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGTATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAc < 1:1192104/121‑1 (MQ=21) agagCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCAcg > 2:1192334/1‑122 (MQ=25) gCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAcg‑c‑ccg > 2:1192259/1‑121 (MQ=21) aaCGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCca > 1:1192291/1‑124 (MQ=18) cGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCcac > 2:1192294/1‑123 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGa < 2:1192106/124‑1 (MQ=18) aaGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGa > 1:1192275/1‑124 (MQ=18) aGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGa > 1:1192252/1‑123 (MQ=18) aGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGAc < 1:1192108/124‑1 (MQ=18) ccTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCAc < 2:1192110/106‑1 (MQ=18) cTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAg > 2:1192387/1‑119 (MQ=17) ttGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGa > 2:1192416/1‑119 (MQ=17) accacAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCa < 1:1192112/124‑1 (MQ=18) cacaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 1:1192113/123‑1 (MQ=18) acaGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt > 1:1192326/1‑122 (MQ=17) agcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGGCTGATTGCCAtt > 2:1192327/1‑121 (MQ=17) agcagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTaa < 1:1192116/123‑1 (MQ=18) cagGACTGAGGCTGCCAACCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCg < 1:1192120/124‑1 (MQ=17) cagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCAt < 2:1192121/118‑1 (MQ=17) cagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTa < 2:1192118/120‑1 (MQ=17) cagGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAg < 1:1192117/122‑1 (MQ=18) agGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCgg > 2:1192318/1‑124 (MQ=18) agGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCg < 1:1192122/123‑1 (MQ=18) ggACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCgg > 1:1192388/1‑123 (MQ=18) gACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGc < 2:1192125/124‑1 (MQ=18) cTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGc > 1:1192292/1‑118 (MQ=17) tGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1192127/124‑1 (MQ=18) tGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCATTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 2:1192128/124‑1 (MQ=18) gAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTa < 1:1192130/123‑1 (MQ=18) aGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATc > 2:1192289/1‑124 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 1:1192135/124‑1 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 2:1192133/124‑1 (MQ=18) gCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGc < 2:1192134/124‑1 (MQ=18) tGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCg > 2:1192394/1‑121 (MQ=17) ccAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTa < 2:1192137/122‑1 (MQ=17) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACa < 2:1192140/122‑1 (MQ=18) aaaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAg < 1:1192138/123‑1 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt > 1:1192444/1‑123 (MQ=18) aaCGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGt > 1:1192407/1‑123 (MQ=18) cGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCGCAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGa < 1:1192141/123‑1 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTAC‑G‑CGGGCACG‑CTCGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg < 2:1192143/124‑1 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg > 2:1192255/1‑124 (MQ=18) gTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACgg < 1:1192144/124‑1 (MQ=18) ggAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc > 1:1192277/1‑123 (MQ=18) aGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGt < 1:1192146/124‑1 (MQ=18) aGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGcc < 2:1192147/121‑1 (MQ=18) 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gCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTa < 2:1192176/109‑1 (MQ=25) gCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTcc > 1:1192329/1‑124 (MQ=37) tggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCtt < 2:1192180/118‑1 (MQ=37) ggcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCtt > 1:1192404/6‑123 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACt < 1:1192182/113‑1 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTccc > 1:1192345/5‑120 (MQ=37) gcaccGGCTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCt < 2:1192184/117‑1 (MQ=37) accGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa > 1:1192463/3‑124 (MQ=38) ccGGCTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGaa > 1:1192335/2‑123 (MQ=38) cTTTGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTa < 1:1192186/124‑1 (MQ=38) cTTTGCCGGTGT‑T‑CGCGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTa < 2:1192185/124‑1 (MQ=38) ttGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTAt < 2:1192188/123‑1 (MQ=38) tGCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTa > 1:1192531/1‑121 (MQ=39) gCCGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCa > 1:1192386/1‑123 (MQ=39) ccGGTGT‑TCG‑CGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTa < 2:1192189/111‑1 (MQ=38) tgttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTCACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCa > 2:1192260/7‑122 (MQ=255) tgttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAg > 1:1192532/7‑123 (MQ=255) tgttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTCTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGc > 1:1192451/7‑121 (MQ=255) gttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGTCATTAAGCGGGCCTATTGCTACAGTGACGGCCCTTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATTACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGa > 2:1192376/6‑123 (MQ=255) ttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAg < 2:1192194/114‑1 (MQ=255) ttcgcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATc < 2:1192193/120‑1 (MQ=255) gcGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTg < 1:1192195/122‑1 (MQ=255) cGGGCACGCC‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGaa > 1:1192414/1‑124 (MQ=255) ||| TTCAGAGCCTGAACGAAGCCTTGGCACCACAGCAGGACTGAGGCTGCCAAACGGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAACAGGCGCCGCGGTGCATGGCCACGGCTTTGCCGGTGT‑T‑T‑CGGGCACG‑C‑CGCTCCCACAGACTGATTGCCATTAAGCGGGCCTATCGCTACAGTGACGGCCCGTTTTTTGTTGCCTCGCTAACGAATCATGACTCCCTTAGAACGCTATCAAGCAGATCTGAA > NC_002947/1499383‑1499621 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |