| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 5164773 | 71 (1.450) | 9 (0.240) | 9/194 | 3.3 | 13.9% | intergenic (+39/+67) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein |
| ? | NC_002947 | = 5164788 | 58 (1.560) | intergenic (+54/+52) | PP_4542/PP_4543 | ABC transporter ATP‑binding protein/permease/hypothetical protein | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
ATTGCCCGTATGGACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5164594‑5164773‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggccttttcgcgggtaaacccgctcctacaACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTC < NC_002947/5164788‑5164642 ATTGCCCGTATGGACCGGCTAGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATCTCCGGATGTGGCACCACCAGACCGGATGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGC > 2:174027/1‑150 TTGCCCGTATGGACCGGCTGGTGGTGCTGGACAATGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCACGGTGGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCG > 1:289544/1‑150 gCCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTATATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG < 2:224706/149‑1 ACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG < 2:688446/150‑1 CCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG > 2:827093/1‑149 CCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGG < 1:827093/149‑1 CTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCT > 2:898023/1‑150 GACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGATGGAGAAGCAAGGGCTGTATGCCCGTTAGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA < 1:669003/150‑1 TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCC > 1:486081/1‑130 TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCC < 2:486081/130‑1 TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 2:879813/129‑1 TCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTC > 1:879813/1‑129 GCTGGAGCGTCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCTCCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGTTACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGTTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAA < 1:174027/150‑1 GGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCG < 1:697264/88‑1 GGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCG > 2:697264/1‑88 GCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTG < 2:474914/117‑1 GCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTG > 1:474914/1‑117 AGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGC < 1:765254/121‑1 AGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGC > 2:765254/1‑121 CCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGT < 2:851505/114‑1 CCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGT > 1:851505/1‑114 CCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGA > 2:1086428/1‑95 CCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGA < 1:1086428/95‑1 GGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTC < 1:668142/58‑1 GGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTC > 2:668142/1‑58 GGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTC < 2:1185657/150‑1 GCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCC > 1:60641/1‑150 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCT > 1:715054/1‑104 GCGGGTAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCT < 2:715054/104‑1 TAACCCCGCGCCTACGACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACGCGCGAACAGGCCGCGCAGGCGTCAATCGACCCCGACAATACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACGACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGT < 1:871184/150‑1 TAAACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGT < 2:60641/150‑1 ACCCGCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCTGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGC < 1:728398/150‑1 GCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCTACCCCGACAAAACCTCCGCTCTCGTTGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTACAGAAACTCAGTGTGGCTGCC > 1:416724/1‑150 GCTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAACGCCGCGCACGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCa > 1:182470/1‑149 CTCCTACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCA < 2:951709/150‑1 ACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTC > 1:918279/1‑150 ACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTC > 1:898023/1‑150 ACAACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTC > 1:208859/1‑150 ATTGCCCGTATGGACCGGCTGGTGGTGCTGGACAAGGGGCGAATTGTCGAGAGTGGCAGCCACAGTGAGTTGCTGGAGCAGCAAGGGCTGTATGCCCGGTTGTGGCACCACCAGACCGGAGGTTTTGTCGGGGTCGATTGACACCTGCGCGGCCTTTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_002947/5164594‑5164773‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggccttttcgcgggtaaacccgctcctacaACGATAGCGAACCTGTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAAGGCCGCGCAGGTGTCAATCGACCCCGACAAAACCTCCGGTCTGGTGGTGCCACAACCGGGCATACAGCCCTTGCTGCTCCAGCAACTCACTGTGGCTGCCACTCTC < NC_002947/5164788‑5164642 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |