New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1438010 | 207 (0.550) | 11 (0.030) | 8/236 | NT | 5.6% | intergenic (+42/+82) | xenA/PP_1255 | protein XenA/cis‑4‑hydroxy‑D‑proline oxidase |
? | NC_002947 | = 1438062 | 191 (0.600) | intergenic (+94/+30) | xenA/PP_1255 | protein XenA/cis‑4‑hydroxy‑D‑proline oxidase |
Only 100 of 344 total aligned reads displayed.
CTGGCCGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAGCCAACCGCCCCACC > NC_002947/1437861‑1438158 | cTGGCCGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCC < 1:3946190‑M1/150‑1 (MQ=255) gCCGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAACCCCGCa > 1:1009404/1‑150 (MQ=255) ccGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCAc < 1:3255118/150‑1 (MQ=255) ccGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCAc < 1:6144979/150‑1 (MQ=255) cGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCAcc > 2:5273235/1‑150 (MQ=255) cGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCAcc > 2:4184344/1‑150 (MQ=255) cGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTGTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCAcc > 2:8079449/1‑150 (MQ=255) gACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCAccc > 2:7012674/1‑150 (MQ=255) cccGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCcac < 1:1381591/150‑1 (MQ=255) ccGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCcaca < 2:2726941/150‑1 (MQ=255) gCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGATGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACaga < 1:8187612/150‑1 (MQ=255) gCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCTGGCAAGCCCGCACCCACaga < 1:3218455/150‑1 (MQ=255) gCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACaga < 2:3217073/150‑1 (MQ=255) tGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGaca < 1:3618601/150‑1 (MQ=255) aCTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAgg > 2:8620307/1‑150 (MQ=255) cTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGt < 1:7199433/150‑1 (MQ=255) cTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGt > 2:4833204/1‑150 (MQ=255) ttGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGttt < 1:7412850/150‑1 (MQ=255) 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tgcCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGa > 1:5272502/1‑150 (MQ=255) tgcCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGCTTCAGa < 1:2516155/150‑1 (MQ=255) gcCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGAt > 2:3440767/1‑150 (MQ=255) ccAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATa < 2:1682788/150‑1 (MQ=255) ccAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTCCAGATa < 1:212948/150‑1 (MQ=255) 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cATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCa < 2:5895696/150‑1 (MQ=255) cATTCGCGGGCAAGCCCGCACCAACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCa < 1:4922041/150‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAg > 2:1072004/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaa < 2:6229572‑M1/150‑137 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaa > 1:1624280‑M1/1‑14 (MQ=255) tCGCGGGCAAGCCCacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaa < 1:1807785‑M1/150‑137 (MQ=255) cgGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAGCCAAc > 2:5099114/1‑150 (MQ=255) gggCAAGCCCacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaaggtc > 1:6786751‑M1/1‑10 (MQ=255) gCACGCCCGCACCCCCCGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCGGTGGACGGGGGCGTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAGCCAACCGc < 1:481516/150‑1 (MQ=255) aaGCCCacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaaggtccagg > 2:7566587‑M1/1‑6 (MQ=255) aaGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAGCCAACCGccc > 1:468336/1‑150 (MQ=255) gCCCacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaaggtccaggag > 2:2058340‑M1/1‑4 (MQ=255) cccacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaaggtccaggagg < 2:5345870‑M1/150‑148 (MQ=255) cccGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAGCCAACCGCcccac < 2:3390047/150‑1 (MQ=255) ccacttccacagagagggtgcagtatctgaaacctgcggtgtctctgtgggtgcgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaaggtccaggaggc > 2:7320581‑M1/1‑2 (MQ=255) ccGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTgggcttgcccgcgaatgggctgcaaagcagcccctccaagcctcagcgataacgctcgagccagtgtgcataaggcgccggcaaggtccaggaggc < 2:4657446‑M2/150‑97 (MQ=255) | CTGGCCGACCCGCACTGGGCTTACTTTGCTGCCAAGGAGCTGGGGGTGGAAAAAGCCTCCTGGACCTTGCCGGCGCCTTATGCACACTGGCTCGAGCGTTATCGCTGAGGCTTGGAGGGGCTGCTTTGCAGCCCATTCGCGGGCAAGCCCGCACCCACAGAGACACCGCAGGTTTCAGATACTGCACCCTCTCTGTGGAAGTGGGCTTGCCCGCGAATGGGCCGGTAGGGGCTAAAACCGGTTCAGTCGGTATGCGCCCATCTCAGGCCCACCAGTCTGCTCAGCCAACCGCCCCACC > NC_002947/1437861‑1438158 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |