New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 726899 = | 337 (0.900) | 26 (0.080) | 12/248 | NT | 7.4% | intergenic (‑143/+124) | PP_0620/PP_0621 | GntR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 726986 = | 344 (1.020) | intergenic (‑230/+37) | PP_0620/PP_0621 | GntR family transcriptional regulator/hypothetical protein |
Only 100 of 121 total aligned reads displayed.
AGGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/727060‑726899 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC > NC_002947/726986‑727134 AGGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGC > 1:1172205/1‑150 AGGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGC > 1:1249152/1‑150 AGGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGC < 1:6511397/150‑1 GGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCC < 1:6104222/150‑1 GGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCC < 1:2647910/150‑1 GCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCC > 2:7146422/1‑150 GCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCC < 1:2669929/150‑1 GCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCC > 1:6528224/1‑150 CCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCGTGCCCG < 1:2062974/150‑1 CCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCG > 1:7980429/1‑150 CCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCG > 1:1484369/1‑150 cctgCTGCAGGTGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGC > 1:6428636/5‑150 CCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGC < 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CTCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGG < 1:4443435/150‑1 TCCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGC > 1:1972692/1‑150 CCCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCA < 2:2669929/150‑1 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCAC > 2:4540364/1‑150 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCAC > 2:7576424/1‑150 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCAC > 1:6103707/1‑150 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCAC > 1:7781132/1‑150 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCAC > 2:6048599/1‑150 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCAC > 1:885223/1‑150 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGGTGGGCAGGTGCACGCCGCACTGGGCcc > 1:7062796/1‑148 CCACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCA < 2:5624504/59‑1 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCTGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 2:6487253/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 1:1086308/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 1:791895/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 2:4256159/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 1:2440780/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 2:7378290/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 2:5727507/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 2:6499791/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGCGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAG > 2:6780600/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCAAGGGCCCTGCTGCAGGTGTGCCTGTCTGCAATAACACTCATTGCCATGCTGCAGCGACCGGTCGTTGGGCAGGAGCAAGCCGCAATGTGAACAG > 2:511720/1‑150 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTG > 2:2409093/1‑50 ACAGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTG < 1:2409093/50‑1 AGATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCG > 1:2427539/1‑150 GATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC < 1:8182541/150‑1 AGGCCCACCTGCAGCAGGGCCCTGGCCACCAAGGCTGAACACGATGTCTGTTCAATCCTGAAACCAATTCGAAATCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAGGCACCACGGTGTATGGCACCGGCTTCGCCGGTGTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/727060‑726899 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcccgctcccacagATTTCGAATTGGTTTCAGGATTGAACAGACATCGTGTTCAGCCTTGGTGGCCAGGGCCCTGCTGCAGGTGGGCCTGGCTGCAATACCACTCATTGCCCTGCTGCAGCGCCCGGTCGTTGGGCAGGTGCACGCCGCAATGGGCACAGCGC > NC_002947/726986‑727134 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |