| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5130084 = | 176 (0.470) | 20 (0.070) | 11/224 | NT | 14.8% | intergenic (+61/‑121) | PP_4511/PP_4512 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
| ? | NC_002947 | 5130163 = | 87 (0.290) | intergenic (+140/‑42) | PP_4511/PP_4512 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease | |||||
Only 100 of 269 total aligned reads displayed.
ATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCGGCGCAC > NC_002947/5129935‑5130232 | gatgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTc < 1:286181‑M1/3‑1 (MQ=255) tgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTcgc > 2:6733169‑M1/146‑150 (MQ=255) tgatcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTcgc > 2:8086918‑M1/146‑150 (MQ=255) cTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTcgc < 2:4910304/150‑1 (MQ=255) tCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTcgcg < 2:5002204/150‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCgg < 2:6231372/150‑1 (MQ=255) cGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCgg < 2:25333/150‑1 (MQ=255) atcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCgg > 2:6152018‑M1/144‑150 (MQ=255) atcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCgg > 1:4308296‑M1/144‑150 (MQ=255) tcgccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCggg < 2:6839182‑M1/8‑1 (MQ=255) gCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCggg < 1:4440288/150‑1 (MQ=255) gccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTa < 2:7011861‑M1/10‑1 (MQ=255) ccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTaa > 1:1437249‑M1/140‑150 (MQ=255) ccgggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTaa < 2:1556450‑M1/11‑1 (MQ=255) gggctggcgctggtggccagtttgccgatgacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAc > 1:8312206‑M1/138‑150 (MQ=255) ggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAcc > 1:97883‑M1/137‑150 (MQ=255) ggctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAcc > 2:4115049‑M1/137‑150 (MQ=255) gctggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAAccc > 1:7456910‑M1/136‑150 (MQ=255) tggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:5238864‑M1/134‑150 (MQ=255) tggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:4797347‑M1/134‑150 (MQ=255) cTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:5548902/150‑1 (MQ=255) cTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:3127534/150‑1 (MQ=255) cTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGc < 1:3457382/150‑1 (MQ=255) ttttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCt < 1:1298578/150‑1 (MQ=255) ggcgctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCt < 2:1878485‑M1/18‑1 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGTCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGGAAAcccccac > 1:5958050/1‑146 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:2313354/150‑1 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 1:4917423/150‑1 (MQ=255) tttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:6538762/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:4409975/150‑1 (MQ=255) ttCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTGGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTcc < 2:8446371/150‑1 (MQ=255) ctggtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAaaccgcgccaa < 1:3718473‑M1/22‑6 (MQ=255) cAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGACAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTa < 1:7771573/150‑1 (MQ=255) aGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTAc < 1:1557021/150‑1 (MQ=255) gcggcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 1:1029173/150‑1 (MQ=255) gcggcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACa < 2:3148733/150‑1 (MQ=255) gtggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg > 1:1269306‑M1/126‑150 (MQ=255) cggcgATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAg < 1:6508588/150‑1 (MQ=255) tggccagtttgccgaagacgccggtaaggccgaagaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccctTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAgg > 2:6451698‑M1/125‑150 (MQ=255) gATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATg < 2:4001347/150‑1 (MQ=255) gATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATg < 2:3183702/150‑1 (MQ=255) aTGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGc < 2:6631234/150‑1 (MQ=255) gctgcGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCCGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGccc < 2:7882708/150‑1 (MQ=255) 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agaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTa > 2:744885‑M1/92‑150 (MQ=255) agaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTa > 1:3242935‑M1/92‑150 (MQ=255) agaacagcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggatcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTa > 2:2378628‑M1/92‑150 (MQ=255) agcgcgccaatgtgcagtgcgccgagggcggtgcggtggttcatggtgggtccttgatggagatctctacaggcagtgccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGc > 2:5339632‑M1/87‑150 (MQ=255) gcggcgAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCGCCGAAAGGGTTCCCCCCCCGGTAATTTGTGCAAAAACAGTATGAGCg > 1:6276561/1‑150 (MQ=255) cggcgAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCgg < 2:4268220/150‑1 (MQ=255) cggcgAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCgg < 1:1910391/150‑1 (MQ=255) ggcgAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCggg < 1:7658736/150‑1 (MQ=255) ggcgAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTACAAAACCTGTAGGAGCggg < 1:7079119/150‑1 (MQ=255) agagTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTa < 2:6766683/150‑1 (MQ=255) agTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTAcc < 2:8804530/150‑1 (MQ=255) gTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGTGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTAccc < 1:6835979/150‑1 (MQ=255) tCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTTAGACCGCTCCTACAGGCTGCCCCCCCCGGGCTGTTGTGCAAAAACGGTAGGGGCGGGGTTAgccc > 2:3718473/1‑149 (MQ=255) ggCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGGAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCCCCTGCATGTTGTGCAAAACCTGTCGGGGCGGGTTTACCCGCGa > 2:5996601/1‑150 (MQ=255) tAACTGACAGCTGTTTTTCTACAGATTGTTTTTGCGGGTGGGTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAGTATGCCCCCCCCTTATTGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAggg < 2:3590573/150‑1 (MQ=21) tGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAgggccgg < 2:7209759‑M2/150‑8 (MQ=255) cagTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCGCCACCAGGATGCCCCCCCCGGCATGTTGTGCAAAACCGGGAGGAGCGGGGTTACCCGCGAAAGGGCCCGCACTGc > 2:3277623/1‑150 (MQ=255) ggcggtggttcttggtgggtccttgttggagatctctaccggccgtgccggccccTTCGCGGGTAAACCCGCCCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTTTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCt > 2:2795054‑M1/56‑150 (MQ=255) ttGCGACTGATTGTGTTTGCCTGAGGCTTTAAACTTTGCCTTGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGATTGTTGTGCAAAACCTGTAGGTGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTa < 2:1981251/150‑1 (MQ=38) ttGCGACATATTGTTTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACCGGTTGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTTTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTa < 2:4065466/150‑1 (MQ=38) gctaCAGACTGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTGGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTaga < 2:6217239/147‑1 (MQ=255) gACCGATTGTTTTTGGCTGTGGGTTGCCACTTTGCCTGTGCGGGCCCCTTCGCGGTTAAACCCGCTCCGACCGGTGGCCCCCGCCTGATTGTTGGGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAgaga < 2:7733284/150‑1 (MQ=25) gACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCCCACCAACACGAAGCCCCCCCCACAATGATGTGCCAAACCCCGACGACCCGGGTTACCCCCGCAACGGCCCGCCCAGCCAGTAcaga > 2:4494988/1‑150 (MQ=255) gAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCCCTCCAAAAGGATTCCCCCCCCAGAATGTTGTGCAAAAACAGTAGGAGCGGGGTTTACCGCGCAAGGGCCCGCACGGCCGGTAGAGAtcac > 2:1950931/1‑148 (MQ=255) tgtTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAAACCGCTCCGACAGGATTCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAAACAGTAGGAGCGGGTTTAACCGCGAAAGGGCCGGCACTTCCGGTAGAGATCACCATCa > 2:1241367/1‑150 (MQ=255) gtTTGCGTGTGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTTAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCaa < 2:5531999/150‑1 (MQ=255) gtTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATTTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGTTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCaa < 2:320763/150‑1 (MQ=255) tGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGGAAACCCCCGCCAACAGGGTGCCCCCGCCGGGAAGTTTGGCAAAACCTGTAGGTGCGGGTTTACCCCCGAAAGGGCCGGCACGGCCAGTAGAGATCTCCATCAATGAaccc > 1:6539370/1‑149 (MQ=255) aacTTTGCTTGTGCCGGCCCGTTCGTGGGTAAACACGCTCCTACAGTATGCCCCCGCATGTTTTTTGTGAAATACTTTAAGGTGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAacca < 2:1427412/149‑1 (MQ=255) tttgcctttgccGGCCCCTTCGCGGGTAAAGCCGCTCCTACAGGTTGGCCCCGGCTGGATTTTGTGCAAAACCTGGAGGTGGGGGTTTTCCCGCGGAAGGGGCGGGACTGCCTGTTGAGTTGTCCATCAAGGGCCCACCATGAAAcaccg > 2:2046769/1‑150 (MQ=255) cctttgccGGCCCCTCCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAAGGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACcaccgcacc < 2:5292248/150‑1 (MQ=255) ctttgccGGCCCCTTCGCGGGGAAACCCCCGCCGACAAGGTGCCCCCCCCGGGAAGTTGTGGAAAACCGGGTGGCGCGGGGTTTCCCCCGCAACGGCCGGCCCGGCCGGTAGAGCTCACCATAAAGGGCCCCCCCAGCACcaccgcaccc > 2:1012274/1‑149 (MQ=255) cGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAg > 1:8689430/1‑70 (MQ=255) cGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAg < 2:8689430/70‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGc > 1:4589906/1‑50 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGc < 2:4589906/50‑1 (MQ=255) cTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCGGCGCAc > 2:8283037/1‑150 (MQ=255) | ATAGCTCGCAAAGTGCCTTTTCAGCGGCGATGCTGCGGGCGTTCGGGTGTACACCTTTGGCTTTGCGGCGAGAGTCTGGCGATAACTGACAGCAGTCTTGCGACAGAATGTGTTTGCCTGAGGCTTTACACTTTGCCTTTGCCGGCCCCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAGGATGCCCCCGCCTGAATGTTGTGCAAAACCTGTAGGAGCGGGTTTACCCGCGAAAGGGCCGGCACTGCCTGTAGAGATCTCCATCAAGGACCCACCATGAACCACCGCACCGCCCTCGGCGCAC > NC_002947/5129935‑5130232 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |