Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,419,549 | +C | intergenic (‑38/+98) | PP_1242 ← / ← PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,419,548 | 1 | . | C | 98.8% | 127.4 / ‑1.1 | 169 | intergenic (‑37/+99) | PP_1242/PP_1244 | hypothetical protein/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (1/1); new base C (104/63); total (105/64) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 183 total aligned reads displayed.
TGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GG‑CTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTC > NC_002947/1419424‑1419667 | gAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggct‑gg‑cctc < 1:1454450/125‑4 (MQ=255) aaCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggct‑gg‑cctct < 1:1454452/125‑5 (MQ=255) aaCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggct‑gg‑cctct > 1:1454648/1‑121 (MQ=255) aCAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggct‑gg‑cctctt < 2:1454453/125‑6 (MQ=255) cAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTc < 1:1454456/125‑1 (MQ=255) cGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTcgcg > 1:1454838/1‑125 (MQ=255) ggTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCggg > 2:1454613/1‑125 (MQ=255) gtgtgtgtTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGggct‑gg‑c < 2:1454458/113‑1 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGc > 2:1454664/1‑124 (MQ=255) tGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCa < 1:1454459/125‑1 (MQ=255) gAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAc < 1:1454461/125‑1 (MQ=255) aGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACg > 2:1454578/1‑125 (MQ=255) gtgtTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACg > 1:1454690/1‑124 (MQ=255) gtgtTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGc < 2:1454463/125‑1 (MQ=255) gttTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGc > 2:1454603/1‑124 (MQ=255) ttttCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTc > 1:1454604/1‑125 (MQ=255) gCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTcc < 2:1454468/121‑1 (MQ=255) gCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca > 1:1454774/1‑125 (MQ=255) gCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCcaca < 1:1454469/125‑1 (MQ=255) tGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTa > 1:1454602/1‑125 (MQ=255) tAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtg < 1:1454472/125‑1 (MQ=255) tAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtg > 2:1454548/1‑125 (MQ=255) aGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACtgt < 2:1454473/125‑1 (MQ=255) aGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa > 1:1454696/1‑125 (MQ=255) aGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCa < 2:1454475/125‑1 (MQ=255) aGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTg > 1:1454587/1‑125 (MQ=255) ggTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTg > 1:1454608/1‑124 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTg > 1:1454679/1‑124 (MQ=255) ttGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGa > 1:1454652/1‑125 (MQ=255) tGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTg > 2:1454628/1‑123 (MQ=255) ccGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACgg > 2:1454703/1‑125 (MQ=255) aCTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGc > 1:1454745/1‑115 (MQ=255) aCTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtg > 1:1454673/1‑125 (MQ=255) cTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCtg > 1:1454718/1‑124 (MQ=255) 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ggTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTCCTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGAccc > 1:1454685/1‑125 (MQ=255) ggTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGAccc < 2:1454483/125‑1 (MQ=255) ggTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGAccc > 1:1454809/1‑125 (MQ=255) ggTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGAcc > 1:1454642/1‑124 (MQ=255) ttCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtg > 1:1454768/1‑125 (MQ=255) tCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtgt > 2:1454887/1‑125 (MQ=255) tCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCtgt < 2:1454485/125‑1 (MQ=255) gttgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTggg > 1:1454541/1‑125 (MQ=255) ttgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGa > 1:1454592/1‑125 (MQ=255) tgtgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGTGCACGCCCGCTCCCACAGGCACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGAc > 1:1454733/1‑115 (MQ=39) tgttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCg > 2:1454735/1‑125 (MQ=255) gttgtCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCgg < 1:1454488/125‑1 (MQ=255) 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cGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCggg < 2:1454498/121‑1 (MQ=255) cGGTGGGCATTGTTTTGTTGCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGt < 2:1454497/124‑1 (MQ=255) gTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCCGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 2:1454655/1‑125 (MQ=255) gTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGcc < 1:1454499/125‑1 (MQ=255) gTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGcc < 2:1454501/125‑1 (MQ=255) gTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 2:1454692/1‑125 (MQ=255) ggCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcg > 1:1454568/1‑124 (MQ=255) gCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAg > 2:1454933/1‑81 (MQ=255) cATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgcg > 2:1454694/1‑124 (MQ=255) cATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCcgc > 1:1454883/1‑123 (MQ=255) tgttttttttCCCTGCATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAaga < 1:1454504/125‑1 (MQ=255) gttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTTCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGcc > 1:1454704/1‑116 (MQ=255) gttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAagag > 1:1455093/1‑125 (MQ=255) ttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCTGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAgg < 2:1454505/125‑1 (MQ=255) ttttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGcc > 2:1454767/1‑53 (MQ=25) tttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAgg > 2:1454668/1‑124 (MQ=255) ttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGTT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGcc < 2:1454508/125‑1 (MQ=255) ttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCTCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGa > 1:1454788/1‑118 (MQ=255) ttgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCAAGcc > 2:1454875/1‑51 (MQ=21) tgtttCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGcc > 1:1454621/1‑124 (MQ=255) 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gATTCTGGGTTGCCTGTGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACATGTACTGTGCAGTTCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGAcc < 2:1454513/119‑1 (MQ=21) cttCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTa > 1:1454727/2‑123 (MQ=255) aTTCTGGGTTGCCTGGGCTGGG‑CTCTTCGCGGTCACGCCCGCTCCGACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGTCCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAAt < 2:1454514/125‑1 (MQ=37) aTTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAAt > 2:1454675/1‑125 (MQ=255) ttCTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATg > 2:1454778/1‑125 (MQ=255) cTGGGTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGc > 1:1455061/1‑124 (MQ=255) gggTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGAc > 2:1454717/1‑64 (MQ=255) gggTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAg < 1:1454516/125‑1 (MQ=255) ggTTGCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAgg > 2:1454659/1‑125 (MQ=255) ggCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGGCGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGgtgt < 2:1454519/124‑1 (MQ=255) gCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGtgtg < 1:1454520/125‑1 (MQ=255) gCCTGGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGtgtg > 1:1454742/1‑125 (MQ=255) ccTAGGCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGa > 1:1454707/1‑125 (MQ=255) gggCT‑GGCCTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGc < 2:1454523/125‑1 (MQ=255) gct‑ggccTCTTCGCGGGCACGCCCGTTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGctc < 1:1454525/125‑1 (MQ=255) gct‑ggccTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGctc < 1:1454524/125‑1 (MQ=255) | TGCGGAACAGCGGGTGAGTGTTGTTTTCGCCTTGGTAGAAGCAGGTCTTGCCGACTGTGGTGGGTTCTGTTGTGTTGTCGGTGGGCATTGTTTTGTTTCCCTGGATTCTGGGTTGCCTGGGCT‑GG‑CTCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTACTGTGCAGTGCGTGACGGCTGTGGTGACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGAGGCCTGACCTGCTAATGCAAGGTGTGAGGCTC > NC_002947/1419424‑1419667 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 29 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |