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                                              ccATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGgcg                  >  2:4200248/1‑120 (MQ=255)
                                              ccATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCttt             <  1:4200035/125‑1 (MQ=255)
                                              ccATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCttt             >  1:4200408/1‑125 (MQ=255)
                                               cATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCtttt            >  2:4200615/1‑125 (MQ=255)
                                               cATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCtttt            <  1:4200036/125‑1 (MQ=255)
                                                aTGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCttttt           >  1:4200542/1‑125 (MQ=255)
                                                aTGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCttttt           <  1:4200038/125‑1 (MQ=255)
                                                aTGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCttttt           <  1:4200039/125‑1 (MQ=255)
                                                 tGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTc          <  1:4200040/125‑1 (MQ=255)
                                                   gAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACatat                                                        <  1:4200041/77‑1 (MQ=35)
                                                   gAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCgg        >  2:4200520/1‑125 (MQ=255)
                                                    aaCTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCATGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTc          >  2:4200341/1‑122 (MQ=255)
                                                     aCTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgcg      >  1:4200223/1‑125 (MQ=255)
                                                     aCTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgcg      <  1:4200042/125‑1 (MQ=255)
                                                     aCTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgcg      >  1:4200381/1‑125 (MQ=255)
                                                      cTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGgcgc     >  1:4200419/1‑125 (MQ=255)
                                                       tGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgca    <  1:4200043/125‑1 (MQ=255)
                                                        gTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgcac   <  1:4200044/125‑1 (MQ=255)
                                                         ttCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgcacg  <  1:4200046/125‑1 (MQ=255)
                                                         ttCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgcac   >  1:4200292/1‑124 (MQ=255)
                                                          tCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGcgcac   <  2:4200047/123‑1 (MQ=255)
                                                          |                                                                                                                           
GCGACTGCCGCACGCCTCATCGGTAGCAGACTACGAAGCGCTGCTGCCATGGAACTGTTCGCCAGAGATGCCACGGTAACTTTGGCTTCCACCTTGTGGTAGGTGGGGTTCATGGATCGGTTACATATCGTTGGCCTGTGCATGGGCCTGTCGGTGATGGTCGGCGCCTTTTTCGGCGCACG  >  NC_002947/4538120‑4538301

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: