| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | NC_002947 | 2,146,043:1 | +A | 7.8% | coding (787/2214 nt) | PP_1897 → | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | NC_002947 | 2,146,043 | 1 | . | A | 7.8% | 1512.1 / 121.0 | 372 | coding (787/2214 nt) | PP_1897 | DNA internalization‑related competence protein ComEC/Rec2 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (175/168); new base A (16/13); total (191/181) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.03e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.96e-01 | |||||||||||
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
GTTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTGCACTGGTC > NC_002947/2145895‑2146192 | gTTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑t < 2:179290/150‑1 (MQ=255)gTTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑t < 2:3317825/150‑1 (MQ=255)gTTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑t > 2:5371414/1‑150 (MQ=255) 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GTTGCAGGCCACCGGCACGGTGCACCTGTTGGTGATTTCCGGCCAGCACATCGGCCTGGTCGCCGGTTTGCTCTATGGCCTGGTCGCCGGGCTGGCGCGTTGGGGGCTATGGCCGGCAAGGCTACCGTGGTTACCCTGGGCCTGCGGCC‑TGGCCATGGCCGCAGCGCTGGCCTACGGGTGGCTGGCTGGCGGTGGGGTGCCAGTGCAGCGGGCCTGCCTGATGCTGGCCGTGGTGTTGCTCTGGCGTCTGCGCTTTCGCCACCTTGGCGCTTTTTTTCCGTTGCTGGTTGCACTGGTC > NC_002947/2145895‑2146192 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |