| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 715,019 | Δ1 bp | 7.7% | coding (478/483 nt) | PP_0607 ← | type IV pili biogenesis protein FimT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 715,019 | 0 | A | . | 7.7% | 2174.5 / 165.5 | 646 | coding (478/483 nt) | PP_0607 | type IV pili biogenesis protein FimT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (323/272); new base . (23/27); total (347/299) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.02e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.79e-01 | |||||||||||
Only 100 of 661 total aligned reads displayed.
TGGACGGGCGCGAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCAGCG > NC_002947/714870‑715168 | ggACGGGCGCGAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTagcag > 1:3869971/1‑150 (MQ=255) cgcgAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCAt < 2:4289288/150‑1 (MQ=255) gcgAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCAtt < 1:8139430/150‑1 (MQ=255) cgAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTg < 1:5019657/150‑1 (MQ=255) cgAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTg < 2:2030943/150‑1 (MQ=255) cgAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTg < 2:1328520/150‑1 (MQ=255) aaGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGca < 2:2655987/150‑2 (MQ=255) gagaACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCa > 2:7380843/1‑150 (MQ=255) gagaACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCa > 1:6568160/1‑150 (MQ=255) agaACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTctg < 1:131487/150‑3 (MQ=255) agaACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAg > 2:6938563/1‑150 (MQ=255) agaACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAg < 2:3700063/150‑1 (MQ=255) tCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGtcctc > 1:7844597/1‑150 (MQ=255) tCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGtcctc < 1:6292525/150‑1 (MQ=255) tCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGtcctc > 2:5499026/1‑150 (MQ=255) ttttCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACGCAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTaa < 2:2348548/150‑1 (MQ=255) ttttCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTaa < 1:6857183/150‑1 (MQ=255) ttttCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTaa < 1:7185049/150‑1 (MQ=255) ttttCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTaa < 2:2480673/150‑1 (MQ=255) aaTGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAAc < 1:8374552/150‑1 (MQ=255) cccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGa < 1:616843/150‑1 (MQ=255) ccAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAc > 1:8409472/1‑150 (MQ=255) cAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAct > 1:1939427/1‑150 (MQ=255) cAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAct < 2:8388739/150‑1 (MQ=255) cAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGAct > 1:4759036/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGActc > 1:6420115/1‑150 (MQ=255) aaaGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGActc > 2:8128259/1‑150 (MQ=255) agCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGcc < 1:7995378/150‑1 (MQ=255) gCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCg < 2:4047760/150‑1 (MQ=255) cTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGc > 2:2956716/1‑150 (MQ=255) gCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCtt < 2:4664485/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGAt < 2:6258776/150‑1 (MQ=255) ggTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAAGGCAGGGGCTGCATTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCGCCTGCAATGTCCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTTAGCAACCTGACACTGCCGCTTGAt < 1:4535629/150‑1 (MQ=255) ggTACGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGAt < 1:5453633/150‑1 (MQ=255) ttCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGc > 1:3459578/1‑150 (MQ=255) tcgctcgcTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGcc < 2:6093160/150‑1 (MQ=255) gctcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAg > 1:3291505/1‑150 (MQ=255) tcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGca > 1:2597355/1‑150 (MQ=255) tcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGca > 1:1246038/1‑150 (MQ=255) tcgctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGca > 2:3474037/1‑150 (MQ=255) gctGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGcacc > 2:5622205/1‑150 (MQ=255) tGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGcaccac > 1:2879852/1‑150 (MQ=255) aTCTGACGGGCCGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTCAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCt > 2:7912365/1‑150 (MQ=255) cTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGa < 1:3765352/150‑1 (MQ=255) tGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATCACCGC‑GCTAGCTGCGGGCATTGCTCAGGTCCTCCGGAAGCACCCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGat > 2:7170741/1‑150 (MQ=255) aCGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGatat < 1:2776317/150‑1 (MQ=255) gggCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCg > 2:749879/1‑150 (MQ=255) ggCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCgg < 1:7441011/150‑1 (MQ=255) ggCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCgg < 2:853460/150‑1 (MQ=255) gCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGGCATTGCTCAGGTCCTCCGTACGCAACCTGACTCTGCCGCGTGATGCCAGCCCCACCTGAGCTCGGc > 2:7679726/1‑150 (MQ=255) aCCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGa < 1:6674427/150‑1 (MQ=255) cgccgcCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGagc > 1:4318114/1‑150 (MQ=255) cgccAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGagcagc < 1:1223781/150‑1 (MQ=255) gccAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACACGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAgcg < 2:8691421/150‑1 (MQ=255) gccAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAgcg > 2:4146288/1‑150 (MQ=255) gccAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAgcg > 2:6705352/1‑150 (MQ=255) gccAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAgcg < 2:3308549/150‑1 (MQ=255) cAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAgcggc < 2:6821619/150‑1 (MQ=255) aTGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGgcgc < 2:2819646/150‑1 (MQ=255) tGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAg > 1:173975/1‑78 (MQ=255) gCAAGGGCTGCAAAGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGt > 1:6963360/1‑150 (MQ=255) cAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGtt > 1:2189693/1‑150 (MQ=255) aGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTc > 2:1418118/1‑150 (MQ=255) gctgctTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGcac > 2:6437028/1‑150 (MQ=255) tgctTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACAt > 1:1595711/1‑150 (MQ=255) tttGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTc > 2:116395/1‑150 (MQ=255) tttGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTc > 1:5966801/1‑150 (MQ=255) tGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCa < 1:4262597/150‑1 (MQ=255) cAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGt > 2:396310/1‑150 (MQ=255) aGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGtt > 1:8203437/1‑150 (MQ=255) cccTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGtttt < 1:7697218/150‑1 (MQ=255) cccTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGtttt > 1:5283336/1‑150 (MQ=255) cccTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGtttt < 1:4152567/150‑1 (MQ=255) ccTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTg < 1:8629760/150‑1 (MQ=255) ttGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTgcg < 1:6201833/150‑1 (MQ=255) tGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTgcgc < 2:1770720/150‑1 (MQ=255) gcgACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCa > 2:7071090/1‑150 (MQ=255) gACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAAc < 2:913195/150‑1 (MQ=255) gACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAAc > 1:2373925/1‑150 (MQ=255) cacaAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCa < 1:5774119/150‑1 (MQ=255) acaAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAg > 2:3127582/1‑150 (MQ=255) aaGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCt > 1:1017004/1‑150 (MQ=255) aaGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCt < 1:4891892/150‑1 (MQ=255) aaGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCt > 2:1576372/1‑150 (MQ=255) aGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTg < 2:5093504/150‑1 (MQ=255) cctgagCAATGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCGTTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGccc > 2:3224739/6‑150 (MQ=255) gCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGt < 2:5233291/150‑1 (MQ=255) cAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTc > 2:8237261/1‑150 (MQ=255) aaTGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCa > 2:5925621/1‑150 (MQ=255) aaTGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCa > 1:5569966/1‑150 (MQ=255) aTGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCAt < 2:4446145/150‑1 (MQ=255) tGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATg > 1:4663970/1‑150 (MQ=255) tGACCGCTGCTAGC‑GCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATg > 1:1071207/1‑150 (MQ=255) gACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATgg < 2:1657023/150‑1 (MQ=255) gACCGC‑GCGAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATgg < 2:4866947/150‑1 (MQ=255) ccGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGc < 1:8794063/150‑1 (MQ=255) gcTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGc < 1:3654007/150‑1 (MQ=255) cTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGcc < 1:593227/150‑1 (MQ=255) agcagcGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCa < 1:3079621/150‑1 (MQ=255) cagcGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCAgc > 2:5715047/1‑150 (MQ=255) | TGGACGGGCGCGAAGAGAACATCACCTTTTCAATGCCCAAAGAGCTGCGGGTTCGCTCGCTGATCTGACGGGCAGTACCGCCGCCAATGCAGGGGCTGCTTTGCAGCCCTTGCGCGACACAAGACCGCTCCTGCAATGACCGC‑GCTAGCAGCGGTCATTGCTCAGGTCCTCCGTAAGCAACCTGACTCTGCCGCTTGATGCCAGCACCACCTGATATCGGCTGCGAGCAGCGGCGCGTTCGCACATTTCCAGTTTTGCGCCCAACCAGCTGTTGCCCGACGTCATGGGCACGCCCAGCG > NC_002947/714870‑715168 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |