| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,484,936:1 | +G | 5.3% | coding (463/993 nt) | prmA → | ribosomal protein L11 methyltransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,484,936 | 1 | . | G | 5.3% | 2074.7 / 100.5 | 468 | coding (463/993 nt) | prmA | ribosomal protein L11 methyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (205/238); new base G (11/14); total (216/252) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.40e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.06e-01 | |||||||||||
Only 100 of 481 total aligned reads displayed.
ACAGGTGTTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACTTTGGCTGC > NC_002947/5484788‑5485085 | aCAGGTGTTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑g > 1:3082911/1‑150 (MQ=255) cAGGTGTTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑gg > 1:1056583/1‑150 (MQ=255) aGGTGTTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGc < 1:5835070/150‑1 (MQ=255) tgtTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCAc > 2:8235196/1‑149 (MQ=255) gtTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTG‑CCAGCTGGGCACGa < 1:7490111/150‑1 (MQ=255) gtTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGCATCGTG‑CCAGCTGGGCACGa < 1:1940633/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGAt > 2:8592684/1‑150 (MQ=255) ttCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTG‑CCAGCTGGGCACGAt < 2:1637344/150‑1 (MQ=255) ttCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTG‑CCAGCTGGGCACGAt < 2:6060993/150‑1 (MQ=255) gCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGcc > 1:4148872/1‑150 (MQ=255) cccACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGccc > 2:6582144/1‑150 (MQ=255) ccACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGcccc < 1:8110231/150‑1 (MQ=255) aCCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCgg > 1:4340704/1‑150 (MQ=255) gcgcCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGaaaa > 2:208515/1‑150 (MQ=255) gcCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAgg > 1:2242570/1‑150 (MQ=255) gcCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAgg < 2:3516481/150‑1 (MQ=255) tgctgACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACg < 1:773165/150‑1 (MQ=255) tgctgACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACg > 1:5182674/1‑150 (MQ=255) gACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGt < 2:284493/150‑1 (MQ=255) ccGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGa > 1:130077/1‑150 (MQ=255) ccGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGa < 1:4950863/150‑1 (MQ=255) cGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGaa > 1:6407738/1‑150 (MQ=255) cGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGaa > 1:4833215/1‑150 (MQ=255) gcCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACctg > 1:8000375/1‑150 (MQ=255) gcCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACctg < 2:1223648/150‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGTCTGGGATCGCAGCTGGATGGTCATCTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACctgc < 2:449924/150‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGTATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGTATCGTGCCAAGCT‑TGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACctgc < 2:7611507/150‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACctgc < 2:1766292/150‑1 (MQ=255) ccGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACctgc > 1:6619660/1‑150 (MQ=255) cTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGTCTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTc < 2:6692914/150‑1 (MQ=255) cTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTc < 2:4375986/150‑1 (MQ=255) cccGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGAc < 2:5961639/150‑1 (MQ=255) cccGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGAc > 2:3980004/1‑150 (MQ=255) ccGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGTGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGAcc > 1:1510757/1‑150 (MQ=255) cGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGAccc > 2:565640/1‑150 (MQ=255) cGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGAccc > 1:1630947/1‑150 (MQ=255) cACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggc < 2:6386951/150‑1 (MQ=255) ccAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcct > 1:4486156/1‑150 (MQ=255) ccAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGCATCGTG‑CCAGCTGGGCACGAtc < 2:6533058/107‑2 (MQ=255) ccAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGCATCGTG‑CCAGCTGGGCACGAtc > 1:6531513/1‑106 (MQ=255) cAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcctg < 1:6064954/150‑1 (MQ=255) cAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcctg > 2:6200561/1‑150 (MQ=255) aGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcctgg > 1:8647108/1‑150 (MQ=255) aGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcctgg > 1:7174096/1‑150 (MQ=255) ggCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGCCCACTTCCAGCCGAGGCGCGTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAACAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcctggc < 2:5359746/150‑1 (MQ=255) gCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGggcctggcc < 1:2740371/150‑1 (MQ=255) cGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGcccc > 1:7385672/1‑105 (MQ=255) gAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCttt < 1:1384204/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCGGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTg < 1:1078658/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAGGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTg < 1:5672646/150‑1 (MQ=255) aGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTg < 2:6999761/150‑1 (MQ=255) cGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCgg < 2:6470367/150‑1 (MQ=255) tGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCTCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCccacc > 2:5078773/1‑150 (MQ=255) tGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCccacc < 2:2937819/150‑1 (MQ=255) tGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCccacc > 2:6792436/1‑150 (MQ=255) ggAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCcaccac > 1:3236874/1‑150 (MQ=255) cTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCtgtg < 2:4713086/150‑1 (MQ=255) gatggaCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCt < 2:6285261/150‑1 (MQ=255) gatggaCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCt > 1:398361/1‑150 (MQ=255) gatggaCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCt < 2:773371/150‑1 (MQ=255) tggaCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTgg < 2:4841784/150‑1 (MQ=255) gaCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGaa < 1:6896966/150‑1 (MQ=255) gaCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGaa < 1:5299296/150‑1 (MQ=255) aCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAAt > 1:7828119/1‑150 (MQ=255) aCAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAAt > 1:1794090/1‑150 (MQ=255) aaCTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATgg < 2:3344806/150‑1 (MQ=255) aaCTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATgg > 2:7343450/1‑150 (MQ=255) aCTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGc < 2:7887646/150‑1 (MQ=255) cTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCt > 2:1024874/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTc > 2:8024577/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTc > 2:1535812/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTc > 1:2434222/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTc > 1:8196595/1‑150 (MQ=255) ttCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTc > 2:2632778/1‑150 (MQ=255) ccAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGa < 2:4073514/150‑1 (MQ=255) cAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGAc < 1:699096/150‑1 (MQ=255) cAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGAc < 2:1086706/150‑1 (MQ=255) aGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACg < 1:3824328/150‑1 (MQ=255) gCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACgg > 2:872789/1‑150 (MQ=255) gcgcTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCcagca < 2:5299321/150‑1 (MQ=255) ttCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCCGCAGCtt > 2:2509645/1‑150 (MQ=255) ttCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCtt > 1:8373850/1‑150 (MQ=255) ggCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGaa < 2:3795211/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGaa < 2:8481220/150‑1 (MQ=255) ggCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGaa < 1:391766/150‑1 (MQ=255) ccgccgccTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAgg < 1:453607/150‑1 (MQ=255) gccTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCAccc > 2:8639106/1‑150 (MQ=255) ccTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCa < 1:2800996/150‑1 (MQ=255) tgtgGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAgg > 2:2338846/1‑150 (MQ=255) gtgGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGt < 2:3579214/150‑1 (MQ=255) gATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCt < 1:4276512/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCATCTTGAAGGCACCCAGGTGCTg < 2:2667513/150‑1 (MQ=255) aTCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTg < 2:1854212/150‑1 (MQ=255) tCGTG‑CCAGCTGGGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTgg > 1:3441693/1‑150 (MQ=255) cccAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACttt < 2:7479286/150‑1 (MQ=255) cccAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACttt < 1:373372/150‑1 (MQ=255) ccAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACTTTg < 1:5432426/150‑1 (MQ=255) cAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACTTTgg < 2:8102731/150‑1 (MQ=255) aGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACTTTGGc < 2:3082911/150‑1 (MQ=255) t‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACTTTGGCTGc > 2:5732322/1‑150 (MQ=255) | ACAGGTGTTCGCCCACCTGCGCCTGCTGACCGGCGCCGAGCTGCCCGAGCACCAGGCCGAGGTGATCGAGGACCAGGACTGGGAACGCAGCTGGATGGACAACTTCCAGCCGATGCGCTTCGGCCGCCGCCTGTGGATCGTGCCCAGCT‑GGCACGATGCCCCGGAAAAGGACGCCGTGAACCTGCTGCTCGACCCGGGCCTGGCCTTTGGCACCGGCACTCACCCCACCACGGCCCTGTGCCTGGAATGGCTCGACGGCCAGCAGCTTGAAGGCACCCAGGTGCTGGACTTTGGCTGC > NC_002947/5484788‑5485085 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |