| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5524822 = | 275 (0.730) | 20 (0.060) | 17/256 | NT | 7.1% | intergenic (‑96/‑130) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease |
| ? | NC_002947 | 5524907 = | 270 (0.770) | intergenic (‑181/‑45) | PP_4852/PP_4853 | AraC family transcriptional regulator/DMT superfamily permease | |||||
Only 100 of 332 total aligned reads displayed.
CACCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCC > NC_002947/5524673‑5524969 | agaagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagccc < 2:5923827‑M1/2‑1 (MQ=255) ccGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCt > 1:7085738/1‑150 (MQ=255) cGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCtt < 2:2904730/150‑1 (MQ=255) cGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCtt > 2:3052553/1‑150 (MQ=255) aagccgatctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCtt < 1:6987945‑M1/4‑1 (MQ=255) gggCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcg > 2:4890104/1‑150 (MQ=255) gCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcgcg < 1:7415899/150‑1 (MQ=255) gCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTcgcg < 1:2534410/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCggg < 1:8598859/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCggg < 2:5111810/150‑1 (MQ=255) cGGCAGTAGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGGAGTTACCCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGATGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGAAAATACAGGCCTATCGAGGACCAGCCTAGCAGGCCTACGCggg > 1:3993805/1‑150 (MQ=255) atctccgcagggtggatggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCggg < 2:2747933‑M1/10‑1 (MQ=255) gCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCt > 2:6568129/1‑150 (MQ=255) gTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTccc < 2:1513044/150‑1 (MQ=255) gTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTc < 2:6167244/150‑1 (MQ=255) gTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTc < 2:7854999/150‑1 (MQ=255) gTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTc < 2:1744181/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCca < 1:6186315/150‑1 (MQ=255) aaCTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCca < 1:2116368/150‑1 (MQ=255) atggcaccggcggacatcttggtgaccacggtgttgccggcccagatgaggatggcggtgagggggaacaggtagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgctttgcagcCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCcaca > 2:1972664‑M1/126‑150 (MQ=255) ggggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGa < 1:785346/150‑1 (MQ=255) ggggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGa > 1:6276421/1‑150 (MQ=255) gggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGAt < 2:4674021/150‑1 (MQ=255) ggATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGAta > 1:8568892/1‑149 (MQ=255) gATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCt < 1:1560473/150‑1 (MQ=255) gATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCt > 1:8396054/1‑150 (MQ=255) tatCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTgc < 2:4192430/150‑1 (MQ=255) tatCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTgc < 1:1264612/150‑1 (MQ=255) cGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGcc > 2:5323515/1‑150 (MQ=255) aGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCACCCACAGGATCTGCGCCAg > 1:2578791/1‑150 (MQ=255) aGGTATTAACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGcccg > 1:4250181/1‑148 (MQ=255) gTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGcc > 2:2243961/1‑150 (MQ=255) gTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGcc > 1:467834/1‑150 (MQ=255) gaCGCGGCATGCTGTCTGCATTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAg < 1:7511219/149‑1 (MQ=255) cTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATc > 2:1477484/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATc > 2:7948549/1‑150 (MQ=255) cTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATc < 2:915214/150‑1 (MQ=255) tGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcc > 1:7983513/1‑150 (MQ=255) tGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATcc < 2:3761880/150‑1 (MQ=255) tCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCGCCAGGCCAGTGTATcccc > 1:5923827/1‑150 (MQ=255) cTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTa < 2:4288219/150‑1 (MQ=255) cTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTa > 1:6463216/1‑150 (MQ=255) tttGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAg > 2:5772540/1‑150 (MQ=255) 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cGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTc < 1:940729/150‑1 (MQ=255) ggTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCa < 2:1847614/150‑1 (MQ=255) ggTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGACAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCa > 2:2767273/1‑150 (MQ=255) ttGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCCCTCCCCCAGGATATTCGCCAGCCACCACGCCTGTGTATACCCCCGAGGAGCGGGTTAAcc > 1:101201/1‑150 (MQ=255) gtGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCAcc < 2:3448442/149‑1 (MQ=255) 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aaGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCa < 2:559208/105‑1 (MQ=255) ataGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCCGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCaaa > 1:5451863/1‑150 (MQ=255) taGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTTACCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCGGCaaac > 1:6738987/1‑149 (MQ=255) ggCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAagca > 1:1432186/1‑150 (MQ=255) tagttcatgcagcagggtactcgctgggggctggaatggggctgccttgcaggCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAagcag > 2:4014603‑M1/54‑150 (MQ=255) gCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAagcag > 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agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa < 1:1120102/150‑1 (MQ=255) agacaCTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCa < 2:2479339/150‑1 (MQ=255) tCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGccccc > 2:3431677/1‑150 (MQ=255) cGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCa < 2:7173477/150‑1 (MQ=255) gATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAg < 2:5249764/150‑1 (MQ=255) gATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTACCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAg < 2:2978800/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 1:2243961/150‑1 (MQ=255) aataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCGTGCAGGCCTTCGCGGGCGCCCCGCTCCCACCGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGa < 2:7253468/150‑1 (MQ=255) ataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAg < 1:3687995/150‑1 (MQ=255) ataCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAg < 2:6821117/150‑1 (MQ=255) aCAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCACCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTa > 1:3463547/1‑150 (MQ=255) aGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTAcc < 2:7633993/150‑1 (MQ=255) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCCTTACAGCCCCCAGCGAGTACCcggct > 1:1979717/1‑150 (MQ=255) tATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCctgct > 1:4947971/1‑150 (MQ=255) gAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCt < 2:8616071/67‑1 (MQ=255) aGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCGCCCACAGGGTCTGCGCCAGCCTCCAGGCCGGGGTATGCCCCGGAGGGGCGGGGTGACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCCGCCCCAGTCCAGCCCCCCCCGAGTAACCGGGTGCATg > 1:3304011/1‑150 (MQ=255) ggACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGa < 1:1818973/150‑1 (MQ=255) ggACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGa < 1:3421745/150‑1 (MQ=255) cTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGGTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTa > 2:4499123/1‑150 (MQ=255) tGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACACGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTAc < 2:5536404/150‑1 (MQ=255) ttGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTa > 2:854381/1‑70 (MQ=255) ttGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCAATCCAGCCCCCAGCGAGTACCCAGCTGCATGAACAACCTGt > 1:6496329/1‑150 (MQ=255) ttGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCGCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCAGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCCGCGAGTACCCGGCTGCATGAACTACCGGt > 2:1191765/1‑150 (MQ=38) cAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTACCACAGGATATTCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTCGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCGGCAAAGCAGCCCCCTTCCAGCCCCCCGCGGGTACCCTGCTGGATGGACTACCTGTGcc > 1:5754481/1‑150 (MQ=37) aGGCCTTCGCGGGCTACCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCCTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCAGTTccc > 2:5641934/1‑150 (MQ=255) ggCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTcccc < 1:5246553/150‑1 (MQ=255) | CACCGGGGCCGGCAGTTGGGTGAACTGGGGGATATCGAGGTATTTACGCGGCATGCTGTCTGCTTTGCAGGGTCGGTTGTCTGGATAGAAGTATAGGCTTGTAGACAGACACTCGATAATACAGGCCTATCGAGGACCTGCCTTGCAGGCCTTCGCGGGCTCCCCGCTCCCACAGGATCTGCGCCAGCCTCCAGGCCTGTGTATCCCCCGTAGGAGCGGGTTCACCCGCGAAGGGCTGCAAAGCAGCCCCATTCCAGCCCCCAGCGAGTACCCTGCTGCATGAACTACCTGTTCCCC > NC_002947/5524673‑5524969 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |