New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 1154883 = | 482 (1.280) | 37 (0.110) | 12/252 | NT | 8.1% | intergenic (‑175/+82) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
? | NC_002947 | 1154944 = | 398 (1.160) | intergenic (‑236/+21) | PP_1008/gapA | RNA polymerase subunit sigma‑24/glyceraldehyde‑3‑phosphate dehydrogenase |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
GCTGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/1155043‑1154883 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCG > NC_002947/1154944‑1155092 GCTGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGACGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGT < 2:402291/150‑1 GCTGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGT > 2:3829931/1‑150 GCTGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGT < 1:8438711/150‑1 GCTGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACAGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGACAACAACGAGGAGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGT > 2:1161287/1‑150 TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTC > 2:542429/1‑150 TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTC < 2:4506399/150‑1 TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTC > 1:2759266/1‑150 TGGCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTC < 1:3115357/150‑1 GCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGATCCCTGGGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGC < 1:89279/150‑1 GCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGC > 1:4252813/1‑150 GCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGC < 1:8152395/150‑1 GCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGC < 1:2342580/150‑1 GCCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGC > 2:1828293/1‑150 CCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCG > 2:295427/1‑150 CCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCG < 1:7996618/150‑1 CCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCG < 2:3833603/150‑1 CCTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCG > 2:3891429/1‑150 CTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG > 1:7128574/1‑150 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1:1271564/150‑1 CTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG < 1:2316623/150‑1 CTGGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG < 1:392772/150‑1 GGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGC > 2:1472987/1‑150 GGTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGC < 2:4753386/150‑1 GTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGGGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCA > 1:5957493/1‑150 GTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCA > 1:1920593/1‑150 GTATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGG > 2:5077680/1‑147 TATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAA < 1:4305149/150‑1 TATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAA < 2:16466/150‑1 ATGACAACGAGTGGGGGTTCAGCAACCGGATGCTGGACAACTGCCTGGCGCTGCACCGGGCTGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAG < 1:4160623/150‑1 TGGCTGACGCGACCCGTGTGGGAGCGGCCTTGCCCGCGAAGCCAACACCGTGGTGGATGGCACGGGCTTCGCCCGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCCCAGGGATCGCGCCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATC > 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2:4367426/150‑1 TCGCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCA > 1:4300038/1‑150 GCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATC > 2:6345911/1‑150 GCGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATC < 1:3802850/150‑1 CGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCG > 1:6966966/1‑150 CGGGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCG > 1:8551020/1‑150 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1:5782452/150‑1 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 2:1441336/150‑1 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA > 2:6066260/1‑150 GGCAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA > 2:6065818/1‑150 GGCAAGCCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAA < 1:4759094/150‑1 CAAGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGA < 2:1271564/150‑1 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2:1320253/150‑1 AGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATC < 2:3444770/150‑1 AGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATC < 2:1320023/150‑1 AGGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGGTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATC < 2:4461712/150‑1 GGCCGCTCCCACACGGGTCGCGTCAGCCAGCCCGGTGCAGCGCCAGGCAGTTGTCCAGCATCCGGTTGCTGAACCCCCACTCGTTGTCATACCAGGCCAGCACCTTGAGCATCCGCCCGTTGGCCCGGGTATGGTTGGCATCGAAGATCG > 1:6819477/1‑150 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |