New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3192955 | 312 (0.830) | 17 (0.050) | 9/266 | NT | 5.2% | coding (1579/1659 nt) | actP‑II | acetate permease |
? | NC_002947 | = 3192992 | 317 (0.880) | coding (1616/1659 nt) | actP‑II | acetate permease |
Only 100 of 448 total aligned reads displayed.
GCTTCGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTAACCTCTGAAGATC > NC_002947/3192806‑3193104 | gCTTCGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCA > 1:814703‑M1/1‑150 (MQ=255) ttCGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAg > 1:6058124/1‑150 (MQ=255) ttCGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAg > 1:4265743/1‑150 (MQ=255) ttCGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAg > 1:2949690/1‑150 (MQ=255) cGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGc < 2:4603462/150‑1 (MQ=255) tggtgTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCg > 2:2938531/1‑150 (MQ=255) tgtTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGaaa < 1:2768697/150‑1 (MQ=255) gtTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAg > 1:4586529/1‑150 (MQ=255) ttttCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAgg < 1:1559846/150‑1 (MQ=255) tttCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAggg < 2:2637501/150‑1 (MQ=255) ttCCAAGCTGGGGTGGGTGGATGTGGTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCACACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGggc < 2:7725017/150‑1 (MQ=255) tCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGggcg < 2:4890295/150‑1 (MQ=255) tCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGggcg < 1:7468122/150‑1 (MQ=255) tCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGggcg > 2:6346184/1‑150 (MQ=255) tGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCttgg < 2:6590073/150‑3 (MQ=255) gtgtGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGcc < 1:1141805/150‑1 (MQ=255) gtgtGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGcc < 2:8094308/150‑1 (MQ=255) tgggtggATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTCTACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGAc < 1:3130019/150‑1 (MQ=255) 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tGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAaggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttg < 2:2949690‑M1/150‑40 (MQ=255) tGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGtg > 2:2766666‑M2/1‑148 (MQ=255) tGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGtg > 2:7102339‑M2/1‑148 (MQ=255) aCTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTGTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGtggcc < 2:7119757‑M2/150‑6 (MQ=255) cTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTCGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCa > 2:3070984/1‑150 (MQ=255) 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ccGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGAt > 2:234795/1‑150 (MQ=255) cGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATa < 2:245477/150‑1 (MQ=255) cGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATa < 1:7601292/150‑1 (MQ=255) cGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATa < 2:2218071/150‑1 (MQ=255) cGGATGGACCGAACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGAACGGCCTTGGTGACAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTAACCGCGCCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGCCCGTGTGATa > 2:5503891/1‑150 (MQ=255) ttGGCCCGCGCAGTGCGGTCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCt > 1:7110204/2‑150 (MQ=255) tGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCTAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTc < 2:1621148/150‑1 (MQ=255) gACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGACCGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGc < 2:4483245/150‑1 (MQ=255) gACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGc > 2:1914188/1‑150 (MQ=255) gACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGc < 2:833605/150‑1 (MQ=255) ccGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTa < 2:5989395/150‑1 (MQ=255) cGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGtggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcgg < 1:5337417‑M2/150‑98 (MQ=255) cGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAg > 2:6770268/1‑150 (MQ=255) cACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTa < 1:4806228/150‑1 (MQ=255) aCTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCcgc > 2:6294989/1‑102 (MQ=255) ggCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGtggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagt < 1:229583‑M2/150‑109 (MQ=255) ggCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTAACCTCTGaa < 1:3366612/150‑1 (MQ=255) ccAcggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaacaccgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgc < 1:4197327‑M1/150‑148 (MQ=255) cAcggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgca > 2:3924937‑M1/1‑2 (MQ=255) cAcggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgca < 1:6891685‑M1/150‑149 (MQ=255) cAcggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgca > 1:8259096‑M1/1‑2 (MQ=255) cAcggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgca > 1:8728690‑M1/1‑2 (MQ=255) cAcggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcagggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgca > 2:3455304‑M1/1‑2 (MQ=255) cAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTTGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTAACCTCTGAAGAt > 1:122503/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTAACCTCTGAAGAt > 1:84900/1‑150 (MQ=255) cAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTAACCTCTGAAGAt > 2:1396906/1‑150 (MQ=255) acggacgaactggtcggcgaaggccgccctttcggccttggcccgcgcagtgcggtccatccgggaaaccgcatacgccaccaaaaacgccagcggcatggagaacagcgcaggctgggtataggggaacagcggttcggcaaagtgcaa < 2:3357874‑M1/150‑150 (MQ=255) | GCTTCGTGGTGTTTTCCAAGCTGGTGTGGGTGGATGTGTTGCACTTTGCCGAACCGCTGTTCCCCTATACCCAGCCTGCGCTGTTCTCCATGCCGCTGGCGTTTTTGGTGGCGTATGCGGTTTCCCGGATGGACCGCACTGCGCGGGCCAAGGCCGAAAGGGCGGCCTTCGCCGACCAGTTCGTCCGTGGCCAGACCGGCCTTGGTGCCAGCGGTGCCGTCGATCATTGAGTTACCCGCGGCCGCAAGCGCAGGAGTGCCAGCGGCCGTGTGATAGCTCGCTAGTAACCTCTGAAGATC > NC_002947/3192806‑3193104 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |