| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 4578249 | 0 (0.000) | 468 (1.270) | 161/276 | 0.2 | 100% | intergenic (+64/‑73) | PP_4054/glgX | hypothetical protein/glycogen debranching enzyme |
| ? | NC_002947 | = 5763126 | NA (NA) | intergenic (+145/+373) | PP_5050/PP_5051 | transposase/hypothetical protein | |||||
Only 100 of 1479 total aligned reads displayed.
CCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAA‑GGCATGCCCTTCCCCCTCGG > NC_002947/4578100‑4578398 | tgcttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGc > 1:5263658‑M2/148‑150 (MQ=255) cGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGa < 2:2888592‑M1/150‑2 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg < 2:1894806‑M2/5‑1 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg < 1:1648483‑M2/5‑1 (MQ=255) cttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCgg < 2:7966257‑M2/5‑1 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg > 1:1393205‑M2/145‑150 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg < 2:7428524‑M2/6‑1 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg > 1:5415566‑M2/145‑150 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg > 1:8625109‑M2/145‑150 (MQ=255) ttctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCggg > 2:5250118‑M2/145‑150 (MQ=255) tctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGt > 2:7151049‑M2/144‑150 (MQ=255) tctattgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGt < 1:1561680‑M2/7‑1 (MQ=255) cccAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattct > 2:3020168‑M1/1‑145 (MQ=255) attgtggcttgctcgcgagggattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgtacagtcagaagcgagttatggcgctgctgctcccttcaagtcctagcattcaAGCGGgtttt > 2:5456640‑M2/141‑149 (MQ=255) tgtcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTAcc < 2:3162136‑M2/12‑1 (MQ=255) tcgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCcg > 2:5646741‑M2/137‑150 (MQ=255) cgcttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCcgc < 1:2546205‑M2/15‑1 (MQ=255) gcttgctcacgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCcgcg < 1:266514‑M2/16‑1 (MQ=255) gcTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccgga < 1:6540323‑M1/150‑15 (MQ=255) cttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGa > 2:6507631‑M2/134‑150 (MQ=255) ttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGaa > 1:5566212‑M2/133‑150 (MQ=255) ttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGaa > 2:6835225‑M2/133‑150 (MQ=255) ttgctcgcgaggcattccttatcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGaa < 2:2351531‑M2/18‑1 (MQ=255) 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tcggcgcttgggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctccccccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTAccc > 1:7924256‑M2/112‑124 (MQ=255) cACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgcc > 1:947405‑M1/1‑113 (MQ=255) ggTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggc < 2:1458583‑M1/150‑44 (MQ=255) tGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcct > 2:3876975‑M1/1‑105 (MQ=255) tGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcct > 1:8352428‑M1/1‑105 (MQ=255) gggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCt > 2:4948508‑M2/103‑150 (MQ=255) ggtgttgaaaggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCtt > 2:6645392‑M2/102‑150 (MQ=255) aGCCCCGGGCGGTGAAAAATCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctca < 1:1823379‑M1/150‑52 (MQ=255) aGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctca < 2:3336250‑M1/150‑52 (MQ=255) aGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctca < 1:6197382‑M1/150‑52 (MQ=255) aGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctca < 1:3631247‑M1/150‑52 (MQ=255) aggaggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACgg > 1:7240151‑M2/93‑150 (MQ=255) ggaggggtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCAc > 1:1089642‑M2/89‑150 (MQ=255) gAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGattctatggccggaggcaaattttcagtaaaaacgccatcggcctctctcagcaacctcgaggt > 2:7623965‑M1/1‑86 (MQ=255) gtgatttctcctacggtctgtactgcgcgaacagtcagaagcgagttatggccctcctcctcccttcaagtcctaccatacaAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAgg > 1:1259471‑M2/83‑150 (MQ=255) 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CCGAACCCAAGGCGGCTGCCCTGCCGGGGGTTAAACCCACTGCGGTGAAAAAGCCCCGGGCGGTGAAAAAGCCTACTGCCGGTTAAGCCTGTCCGGGCCTCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGTTCATCACAGGCGCATGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAGTGGCCAATGCAGGACAGCACAATTCCCCTTCCATCACGGCCACTCGAGGATCGTCATGAGCCCCCGCACCCCAAAGAAAACCCGCTCGGTCGCACCATCGCGCATTCGCGAA‑GGCATGCCCTTCCCCCTCGG > NC_002947/4578100‑4578398 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |