New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 5948627 | 121 (0.320) | 14 (0.040) | 6/232 | NT | 11.3% | intergenic (+30/+55) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
? | NC_002947 | = 5948648 | 119 (0.380) | intergenic (+51/+34) | PP_5210/PP_5211 | alcohol dehydrogenase/ChaC‑related protein |
Only 100 of 313 total aligned reads displayed.
GCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCG > NC_002947/5948478‑5948775 | tatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAccc < 2:6774191‑M1/22‑1 (MQ=255) tatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAccc > 1:1754429‑M1/129‑150 (MQ=255) tatggcaccacgcgggagtatgtcgagcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAAccc > 2:1502506‑M1/129‑150 (MQ=255) cGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGc < 1:4276596/150‑1 (MQ=255) cGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGc > 1:5032474/1‑150 (MQ=255) gggCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTTTACCCGcgaa < 1:3097744/150‑4 (MQ=255) ccacgcgggagtatgtcgatcagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTa > 2:4924234‑M1/122‑150 (MQ=255) gTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGTTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAgg < 2:3731233/150‑1 (MQ=255) gAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGa < 1:1713978/150‑1 (MQ=255) ccGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGt < 1:2518302/150‑1 (MQ=255) gtCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtt > 1:8152559‑M2/1‑145 (MQ=255) cagaccttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGttt > 1:1239081‑M1/102‑150 (MQ=255) cGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggttta < 1:5506450‑M1/150‑29 (MQ=255) gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttac > 2:2141213‑M2/1‑142 (MQ=255) gCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTAG‑CGGGTAAACCCGCTCCAACACGCGACCGAGCCgggtttaa < 1:7720002‑M2/150‑9 (MQ=255) aGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttaccc < 2:3346672‑M1/150‑32 (MQ=255) ttgaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCcgc > 2:2175899‑M1/96‑150 (MQ=255) aCTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAggggttacccgc < 2:7327988‑M2/150‑13 (MQ=255) ttATCCTCTTGCAGAAGCCGGGGTTGCTTTCGTGTAGCTGGGGCTTGGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGGTGGCCAGGTTAGGCTGTAGGGGCCTCTTCG‑GGGGTTTTCGCGGTGCTTCAGGCGTCCGTGCAGGGTTTACCGGCGa < 2:710430/150‑1 (MQ=255) gaatgcactgcgcagtcaccagatgcccgatcgcaacctggaagcgcgattcaggcgttgccacaatctgcgcgaagtgtgagcaacctgttcCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGa > 1:4812362‑M1/94‑150 (MQ=255) ccACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagag < 1:102351‑M1/150‑40 (MQ=255) ccACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagag < 1:7496864‑M1/150‑40 (MQ=255) tGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTAc > 1:6337961/1‑115 (MQ=255) gggcAGAAGCGGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTATGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTACGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAACCCCGCTCCTACAGGCGACGGTGCAgggtttacccgcgaagaggccg > 1:4187358‑M2/2‑128 (MQ=255) ggCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagc < 2:256653‑M1/127‑22 (MQ=255) gCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGGTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTAG‑CCGGTAAACCCGCAACAACAGTCCACCGAGACcggtttacccgcgaagaggcccga < 1:5775666‑M2/150‑25 (MQ=255) aGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCGTCG‑CGGGTAAACCCCCGCCAACAGGCGCCCCGGGCGGGGTTAACCGCGCACAGGGCGGAAc > 1:6933011/1‑150 (MQ=255) aGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCGTCG‑CCGGGAAAACCCCGCCCAAACGCGACCCGGCCCGGTTTAACCCCCAAGAGGCCCGcacacg > 1:4459104/1‑148 (MQ=255) tATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGGGAACCCCCGCCACCAGGCGACCCGGCACGGTTTTACCCCGCAGAGGCCGGCACCGGGTGCGCacacag > 1:6727391/1‑148 (MQ=255) aTCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CCGGTAAAACCCCACCGACACGCGCCCCGGCCCGGTTTACCCCCGGAGAGGCCCGCACACGTTGCGCACACATc > 1:8473232/1‑150 (MQ=255) cGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTcgc < 2:3354238/150‑1 (MQ=255) cGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTcgc < 2:4038701/150‑1 (MQ=255) gagaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTcgcg < 2:3515374/150‑1 (MQ=255) gaAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCGTAGCCGGGTAAACCC‑CACCCAAACGCGCCCCGGCCCGGTTTTCCCGCCCAGAGGCCGGCACAGGTTGCGCAAACAACgcgcc > 1:6040053/1‑149 (MQ=255) cTGGGGCACCGGCTGGCTGTGGTTATGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCACCTACCGGCGACGGTGCTGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGAtt < 1:6180026/150‑1 (MQ=38) tGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGAttt > 2:6850579/1‑149 (MQ=255) tGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtg > 2:5355371/1‑150 (MQ=255) gggCACCGGCCGGCTGTGGGTATGTGGGTGGTGGTGGCCCGGAACGGCTGTCGCGGCCTCTCCG‑CGGGTAAACCCGCTCCCCCCGGCGACGGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATtgtg < 1:353359/150‑1 (MQ=255) 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ctctTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtgg < 1:7497352‑M2/150‑112 (MQ=255) tctTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtgga < 2:1718506‑M2/150‑113 (MQ=255) TCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCa < 2:4162587‑M1/150‑1 (MQ=255) TCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCa < 2:1247842‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCAtt < 1:1498466‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCAtt < 2:470312‑M1/150‑1 (MQ=255) TTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCAtt < 1:2313933‑M1/150‑1 (MQ=255) g‑cgGGTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagt > 1:216055‑M1/1‑12 (MQ=255) G‑CGGGTAAACCCGCTCCTACCGGCGACCGTGCAGGGTTAACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa > 1:7400198‑M1/1‑150 (MQ=255) G‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa < 1:6081669‑M1/150‑1 (MQ=255) G‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCaa > 1:8074042‑M1/1‑150 (MQ=255) CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAg > 1:2718324‑M1/1‑150 (MQ=255) gggTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtct < 1:758802‑M2/150‑120 (MQ=255) GGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAgg < 2:1138765‑M1/150‑1 (MQ=255) gTAAACCCtgcagggtggcgttttggaggggttttaccggctaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgc < 1:7719656‑M1/150‑143 (MQ=255) gTAAACCCtgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgc > 1:1325920‑M1/1‑8 (MQ=255) gTAAACCCggcacggtcgcctgttggtgggggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgc < 1:3484060‑M1/150‑143 (MQ=255) GTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTc < 2:4584600‑M1/150‑1 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcg < 1:3811733‑M2/150‑123 (MQ=255) tAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcg < 1:5506454‑M2/150‑123 (MQ=255) ACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCt < 1:3224542‑M1/150‑1 (MQ=255) ccctgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgacac > 2:1807470‑M1/1‑3 (MQ=255) cctgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgacacc > 1:7947102‑M1/1‑2 (MQ=255) cctgcacggtcgcctgtaggagcgggtttacccgcgaagaggccgctactgccttacctggccagcaccaccaacttacccacagcctgccgttgccccagcttctcgatagcaaccccggcttctgccagtggataagtctgcgacacc > 2:947979‑M1/1‑2 (MQ=255) CCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCGTCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCg < 1:5286153‑M1/150‑1 (MQ=255) CCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCg < 1:3970683‑M1/150‑1 (MQ=255) | GCCGAGGGCAAGTTGAAGCCGCTGGTGTCGCAGACTTATCCACTGGCAGAAGCCGGGGTTGCTATCGAGAAGCTGGGGCAACGGCAGGCTGTGGGTAAGTTGGTGGTGCTGGCCAGGTAAGGCAGTAGCGGCCTCTTCG‑CGGGTAAACCCGCTCCTACAGGCGACCGTGCAGGGTTTACCCGCGAAGAGGCCGGAACAGGTTGCTCACACTTCGCGCAGATTGTGGCAACGCCTGAATCGCGCTTCCAGGTTGCGATCGGGCATCTGGTGACTGCGCAGTGCATTCAAGGTCTGCTCG > NC_002947/5948478‑5948775 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |