New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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* | ? | NC_002947 | = 507026 | 323 (0.860) | 38 (0.110) | 23/248 | NT | 11.0% | intergenic (+35/+98) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
? | NC_002947 | = 507088 | 326 (0.970) | intergenic (+97/+36) | trpE/estP | anthranilate synthase component 1/esterase EstP |
Only 100 of 454 total aligned reads displayed.
GGTGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCA > NC_002947/506878‑507175 | ggTGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTa > 1:8350615/1‑150 (MQ=255) tGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTaaa < 1:2129514/150‑1 (MQ=255) ggcggcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAAc < 1:3546077/150‑1 (MQ=255) gcATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGc < 2:6478387/150‑1 (MQ=255) aTCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:4651277/150‑1 (MQ=255) cGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTttacccgcgaat < 1:6016243‑M1/150‑13 (MQ=255) cGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCgacaag < 2:7918107/150‑6 (MQ=255) cGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCgacaag < 2:63529/150‑6 (MQ=255) cGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCt > 2:5262212/1‑150 (MQ=255) tGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 1:3693314/150‑1 (MQ=255) gCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaa < 1:8401149/150‑1 (MQ=255) ccGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAg < 2:5847906/150‑1 (MQ=255) gACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGt > 2:7521476/1‑150 (MQ=255) gACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGt > 2:415189/1‑150 (MQ=255) aCTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGtt < 1:1949956/150‑1 (MQ=255) aCTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGtt < 2:4561815/150‑1 (MQ=255) ggTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAAc < 2:1675589/130‑1 (MQ=255) gTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCa > 1:533891/1‑150 (MQ=255) 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gaaACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATGGGGGCCGCTTTGCGGCCCATTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaacc < 1:576439‑M1/150‑47 (MQ=255) aaCCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCcgtc < 2:1201875/150‑1 (MQ=255) cATCTACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTa < 2:312325/150‑1 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTa < 2:2352716/150‑1 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTa > 1:8517133/1‑150 (MQ=255) cATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTa < 1:1346320/150‑1 (MQ=255) aTCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAg > 1:2334167/1‑150 (MQ=255) aTCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAg > 1:5176144/1‑150 (MQ=255) tCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtagg < 1:485753‑M1/150‑54 (MQ=255) aacaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggag < 2:70911‑M1/150‑56 (MQ=255) aacaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 2:6250930/110‑1 (MQ=255) aacaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAg > 1:4248562/1‑150 (MQ=255) acaaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGc < 2:4623112/150‑1 (MQ=255) caaGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCg > 2:1613622/1‑150 (MQ=255) acgcgccgGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTaaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgg < 2:379757‑M1/148‑59 (MQ=255) 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gattgGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATAAGATGCCGTCGTAGGAGCGGGTTAAACCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCAAGCTAAcacc > 1:3180502/1‑150 (MQ=39) ttgGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACACGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACg < 1:2964537/140‑1 (MQ=255) ttgGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCa > 2:3461568/1‑150 (MQ=255) ttgGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCa > 1:6236890/1‑150 (MQ=255) tgctgcGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAAt < 2:4769900/150‑1 (MQ=255) tgcGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCTCCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATAcc > 2:4287799/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATAcc > 1:7589842/1‑150 (MQ=255) tgcGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATAcc > 2:719390/1‑150 (MQ=255) cgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGTTTCACCCGCGAATGGTCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCt < 2:5442613/150‑1 (MQ=255) cgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCt < 2:209258/150‑1 (MQ=255) cgcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCt < 2:8170006/150‑1 (MQ=255) gcAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgc < 1:7046118‑M2/150‑72 (MQ=255) cAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGt < 1:8675191/150‑1 (MQ=255) aGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGtt < 1:415189/150‑1 (MQ=255) cccATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGc < 2:8350615/150‑1 (MQ=255) ccATTCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacgga > 2:3696100‑M1/1‑12 (MQ=255) cATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGt > 2:5038400/1‑150 (MQ=255) cATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACACGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGt > 2:2907077/1‑150 (MQ=255) ttCGCGGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaaca > 1:322508‑M1/1‑9 (MQ=255) cgcgGGTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatc < 1:3441427‑M1/150‑144 (MQ=255) gggTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgcc > 1:5917414‑M1/1‑4 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtca > 2:2696905/1‑150 (MQ=255) ggTgaacccgctcctacgacggcctcgtatgcctgaggcttgcgcaaccttgtaggagcgggtttacccgcgaatgggctgcgcagcagccccaatcaatttatctggcggaagtctgctcggccaacgccaccgcacggaacatcgccc > 1:1056595‑M1/1‑3 (MQ=255) ggTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcat < 2:6145348/150‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACtcatca < 1:887235/150‑1 (MQ=255) | GGTGGCGGCATCGTTGCCGACTCGGTGCCGGCGCTGGAATGGGAAGAAACCATCAACAAGCGCCGGGCGATGTTCCGTGCGGTGGCGTTGGCCGAGCAGACTTCCGCCAGATAAATTGATTGGGGCTGCTGCGCAGCCCATTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAGGTTGCGCAAGCCTCAGGCATACGAGGCCGTCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGCAAAGCGGCCCCCAGCAATTCAGAAGTCCACGCTAACCCCCACGCTAATACCCTGTTGCGTCAACTCATCA > NC_002947/506878‑507175 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |