New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5923347 | 274 (0.730) | 30 (0.090) | 17/242 | NT | 10.6% | intergenic (+32/+63) | ygiF/PP_5188 | thiamine triphosphatase/AsnC/Lrp family transcriptional regulator |
? | NC_002947 | = 5923387 | 268 (0.810) | intergenic (+72/+23) | ygiF/PP_5188 | thiamine triphosphatase/AsnC/Lrp family transcriptional regulator |
Only 100 of 492 total aligned reads displayed.
GAAAAAGCTGCACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATCCCCGGCACGTTCG > NC_002947/5923198‑5923495 | cggacatcgaggcctacgagcggttcttcttcgaaaaactgtcgaacgtgccggggattcaggaggtgaactcgattgtggcgctttccgagatcaagtccaccactagcctgccgctaccgcggtgaggccaTTCGCGGGTAAACCCGc > 1:3453241‑M1/134‑150 (MQ=255) aaaaGCTGCACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTc < 2:1768252/150‑1 (MQ=255) aaaGCTGCACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTTTACCCGCgaa < 1:4839042‑M1/150‑4 (MQ=255) gCACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaaa < 2:8565315/150‑1 (MQ=255) gCACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACaaa > 2:5369608/1‑150 (MQ=255) cACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAg < 1:6220302/150‑1 (MQ=255) cACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAg < 2:3558817/150‑1 (MQ=255) cACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAg > 2:4196143/1‑150 (MQ=255) gAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGtt > 2:5519595/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTCCAAAGGTTCGCGcc > 2:4628632/1‑150 (MQ=255) gCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGcc > 2:3763748/1‑150 (MQ=255) gcagcCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGATTCGCGGGTAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggc < 1:3588388‑M1/150‑25 (MQ=255) cagcACTTCATCGCTGATGGGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGt > 1:8400998/1‑150 (MQ=39) 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aGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgc > 1:4954087‑M2/1‑148 (MQ=255) gTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcg < 2:4022103‑M1/150‑44 (MQ=255) gTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcg < 2:909415‑M2/150‑4 (MQ=255) gTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcg > 2:733061‑M2/1‑147 (MQ=255) tGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcgg > 2:5748396‑M2/1‑146 (MQ=255) aacgtgccggggattcaggaggtgaactcgattgtggcgctttccgagatcaagtccaccactagcctgccgctaccgcggtgaggccaTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCgg > 2:5836989‑M1/90‑150 (MQ=255) gCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcggg > 2:2032231‑M2/1‑145 (MQ=255) gcgcGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcgggtttaccc > 1:1775945‑M2/1‑138 (MQ=255) gcgTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcgggtttacccgc < 2:8112210‑M2/150‑15 (MQ=255) gAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGc > 2:4472287/1‑150 (MQ=255) 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tGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCAcctcct > 2:5064765/1‑150 (MQ=255) gCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTg > 2:2936080/1‑150 (MQ=255) tCGCGGGTAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatac > 1:6293347‑M1/1‑16 (MQ=255) gcgGGTAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgc > 2:4874728‑M1/1‑14 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTTAGGCCGGTGTAGGCgcggggtaacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgc < 2:3335804‑M2/150‑99 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTATTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATcccc > 1:925870‑M1/1‑150 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATcccc > 1:692141‑M1/1‑150 (MQ=255) ggTAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgct > 1:4650534‑M1/1‑11 (MQ=255) GGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATCCCCg > 2:8722383‑M1/1‑150 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATCCCCgg < 1:7733326‑M1/150‑1 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATCCCCgg < 1:5986394‑M1/150‑1 (MQ=255) tAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagtaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgcttc < 2:7776642‑M1/150‑142 (MQ=255) tAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgcttc < 1:2265056‑M1/150‑142 (MQ=255) tAAACCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgcttc < 1:1017867‑M1/150‑142 (MQ=255) aaaCCCGCgcctacaccggcctcacgcctggcgcgaacctttgtaggagcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgcttcc > 1:2089954‑M1/1‑8 (MQ=255) 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cGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgcttccagcac < 2:7811252‑M2/150‑108 (MQ=255) gCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCgcgggtttacccgcgaagcaggcgacgcggtatcacgccttgagcaggtgcttccagccgcggctctggtccaccgcccgagcctgttcgatacgcgcttccagcact < 2:4058002‑M2/150‑109 (MQ=255) | GAAAAAGCTGCACGAGCTGGCCGAGCAGCCCATCAGCGATGAAGTGCTGGAAGCGCGTATCGAACAGGCTCGGGCGGTGGACCAGAGCCGCGGCTGGAAGCACCTGCTCAAGGCGTGATACCGCGTCGCCTGCTTCGCGGGTAAACCCGCTCCTACAAAGGTTCGCGCCAGGCGTGAGGCCGGTGTAGGCGCGGGTTTACCCGCGAATGGCCTCACCGCGGTAGCGGCAGGCTAGTGGTGGACTTGATCTCGGAAAGCGCCACAATCGAGTTCACCTCCTGAATCCCCGGCACGTTCG > NC_002947/5923198‑5923495 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |