| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5599092 = | 113 (0.300) | 21 (0.070) | 9/220 | NT | 16.6% | intergenic (‑39/+106) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase |
| ? | NC_002947 | 5599185 = | 121 (0.400) | intergenic (‑132/+13) | PP_4921/thiC | NCS1 family transporter/phosphomethylpyrimidine synthase | |||||
Only 100 of 126 total aligned reads displayed.
TCGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5599268‑5599092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > NC_002947/5599185‑5599333 TCGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGT > 2:239709/1‑150 CGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGGTTGGCCGCGGAGCCACCACGGCGGGGGGTGGCACCGGCGTTGCCGGTGTT > 1:8125314/1‑150 GAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCCGTGCATGGCACCGGCTATGCCGGTGTTC > 2:7961297/1‑150 GAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCAAAGCGGTGCCTGGCACCCGCGTTGCCGGTGTTC > 1:8616918/1‑150 GAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGAAGCAAGCCCGGCGGTGCATGGCACCGGCGTTGCCGGGGTTC > 2:4393256/1‑150 AGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCG > 2:3385152/1‑150 GCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGC < 1:2164/150‑1 GCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGC < 2:7489510/150‑1 CAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCG < 1:7123105/150‑1 CAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCG < 1:3265689/150‑1 cAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 2:7308654/149‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 1:7820191/150‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 2:5844075/150‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 1:3823883/150‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 1:8332132/150‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 1:704203/150‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 1:5891711/150‑1 AAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGG < 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AGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCGTGCCCGCGGAGCCACCACGGCGGTGCCTGGCACCGGCGTTGCCGGGGTTGGCGGG > 1:6253898/1‑150 GCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCA < 1:3525681/150‑1 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCGCTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA < 2:4077642/150‑1 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGTCGGTGTTCGCGGGCAA < 1:5529457/150‑1 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA < 2:2867374/150‑1 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA < 1:1064938/150‑1 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA < 1:1679141/150‑1 CATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAA < 1:1784319/150‑1 TGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGC < 1:5167535/150‑1 GAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCT < 1:2794276/150‑1 GCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTTCCCCCGCAGCAACCACGGCGGGGCATGGCCCCCGCGTTGCCGGGGTTGGCGGGGAAGCCCccgcc > 1:1661656/1‑145 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TCCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGAT > 1:4835332/1‑150 CCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATC < 1:3771909/150‑1 CCCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATC < 2:3638855/150‑1 CCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCT > 2:896558/1‑150 CCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCT > 2:4668325/1‑150 CCACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCT > 1:8603326/1‑150 CCACAGGGTAAGGTGCTGCGGGTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCT > 2:4537352/1‑150 CACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTT > 1:584568/1‑150 CACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTT > 1:8175005/1‑150 ACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTC > 2:4094825/1‑150 ACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTC < 1:1718737/150‑1 ACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTC > 2:735458/1‑150 ACAGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTGTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTC > 2:4601153/1‑150 AGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATTTTCAT > 1:6894228/1‑150 AGGGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCAT > 1:1156632/1‑150 GGTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCG > 2:3954991/1‑150 GTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTTCAGCTGGCTGACTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCTCATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGA < 1:3928072/150‑1 GTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGA < 1:8796457/150‑1 GTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGA > 2:3487677/1‑150 GTAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGA < 1:4370452/150‑1 TAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > 1:8352647/1‑150 TCGAGCAAGGCATGCGTGAGCAGGCCGAGCGGTTCCGCCAGGAAGGCAGCCAGCTGTACCACAAAGTCTAAACCGCAGCACCTTACCCTGTGGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGCAAGCACTGCGGTGCATGGCACCGGCTTTGCCGGTGTTCGCGGGCAAGCCCGCTCCCACAGGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_002947/5599268‑5599092‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ttcgcgggcaagcccgctcccacagggtAAGGTGCTGCGGTTTAGACTTTGTGGTACAGCTGGCTGCCTTCCTGGCGGAACCGCTCGGCCTGCTCACGCATGCCTTGCTCGACCGTCACATCCACGGCCTCGATCTTGGCAGCGTACTCACGCACTTCCTGGGTGATCTTCATCGAG > NC_002947/5599185‑5599333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |