| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 326 total aligned reads displayed.
ACCTGGATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTGGGGCCGCTTTGCATCCCTTCGCGG‑‑AAGCCCGCTCCTACAAGGGCCGCAATGACCTGTGCAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGA > NC_002947/5951943‑5952241 | gcgtatgtggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattga > 1:3937351‑M1/150‑150 (MQ=255)aCCTGGATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCa < 2:3375609/150‑1 (MQ=255)aCCTGGATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCa < 1:2309107/150‑1 (MQ=255) cgtatgtggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgat < 2:6935762‑M1/2‑1 (MQ=255) cgtatgtggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgat > 2:2794846‑M1/149‑150 (MQ=255) cTGGATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCAtt < 2:5223323/150‑1 (MQ=255) tGGATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTg < 2:1598040/150‑1 (MQ=255) ggATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTgg > 2:7069353/1‑150 (MQ=255) tgtggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgATTggg < 2:8074935‑M1/6‑1 (MQ=255) gATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTggg < 1:1200945/150‑1 (MQ=255) gATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTggg < 1:5681903/150‑1 (MQ=255) gtggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgATTgggg < 1:4198495‑M1/7‑1 (MQ=255) tggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgATTGGGGc < 2:1499592‑M1/8‑1 (MQ=255) tggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgATTGGGGc < 2:2689215‑M1/8‑1 (MQ=255) ggattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgATTGGGGcc < 1:3737413‑M1/9‑1 (MQ=255) gcgcTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTGGGGcc < 2:8619822/150‑1 (MQ=255) gattctgcgcaagctgctgcacccgatggacgaaatcgctgccatcgagttcctggtcgacaagctcaagcagaccaagaccaacgatgagttcttcctgtcgatgaagcgcaagtaagcgagcgtttcaggctggattgATTGGGGCCg < 1:7493627‑M1/10‑1 (MQ=255) gcTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTGGGGCCGc > 2:6766122/1‑150 (MQ=255) 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tGCATTGGGGCCGCTTTGCATCCCTTCGCGG‑‑AAGCCCGCTCCTACAAGGGCCGCAATGACCTGTGCAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACa < 1:3633153/150‑1 (MQ=255) ATTGGGGCCGCTTTGCATCCCTTCGCGG‑‑AAGCCCGCTCCTACAAGGGCCGCAATGACCTGTGCAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGga > 1:6637934‑M1/1‑150 (MQ=255) | ACCTGGATGCGCTTGAGCTCGCCGCGCTGTTCCAGGCCACGAATGAAGTCGCGCAAGTCGCGATACTGCATGCAGGAGCCTCGTGTTGGCCGTATCGGTCGGGGTGCAGAGTGTAGCGCCGTTCGGGCCTTGTTTGGGGGTGAAAATGCATTGGGGCCGCTTTGCATCCCTTCGCGG‑‑AAGCCCGCTCCTACAAGGGCCGCAATGACCTGTGCAGGAGCGGGCTTGCCCGCGAAGGGCCGCAAGGCGGCCCCAATCAATCCAGCCTGAAACGCTCGCTTACTTGCGCTTCATCGACAGGA > NC_002947/5951943‑5952241 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |