New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 2300767 = | 201 (0.530) | 40 (0.130) | 12/228 | NT | 20.6% | intergenic (+21/+112) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
? | NC_002947 | 2300852 = | 143 (0.460) | intergenic (+106/+27) | PP_5496/PP_2023 | hypothetical protein/glutathione S‑transferase family protein |
Only 100 of 142 total aligned reads displayed.
GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2300937‑2300767 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > NC_002947/2300852‑2301000 GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC > 2:8622464/1‑150 GGAGCGGGCTGGCGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTGCACGGCAAGCAGGGTCCGCTGATTAAACAGCGGGCTGCACCTGGGTCCGGGTGGGAGCGGGCAGGCCCGCGACGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTC < 1:3364354/150‑1 tggTGGCTGGTGGGGTGGCTGGCTTGGGAGCGTTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATGGGGCTGCACATGGGTCGGTGTGGGCGCGGGCCTGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGC < 1:6770092/147‑1 gggggTGGTGGGGTGGCTGGCTTCGGTGGTGTTCACGGCAATCATGGTCCGCTGTTTAAACATCGGGCTGCACTTGGGTCGTTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:6781398/145‑1 gTGGCTGGCGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTTATTAAACAGCGGGCTGCACAGGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:1901947/149‑1 cgGGCTGGTGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATTATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:4277476/148‑1 CTGGCTGGCGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACCTCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGGGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:4077958/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCACGGCAATCCTGGGCCGCTGATTAACCATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:6707152/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:925594/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:4124544/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATAAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 1:7273457/150‑1 CTGGCTGGAGGGGTGGCGGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCCGGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGG < 2:4124835/150‑1 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TGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCC < 2:834877/150‑1 TGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCC < 2:4906565/150‑1 GCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCA > 2:772906/1‑150 CTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCAC > 1:7259553/1‑150 TGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCGTGGCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGGTGGGACCGGGTGTGGCGGTGTTGGCGGGGATGGCCGCTGCCACA > 1:1160954/1‑150 TGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCCCCGCGGTGGCTGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA > 2:2918904/1‑150 ACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAAGGACCCAAGTGCAGCCCGATGTTTAATAAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAc > 1:5083788/1‑149 GCATGCCCGCGAAGCGGGCCCCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 2:8630545/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 1:5649752/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCAGGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 2:7614413/1‑150 GCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACAAGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCC > 2:8630518/1‑150 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2:4703395/1‑150 GGGCATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCC > 1:6595315/1‑150 GGGCATGCCCGCACCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCC < 2:7744848/150‑1 GGGCAGGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCC < 2:3401355/150‑1 GGGCAGGCCCGCTCACACACGGACCCATGTGCAGCCAGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCAGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCGCAGTGGTTCGccga < 2:1695783/150‑5 CATGCCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGG < 2:901079/150‑1 CCCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAA > 1:8643633/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC > 1:1204996/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC > 1:1801937/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC > 1:8386206/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC > 2:1996533/1‑150 CCGCTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC < 2:4502167/150‑1 CCGCTACCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAAC < 1:5555052/150‑1 CTCCCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGG < 2:6744551/150‑1 CCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC < 2:7534929/150‑1 CCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC > 2:6095268/1‑150 CCACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGC < 2:8759342/150‑1 aaACGGACCCATGTGCAGCCAGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCACACTGGCGCAT > 2:7001440/3‑150 ACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAT > 2:7001421/1‑150 ACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAT > 2:5115460/1‑150 ACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAT > 2:3408044/1‑150 ACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAT > 1:4820570/1‑150 ACACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCAT > 1:4498944/1‑150 CACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATC > 1:8666259/1‑150 ACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > 1:612425/1‑150 ACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > 2:2972076/1‑150 ACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > 2:2340146/1‑150 ACGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > 2:2339833/1‑150 GGAGCTGGCTGGAGGGGTGGCTGGCTTCGGAGCTGTTCAAGGCAATCATGGTCCGCTGATTAAACATCGGGCTGCACATGGGTCCGTGTGGGAGCGGGCATGCCCGCGAAGCGGGCACCGCGGTGGATGGCACCGGCTCTGCCGGTGTTCGCGGGCATGCCCGCTCCCACA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/2300937‑2300767 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcatgcccgctcccacaCGGACCCATGTGCAGCCCGATGTTTAATCAGCGGACCATGATTGCCTTGAACAGCTCCGAAGCCAGCCACCCCTCCAGCCAGCTCCGCACACGCGGATAAGCCGCCTCGGCGAACCACTGCGGTTCGACCCCGGCAAACTGGCGCATCA > NC_002947/2300852‑2301000 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |