| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 6060157 | 277 (0.740) | 12 (0.030) | 9/260 | NT | 4.4% | coding (105/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB |
| ? | NC_002947 | = 6060197 | 261 (0.740) | coding (145/732 nt) | tonB | TonB energy transducing system subunit TonB | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 354 total aligned reads displayed.
CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCC > NC_002947/6060008‑6060306 | cTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCA < 1:649682‑M1/150‑1 (MQ=255) aCCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCcaca < 1:1993019/150‑1 (MQ=255) cTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAgg > 2:8619682/1‑150 (MQ=255) gAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGcc < 2:2371039/150‑1 (MQ=255) aaaGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCa < 1:7014184/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATc < 2:4163345/150‑1 (MQ=255) aGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATc < 2:1217392/150‑1 (MQ=255) gTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCt < 2:5474203/150‑1 (MQ=255) tCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTg > 2:6487122/1‑150 (MQ=255) tGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGcc > 2:6128648/1‑150 (MQ=255) ggTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGccc > 1:5719862/1‑150 (MQ=255) gTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGATGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGcccc > 2:4037999/1‑150 (MQ=255) tAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGccccc < 1:1037668/150‑1 (MQ=255) aGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCg < 1:1708176/150‑1 (MQ=255) aGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCg < 1:3427280/150‑1 (MQ=255) ggTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCgg < 2:5203625/150‑1 (MQ=255) gTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGc > 1:3615419/1‑150 (MQ=255) tctcGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACCTGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCa < 2:8239739/150‑1 (MQ=255) 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cTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTg < 1:2645060/150‑1 (MQ=255) cTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTg > 1:6411399/1‑150 (MQ=255) cTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTg < 1:8178362/150‑1 (MQ=255) tCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTgg > 2:2617877/1‑150 (MQ=255) tCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTgg > 1:1855322/1‑150 (MQ=255) tCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTgg > 1:6977506/1‑150 (MQ=255) aaCTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCa > 1:8508025/1‑150 (MQ=255) tGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGaa < 2:1733952/150‑1 (MQ=255) tGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGaa < 1:3067245/150‑1 (MQ=255) gTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgtccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagaacgcgttttc < 1:3787253‑M2/150‑101 (MQ=255) tCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAgcg > 1:598199/1‑150 (MQ=255) cGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCAGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAgcgc < 2:5719862/150‑1 (MQ=255) ggTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcc < 1:2210475/150‑1 (MQ=255) ggTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcc < 1:8288475/150‑1 (MQ=255) gTGCCAgttcgaccatcatcgctgccgggggcagctcgatggcctgtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttacaat > 1:2489381‑M1/1‑6 (MQ=255) gTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatca < 1:1268852‑M2/150‑105 (MQ=255) gCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 1:1164121/150‑1 (MQ=255) gCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaa < 1:664121/150‑1 (MQ=255) ccACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaag > 2:5885782/1‑150 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACtggcaccgaccagttgagcgtcagcagcacggcgaccacgtgcacacccagcacgatcgccaggctgccaccgtagcgcgccatgttagagcgcgttttcatcatttct < 2:6564306‑M2/150‑110 (MQ=255) acaGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCgcccaagcc > 1:771631/1‑150 (MQ=255) | CTACCTGAAAGTCGGTCTGGTAGGTCTCGAGACGGCAGCCAAGAAATGATGAAAACGCGCTCTAACATGGCGCGCTACGGTGGCAGCCTGGCGATCGTGCTGGGTGTGCACGTGGTCGCCGTGCTGCTGACGCTCAACTGGTCGGTGCCACAGGCCATCGAGCTGCCCCCGGCAGCGATGATGGTCGAACTGGCACCGTTGCCGGAGCCTGCGCCACCACCACCCCCAAAGGCAGCTCCGCAGCCACCGGCCCCGGTCGAGGAACCACCGTTGCCGAAGCTGGCAGAAGCGCCCAAGCC > NC_002947/6060008‑6060306 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |