Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	NC_002947	4986176	4986254	79	2 [1]	[1] 3	flgE	flagellar hook protein FlgE

GGTGGAGGCCGGATTGGCCGGGTTGCGGCCATCGATAGTGGTGTGCATGGACCAGGTATTGGTCGCGTCGTCCTTGATGAAGTACTGGTTCATCTGGTGTTCATTACCCTGGCTGTCGAACACCGGGGTATTGAACGT  >  NC_002947/4986253‑4986390   |                                                                                                                                        ggtggAGGCCGGATTGGCCGGGTTGCGGCCATCGATAGTGGTGTGCATGGACCAGGTATTGGTCGCGTCGTCCTTGATGAAGTACTGGTTCATCTGGTGTTCATTACCCTGGCTGTCGAACACCGGGGTATTGAAc    <  1:46606/136‑1 (MQ=255)   tggAGGCCGGATTGGCCGGGTTGCGGCCATCGATAGTGGTGTGCATGGACCAGGTATTGGTCGCGTCGTCCTTGATGAAGTACTGGTTCATCTGGTGTTCATTACCCTGGCTGTCGAACACCGGGGTATTGAACGt  >  2:181885/1‑136 (MQ=255)   tggAGGCCGGATTGGCCGGGTTGCGGCCATCGATAGTGGTGTGCATGGACCAGGTATTGGTCGCGTCGTCCTTGATGAAGTACTGGTTCATCTGGTGTTCATTACCCTGGCTGTCGAACACCGGGGTATTGAACGt  >  2:60524/1‑136 (MQ=255)   |                                                                                                                                        GGTGGAGGCCGGATTGGCCGGGTTGCGGCCATCGATAGTGGTGTGCATGGACCAGGTATTGGTCGCGTCGTCCTTGATGAAGTACTGGTTCATCTGGTGTTCATTACCCTGGCTGTCGAACACCGGGGTATTGAACGT  >  NC_002947/4986253‑4986390

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑